219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4020 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4020  K potassium transporter  100 
 
 
640 aa  1271    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0241257  normal  0.195504 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2539  K+ potassium transporter  59.32 
 
 
625 aa  725    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4252  K+ potassium transporter  58.56 
 
 
641 aa  704    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3762  K potassium transporter  60.86 
 
 
650 aa  718    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4582  K+ potassium transporter  50.48 
 
 
622 aa  619  1e-176  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1253  K+ potassium transporter  51.12 
 
 
622 aa  608  1e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22459  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3749  K+ potassium transporter  48.96 
 
 
622 aa  599  1e-170  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4541  K+ potassium transporter  49.6 
 
 
622 aa  595  1e-169  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0427  K potassium transporter  49.68 
 
 
639 aa  596  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.215652  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3517  K potassium transporter  49.36 
 
 
628 aa  593  1e-168  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00569528 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5996  K potassium transporter  49.6 
 
 
627 aa  593  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106648  hitchhiker  0.00272836 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0764  K+ potassium transporter  49.19 
 
 
622 aa  591  1e-167  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.44581  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0174  potassium uptake protein  49.2 
 
 
628 aa  589  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.506892 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3258  K potassium transporter  49.6 
 
 
622 aa  587  1e-166  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0402943  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3909  K+ potassium transporter  49.6 
 
 
622 aa  587  1e-166  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000284388  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3556  K+ potassium transporter  48.24 
 
 
626 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0201  K+ potassium transporter  49.68 
 
 
632 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4723  K potassium transporter  50.41 
 
 
640 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0485791 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6716  K potassium transporter  50.4 
 
 
641 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19104  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2065  potassium uptake protein  49.45 
 
 
624 aa  560  1e-158  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0485  K+ potassium transporter  48.37 
 
 
630 aa  554  1e-156  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1231  K+ potassium transporter  48.3 
 
 
656 aa  551  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0916765  normal  0.143534 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1184  K+ potassium transporter  46.53 
 
 
621 aa  551  1e-155  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1334  K+ potassium transporter  47.65 
 
 
636 aa  549  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.508351  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1463  K+ potassium transporter  45.48 
 
 
647 aa  547  1e-154  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.954899  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2102  K+ potassium transporter  45.81 
 
 
630 aa  545  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3125  K potassium transporter  47.97 
 
 
639 aa  543  1e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2932  K+ potassium transporter  46.91 
 
 
620 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00598935  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5005  K potassium transporter  47.55 
 
 
647 aa  540  9.999999999999999e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00761853  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3512  Kup family low affinity potassium transporter  46.42 
 
 
632 aa  540  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3417  K potassium transporter  45.57 
 
 
634 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120836  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1621  potassium uptake transmembrane protein  48.1 
 
 
633 aa  536  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2247  potassium uptake protein  46.78 
 
 
660 aa  535  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438776  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2512  K+ potassium transporter  46.42 
 
 
620 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201429  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1856  K+ potassium transporter  46.62 
 
 
620 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1598  K potassium transporter  48 
 
 
633 aa  536  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.364539  normal  0.357667 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1926  K potassium transporter  48.16 
 
 
633 aa  536  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0406918  normal  0.0407314 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1753  potassium uptake protein  47.17 
 
 
644 aa  533  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.909141  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1331  potassium uptake protein  46.78 
 
 
630 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00641911  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2341  kup system potassium uptake protein  46.62 
 
 
660 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.357755  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1407  K potassium transporter  45.5 
 
 
628 aa  533  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.196511  decreased coverage  0.0000000731332 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0508  K potassium transporter  42.75 
 
 
632 aa  532  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.845054  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1820  potassium uptake protein  46.78 
 
 
630 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0076  potassium uptake protein  46.78 
 
 
630 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.210813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2175  potassium uptake protein  46.62 
 
 
630 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2213  potassium uptake protein  46.62 
 
 
630 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1092  potassium uptake protein  46.78 
 
 
622 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0884975  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0006  potassium transport protein Kup  45.25 
 
 
622 aa  529  1e-149  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0580063  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3993  potassium uptake protein  45.1 
 
 
631 aa  530  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1394  K+ potassium transporter  46.68 
 
 
631 aa  531  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.886731  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0572  K potassium transporter  46.78 
 
 
620 aa  531  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1608  KUP family K(+) transporter  45.92 
 
 
628 aa  529  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.191618 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4211  potassium transport protein Kup  45.25 
 
 
622 aa  531  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6870  K potassium transporter  46.55 
 
 
633 aa  531  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2528  K potassium transporter  45.67 
 
 
628 aa  528  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00494923  hitchhiker  0.0000000660434 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3513  Kup family low affinity potassium transporter  46.85 
 
 
640 aa  528  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0943  K potassium transporter  45.04 
 
 
634 aa  530  1e-149  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0629  K potassium transporter  45.54 
 
 
664 aa  530  1e-149  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0514546 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3436  K potassium transporter  46.25 
 
 
620 aa  532  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0006  potassium transport protein Kup  45.25 
 
 
622 aa  531  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0279816  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03631  potassium transporter  44.61 
 
 
622 aa  528  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4220  potassium uptake protein  44.61 
 
 
622 aa  528  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4263  potassium transport protein Kup  44.61 
 
 
622 aa  528  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.704108  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4532  potassium transport protein Kup  44.93 
 
 
622 aa  527  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.336747  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1062  potassium uptake protein  44.88 
 
 
634 aa  526  1e-148  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2507  K potassium transporter  47.81 
 
 
614 aa  526  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0551  K potassium transporter  42.74 
 
 
632 aa  527  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.861026  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24540  potassium uptake protein  48.88 
 
 
632 aa  528  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.465778  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1857  K potassium transporter  42.74 
 
 
637 aa  528  1e-148  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000427943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03575  hypothetical protein  44.61 
 
 
622 aa  528  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4247  potassium transport protein Kup  44.61 
 
 
622 aa  528  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2692  K+ potassium transporter  45.34 
 
 
634 aa  527  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0189185  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3963  potassium transport protein Kup  44.61 
 
 
622 aa  528  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1777  K+ potassium transporter  44.66 
 
 
637 aa  527  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150032  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4115  potassium transport protein Kup  44.61 
 
 
622 aa  528  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.133962 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4117  potassium transport protein Kup  45.25 
 
 
622 aa  527  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0495643 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4173  potassium transport protein Kup  44.61 
 
 
622 aa  528  1e-148  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4242  potassium transport protein Kup  44.93 
 
 
622 aa  528  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01558  potassium uptake protein  48.29 
 
 
614 aa  525  1e-147  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.509274  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4902  potassium transport protein Kup  45.12 
 
 
622 aa  523  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  hitchhiker  0.000280995 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3979  potassium transport protein Kup  45.25 
 
 
622 aa  524  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.356267  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1475  K potassium transporter  46.78 
 
 
638 aa  522  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.765149  normal  0.163846 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5183  potassium transport protein Kup  44.44 
 
 
622 aa  525  1e-147  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.594597 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4092  potassium transport protein Kup  45.09 
 
 
622 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4272  potassium transport protein Kup  45.09 
 
 
622 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.461844  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1823  K potassium transporter  45.71 
 
 
638 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0350815  normal  0.623135 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4213  potassium transport protein Kup  45.09 
 
 
622 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.681675  normal  0.819116 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4179  potassium transport protein Kup  45.73 
 
 
622 aa  521  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.418392  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5868  K potassium transporter  44.48 
 
 
633 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5940  K potassium transporter  44.9 
 
 
633 aa  521  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0821691  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4107  potassium transport protein Kup  45.09 
 
 
622 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.382302  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1799  K+ potassium transporter  45.71 
 
 
638 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1808  K+ potassium transporter  41.63 
 
 
661 aa  519  1e-146  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223984  normal  0.703155 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0444  K potassium transporter  44.79 
 
 
630 aa  521  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0753432 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5357  K potassium transporter  45.47 
 
 
656 aa  519  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00124872  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4163  potassium transport protein Kup  45.09 
 
 
622 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.134372  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5100  K+ transporter  45.24 
 
 
638 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6280  K+ potassium transporter  45.71 
 
 
688 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1737  K+ potassium transporter  46.46 
 
 
637 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1710  K potassium transporter  46.87 
 
 
637 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00353606  normal  0.989137 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>