More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2237 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2237  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
316 aa  601  1.0000000000000001e-171  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.804155  normal  0.543943 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.37 
 
 
316 aa  333  3e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6176  ABC transporter, permease  52.9 
 
 
316 aa  300  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5710  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.32 
 
 
313 aa  297  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.50651  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4849  ABC transporter, permease  53.25 
 
 
310 aa  286  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.315179  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3342  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.58 
 
 
322 aa  221  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0522559 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1080  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.78 
 
 
307 aa  202  7e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.810626  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.05 
 
 
318 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.823001  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.66 
 
 
308 aa  196  6e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.83 
 
 
313 aa  196  6e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.94 
 
 
318 aa  195  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4598  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.33 
 
 
319 aa  194  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.930375  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
321 aa  194  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
320 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.766968 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
320 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.18 
 
 
307 aa  194  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.801835  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0752  ABC transporter, permease  39.17 
 
 
320 aa  193  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40221  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2003  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 
315 aa  192  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.872908 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.31 
 
 
315 aa  191  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.24032  normal  0.535319 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5266  ABC transporter, permease  43.06 
 
 
314 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  0.0554838 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.81 
 
 
313 aa  189  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.06 
 
 
313 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000789572  normal  0.0157107 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.06 
 
 
313 aa  189  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348462  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4686  alkaline phosphatase  37.58 
 
 
307 aa  189  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0426131  normal  0.374964 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.24 
 
 
313 aa  189  7e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.44 
 
 
314 aa  189  7e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.04 
 
 
334 aa  188  9e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.143224 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.39 
 
 
324 aa  187  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.781235  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.59 
 
 
313 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.06 
 
 
313 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000799384  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
323 aa  185  9e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.85 
 
 
314 aa  185  9e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0980  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.34 
 
 
313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0910692  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.97 
 
 
313 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.18227  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0238  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.82 
 
 
311 aa  185  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.82352 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.54 
 
 
306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.579769  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.93 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.932563 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.68 
 
 
317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.650589  normal  0.092891 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5166  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.06 
 
 
311 aa  184  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.627946 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5088  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  39.49 
 
 
313 aa  183  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.44 
 
 
334 aa  184  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.67 
 
 
314 aa  183  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.965219  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  32.34 
 
 
336 aa  183  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1411  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
319 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.32 
 
 
313 aa  182  7e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0942  nickel-transporting ATPase  34.82 
 
 
305 aa  182  7e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.541988  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.93 
 
 
334 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6075  nickel transporter permease NikB  37.38 
 
 
319 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5437  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.88 
 
 
355 aa  182  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5256  putative ABC transporter (permease protein)  35.44 
 
 
313 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.132635 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02948  oligopeptide transporter permease  33.23 
 
 
306 aa  181  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5642  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  38.49 
 
 
316 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0251003  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0384  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
319 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2471  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.94 
 
 
313 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.43 
 
 
333 aa  181  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2700  oligopeptide transporter permease  35.78 
 
 
306 aa  180  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0475614  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.75 
 
 
312 aa  180  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.882657  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.13 
 
 
313 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1582  oligopeptide transporter permease  35.14 
 
 
306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.733786  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1936  oligopeptide transporter permease  35.14 
 
 
306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.164891 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1400  oligopeptide transporter permease  35.14 
 
 
306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6476  putative oligopeptide ABC transporter (permease protein)  40.32 
 
 
316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.348696  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1873  oligopeptide transporter permease  35.14 
 
 
306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.741835  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.65 
 
 
320 aa  179  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0617346  normal  0.17443 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.7 
 
 
311 aa  179  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.166982  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1879  oligopeptide transporter permease  35.14 
 
 
306 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.675854 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00798  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  34.41 
 
 
306 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.41 
 
 
306 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
314 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0845824 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  34.41 
 
 
306 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.41 
 
 
306 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0856  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  34.41 
 
 
306 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00815  hypothetical protein  34.41 
 
 
306 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.558182  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0889  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  34.41 
 
 
306 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.952014  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.66 
 
 
313 aa  179  7e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5358  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  33.97 
 
 
315 aa  179  8e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1224  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.59 
 
 
313 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8180  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  36.94 
 
 
313 aa  179  8e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.119694  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0388  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.18 
 
 
315 aa  178  9e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0122947  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1092  peptide ABC transporter, permease protein, putative  37.66 
 
 
314 aa  178  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.16 
 
 
313 aa  178  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.380096  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.93 
 
 
335 aa  178  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.948745  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0984  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.11 
 
 
313 aa  178  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422815  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2287  oligopeptide transporter permease  34.19 
 
 
306 aa  178  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0289151  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_931  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  34.19 
 
 
305 aa  178  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.541229  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0982  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  34.41 
 
 
306 aa  178  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.39 
 
 
334 aa  177  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1986  oligopeptide transporter permease  33.87 
 
 
306 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.879407  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0753  nickel transporter permease NikB  35.11 
 
 
314 aa  177  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0503  ABC transporter permease protein  37.38 
 
 
311 aa  177  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0022  alkaline phosphatase  32.69 
 
 
306 aa  177  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.05 
 
 
327 aa  176  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.395027  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2301  oligopeptide transporter permease  34.19 
 
 
306 aa  177  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0610  oligopeptide transporter permease  31.09 
 
 
306 aa  176  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.83 
 
 
334 aa  176  4e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.05 
 
 
327 aa  176  4e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0558864 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6467  putative oligopeptide ABC transporter (permease protein)  38.87 
 
 
309 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0779  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.85 
 
 
313 aa  176  5e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002960  oligopeptide transport system permease protein OppB  32.41 
 
 
291 aa  176  6e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4215  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.92 
 
 
315 aa  176  6e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>