More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3246 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3246  recA protein  100 
 
 
360 aa  733    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0979902 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  66.98 
 
 
378 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  65.88 
 
 
357 aa  464  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  65.07 
 
 
357 aa  459  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0653  recA protein  63.3 
 
 
346 aa  454  1e-127  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  65.53 
 
 
348 aa  457  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  64.39 
 
 
345 aa  454  1e-127  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  64.89 
 
 
341 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2216  RecA protein  65.96 
 
 
366 aa  453  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.139784 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  65.94 
 
 
344 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  64.8 
 
 
352 aa  451  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  64.55 
 
 
350 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  63.1 
 
 
346 aa  448  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  64.92 
 
 
364 aa  449  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  64.67 
 
 
347 aa  450  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  63.13 
 
 
347 aa  450  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  65.12 
 
 
359 aa  450  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  64.62 
 
 
365 aa  449  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  61.54 
 
 
357 aa  449  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  64.89 
 
 
364 aa  450  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  62.39 
 
 
347 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  64.8 
 
 
352 aa  450  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  62.39 
 
 
347 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  64.58 
 
 
346 aa  448  1e-125  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  63.66 
 
 
368 aa  449  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0597  recombinase A  63.36 
 
 
356 aa  449  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408398  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  62.39 
 
 
347 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  64.51 
 
 
376 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  64.46 
 
 
383 aa  445  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  62.31 
 
 
355 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  62.13 
 
 
343 aa  445  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  62.21 
 
 
352 aa  444  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  61.08 
 
 
367 aa  445  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03079  recombinase A  64.05 
 
 
348 aa  444  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.353429  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  63.94 
 
 
350 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  64.88 
 
 
347 aa  447  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  64.49 
 
 
390 aa  444  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  62.09 
 
 
345 aa  443  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0387  recA protein  67.54 
 
 
347 aa  444  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  62.79 
 
 
348 aa  442  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  62.1 
 
 
350 aa  442  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  62.09 
 
 
350 aa  441  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4080  recombinase A  62.31 
 
 
361 aa  443  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0074  recA protein  63.03 
 
 
344 aa  442  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  63.92 
 
 
355 aa  442  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  62.68 
 
 
345 aa  442  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  62.46 
 
 
361 aa  442  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  62.57 
 
 
345 aa  443  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  62.06 
 
 
350 aa  443  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  62.97 
 
 
350 aa  440  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  63.16 
 
 
348 aa  439  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  63.16 
 
 
348 aa  439  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  64.09 
 
 
342 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  62.99 
 
 
343 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  61.93 
 
 
366 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1288  recombinase A  63.58 
 
 
348 aa  439  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  64.86 
 
 
347 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  61.68 
 
 
379 aa  440  9.999999999999999e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07230  protein RecA  63.08 
 
 
351 aa  439  9.999999999999999e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.533016  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  62.61 
 
 
379 aa  440  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1619  recA protein  65.37 
 
 
352 aa  439  9.999999999999999e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177143  hitchhiker  0.0000000069085 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  62.15 
 
 
424 aa  438  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1747  recombinase A  62.65 
 
 
351 aa  438  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000101073  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4108  recA protein  60.58 
 
 
358 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.633837  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4134  recA protein  63.64 
 
 
345 aa  435  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00773385  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  62.15 
 
 
361 aa  437  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  58.86 
 
 
362 aa  436  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  61.68 
 
 
347 aa  436  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07480  RecA protein  62.38 
 
 
352 aa  436  1e-121  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0526583  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4075  recA protein  60.58 
 
 
358 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0711  recombinase A  62.42 
 
 
345 aa  437  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10720  protein RecA  62.81 
 
 
361 aa  437  1e-121  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000907009  unclonable  0.00000000149755 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  61.6 
 
 
345 aa  437  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  63.29 
 
 
360 aa  435  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  61.6 
 
 
345 aa  437  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  63.78 
 
 
348 aa  435  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  63.78 
 
 
348 aa  434  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4183  recA protein  63.89 
 
 
349 aa  436  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  0.191355 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1492  recA protein  62.84 
 
 
348 aa  436  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.148956 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  60.69 
 
 
365 aa  432  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2094  recombinase A  61.13 
 
 
365 aa  434  1e-120  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  62.23 
 
 
364 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  60.73 
 
 
358 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  61.92 
 
 
362 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  61.33 
 
 
341 aa  431  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  61.3 
 
 
347 aa  431  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  61.09 
 
 
338 aa  434  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  61.09 
 
 
338 aa  434  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  61.92 
 
 
363 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  62.23 
 
 
363 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0843  recA protein  65.74 
 
 
345 aa  432  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0727  recombinase A  63.92 
 
 
347 aa  434  1e-120  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.794192  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  61.68 
 
 
343 aa  430  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  61.3 
 
 
362 aa  431  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  61.3 
 
 
364 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  62.73 
 
 
346 aa  429  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  61.92 
 
 
363 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  61.56 
 
 
362 aa  431  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2014  recombinase A  60.36 
 
 
352 aa  429  1e-119  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.306298 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1462  recombinase A  60.98 
 
 
352 aa  431  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000631927 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>