19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1082 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1082  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 		 62 aa  126  8.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.121221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4605  4-oxalocrotonate tautomerase  40.32 
 
 		 71 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0959  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  41.67 
 
 		 69 aa  52.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0020  4-oxalocrotonate tautomerase  38.6 
 
 		 61 aa  52  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2185  4-oxalocrotonate tautomerase  40.35 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3323  hypothetical protein  38.18 
 
 		 71 aa  44.7  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2976  4-oxalocrotonate tautomerase  42.55 
 
 		 62 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.854525 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6066  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.33 
 
 		 61 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.633472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6046  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.33 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153664  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0804  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0078  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  43.86 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678819  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0807  4-oxalocrotonate tautomerase  40.35 
 
 		 62 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.986407  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1809  4-oxalocrotonate tautomerase  42.11 
 
 		 63 aa  41.2  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105316  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  38.6 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.457407  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1637  4-oxalocrotonate tautomerase  37.1 
 
 		 62 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.727526  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0753  4-oxalocrotonate tautomerase  38.6 
 
 		 62 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.293685 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0823  4-oxalocrotonate tautomerase  38.6 
 
 		 62 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.371089  normal  0.237608 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0325  4-oxalocrotonate tautomerase  38.71 
 
 		 62 aa  40  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0336  4-oxalocrotonate tautomerase  38.71 
 
 		 62 aa  40  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.796496 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>