19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0810 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0810  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
65 aa  131  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.267524  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2976  4-oxalocrotonate tautomerase  59.68 
 
 
62 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.854525 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1743  4-oxalocrotonate tautomerase  38.98 
 
 
64 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0439637  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0719  4-oxalocrotonate tautomerase  40.35 
 
 
64 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.5068  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0159  4-oxalocrotonate tautomerase  40.35 
 
 
64 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0523793 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5861  4-oxalocrotonate tautomerase  41.67 
 
 
64 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.314351 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0009  4-oxalocrotonate tautomerase  39.66 
 
 
63 aa  48.5  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.235995  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1542  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000358699  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1510  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.258565  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4605  4-oxalocrotonate tautomerase  38.1 
 
 
71 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0959  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.92 
 
 
69 aa  45.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3030  4-oxalocrotonate tautomerase  28.57 
 
 
67 aa  44.7  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0079  putative 4-oxalocrotonate tautomerase  36.84 
 
 
62 aa  45.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000137411  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1332  4-oxalocrotonate tautomerase  29.51 
 
 
71 aa  44.3  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000185416  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0226  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40.98 
 
 
68 aa  43.9  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00511525  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1991  4-oxalocrotonate tautomerase  31.15 
 
 
61 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.956857  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2466  4-oxalocrotonate tautomerase  33.9 
 
 
61 aa  41.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1055  4-oxalocrotonate tautomerase  28.81 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6264  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 
63 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113457  normal  0.380962 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>