More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4398 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4398  Transketolase central region  100 
 
 		 325 aa  643    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3160  Transketolase central region  53.4 
 
 		 325 aa  363  2e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3318  Transketolase central region  53.14 
 
 		 320 aa  359  3e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0903  Transketolase central region  55.35 
 
 		 325 aa  346  3e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.700297  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0824  Transketolase central region  53.73 
 
 		 326 aa  345  8e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.862556  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3596  Transketolase central region  52.37 
 
 		 342 aa  340  2.9999999999999998e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0140  Transketolase central region  54.18 
 
 		 328 aa  336  2.9999999999999997e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1667  Transketolase central region  52.32 
 
 		 336 aa  335  7e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0456  Transketolase central region  52.08 
 
 		 326 aa  334  1e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1966  Transketolase central region  54.15 
 
 		 326 aa  333  2e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2510  transketolase-like  52.83 
 
 		 320 aa  328  8e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.703307 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3895  Transketolase central region  53.77 
 
 		 346 aa  328  9e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327711  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0826  Transketolase central region  51.11 
 
 		 327 aa  327  1.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0460  Transketolase central region  53.14 
 
 		 320 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4133  putative puryvate dehydrogenase E1 component subunit beta  51.38 
 
 		 326 aa  323  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0398811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0476  Transketolase central region  51.89 
 
 		 320 aa  322  7e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000162173 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1516  Transketolase central region  52.34 
 
 		 332 aa  319  3e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.349052 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2655  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  52.94 
 
 		 320 aa  319  3e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1516  hypothetical protein  47.99 
 
 		 324 aa  319  3.9999999999999996e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1467  hypothetical protein  48.3 
 
 		 324 aa  319  3.9999999999999996e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  49.23 
 
 		 324 aa  318  9e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  49.23 
 
 		 324 aa  318  9e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1562  transketolase, central region  53.11 
 
 		 334 aa  318  1e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.386983  normal  0.558748 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1851  Transketolase central region  52.02 
 
 		 335 aa  318  1e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.60983  normal  0.722452 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0681  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  48.61 
 
 		 325 aa  317  2e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  48.92 
 
 		 324 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01955  2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, eukaryotic type, beta subunit  48.15 
 
 		 325 aa  317  2e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3108  transketolase, central region  51.71 
 
 		 326 aa  317  2e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4977  transketolase, central region:transketolase, C-terminal  50.46 
 
 		 325 aa  317  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  50.15 
 
 		 324 aa  316  3e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2647  transketolase, central region  50.15 
 
 		 326 aa  316  4e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1434  transketolase  50.46 
 
 		 326 aa  315  6e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0675  Transketolase central region  53.82 
 
 		 327 aa  315  6e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.045738  normal  0.242923 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2592  transketolase central region  46.93 
 
 		 327 aa  314  9.999999999999999e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0753  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, beta subunit  45.82 
 
 		 326 aa  313  3.9999999999999997e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.102585  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0650  pyruvate dehydrogenase E1 component beta subunit  45.82 
 
 		 326 aa  312  3.9999999999999997e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2192  Transketolase central region  54.55 
 
 		 323 aa  311  7.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.975669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3377  Transketolase central region  50 
 
 		 326 aa  311  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.442122  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2673  transketolase central region  47.53 
 
 		 325 aa  310  2e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000190408  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1833  Transketolase central region  48.77 
 
 		 325 aa  310  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0953  Transketolase central region  47.84 
 
 		 325 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0238  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  52 
 
 		 326 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.26153  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1583  2-oxoisovalerate dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  47.65 
 
 		 325 aa  308  1.0000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2852  Transketolase central region  48.77 
 
 		 331 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3986  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  47.53 
 
 		 325 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4020  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  47.53 
 
 		 325 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3882  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  47.53 
 
 		 325 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519915  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3714  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  47.53 
 
 		 325 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3730  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  47.53 
 
 		 325 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4183  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  47.53 
 
 		 325 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2899  transketolase, central region  50.91 
 
 		 320 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4090  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  47.53 
 
 		 325 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000784297  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4074  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  47.53 
 
 		 325 aa  306  3e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1166  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  47.53 
 
 		 325 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.655374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3798  transketolase central region  47.53 
 
 		 325 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11122  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3747  Transketolase central region  50.64 
 
 		 355 aa  305  6e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1176  transketolase domain-containing protein  46.13 
 
 		 325 aa  305  8.000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.210987  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1154  transketolase domain-containing protein  46.13 
 
 		 325 aa  305  8.000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.113033  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2027  transketolase, central region  47.2 
 
 		 325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0248675  hitchhiker  0.0000129585 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1948  transketolase, central region  47.2 
 
 		 325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.858675  decreased coverage  0.000302013 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2130  transketolase, central region  47.2 
 
 		 325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.88258  hitchhiker  0.000129918 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2150  transketolase central region  47.83 
 
 		 325 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00434594  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6076  transketolase central region  49.85 
 
 		 326 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.507877  normal  0.0309873 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2200  transketolase central region  47.52 
 
 		 325 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.670418  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4507  hypothetical protein  47.52 
 
 		 325 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2234  Transketolase central region  47.52 
 
 		 325 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0388155  hitchhiker  0.0000275487 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2221  transketolase central region  47.52 
 
 		 325 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188148  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0094  Transketolase central region  45.85 
 
 		 328 aa  302  5.000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1886  transketolase, central region  47.83 
 
 		 325 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2037  transketolase, central region  46.42 
 
 		 325 aa  301  1e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2340  alpha keto acid dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  46.58 
 
 		 325 aa  299  3e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1135  Transketolase central region  48.61 
 
 		 324 aa  298  6e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.323286  normal  0.423895 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0266  Transketolase central region  46.3 
 
 		 327 aa  298  8e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1710  putative pyruvate dehydrogenase E1 component, beta chain  48.3 
 
 		 333 aa  297  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1381  transketolase, central region  46.11 
 
 		 325 aa  298  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0848887  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2304  Transketolase central region  45.99 
 
 		 327 aa  297  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1926  transketolase, central region  45.06 
 
 		 325 aa  296  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106606 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19910  putative pyruvate dehydrogenase E1 component, beta chain  48.3 
 
 		 333 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.045452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2793  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  51.26 
 
 		 702 aa  294  1e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1936  transketolase, central region  44.1 
 
 		 325 aa  294  1e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208007  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2245  transketolase central region  44.41 
 
 		 325 aa  293  2e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.38248  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2855  transketolase central region  47.22 
 
 		 327 aa  294  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0963  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  46.91 
 
 		 327 aa  292  4e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.897177  normal  0.0354317 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2096  Transketolase central region  46.91 
 
 		 327 aa  292  6e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4291  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  46.3 
 
 		 327 aa  292  7e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000939544  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4233  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  46.3 
 
 		 327 aa  292  7e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4066  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase subunit beta  46.3 
 
 		 327 aa  292  7e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0625977  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3904  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit (2-oxoisovalerate dehydrogenase, beta subunit)  46.3 
 
 		 327 aa  292  7e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.522905  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3913  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit (2-oxoisovalerate dehydrogenase, beta subunit)  46.3 
 
 		 327 aa  292  7e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0083543  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4383  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase subunit beta  46.3 
 
 		 327 aa  292  7e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0906911  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4181  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  46.3 
 
 		 327 aa  292  7e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000134341 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2279  transketolase central region  44.1 
 
 		 325 aa  291  8e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0946351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2321  Transketolase central region  47.99 
 
 		 324 aa  291  1e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4002  transketolase central region  46.6 
 
 		 327 aa  291  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.020695  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4271  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  46.6 
 
 		 327 aa  291  1e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2328  transketolase, central region  44.41 
 
 		 325 aa  290  3e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3246  transketolase, central region  46.58 
 
 		 334 aa  290  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2144  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  44.64 
 
 		 341 aa  290  3e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.869205 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0705  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  43.99 
 
 		 337 aa  290  3e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.346311  normal  0.842188 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1710  alpha keto acid dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  45.03 
 
 		 325 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0237639 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>