More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4849 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4849  ABC transporter, permease  100 
 
 
310 aa  598  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.315179  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6176  ABC transporter, permease  53.57 
 
 
316 aa  313  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.31 
 
 
316 aa  303  3.0000000000000004e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5710  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.85 
 
 
313 aa  290  3e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.50651  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2237  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.25 
 
 
316 aa  282  6.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.804155  normal  0.543943 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4215  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.21 
 
 
315 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0752  ABC transporter, permease  45.42 
 
 
320 aa  245  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40221  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4538  peptide ABC transporter, permease protein  40.26 
 
 
315 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5266  ABC transporter, permease  46.73 
 
 
314 aa  229  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  0.0554838 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.05 
 
 
313 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.26 
 
 
315 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.24032  normal  0.535319 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.45 
 
 
313 aa  220  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.380096  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3251  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  39.94 
 
 
312 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.177339  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0238  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.97 
 
 
311 aa  219  5e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.82352 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.61 
 
 
312 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.794004  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3342  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.02 
 
 
322 aa  217  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0522559 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0432  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.26 
 
 
313 aa  218  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.91 
 
 
313 aa  217  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5642  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  41.18 
 
 
316 aa  216  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0251003  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.89 
 
 
318 aa  216  5e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.823001  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1080  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.72 
 
 
307 aa  215  9e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.810626  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.39 
 
 
308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.79 
 
 
334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.61 
 
 
313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.01 
 
 
313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.96 
 
 
312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.856468 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
317 aa  213  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.650589  normal  0.092891 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.64 
 
 
312 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.732123 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3926  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.19 
 
 
313 aa  210  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18831  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5088  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  39.35 
 
 
313 aa  210  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0980  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.68 
 
 
313 aa  210  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0910692  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.91 
 
 
315 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.53 
 
 
314 aa  209  7e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.77 
 
 
313 aa  209  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000789572  normal  0.0157107 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 
313 aa  207  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348462  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.45 
 
 
313 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000799384  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.97 
 
 
311 aa  206  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0942  nickel-transporting ATPase  37.66 
 
 
305 aa  206  3e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.541988  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.85 
 
 
316 aa  206  3e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00798  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  37.58 
 
 
306 aa  206  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.58 
 
 
306 aa  206  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00815  hypothetical protein  37.58 
 
 
306 aa  206  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.558182  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_931  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  37.99 
 
 
305 aa  206  4e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.541229  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0856  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  37.58 
 
 
306 aa  206  4e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0889  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  37.58 
 
 
306 aa  206  4e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.952014  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  37.58 
 
 
306 aa  206  4e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.58 
 
 
306 aa  206  4e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.03 
 
 
312 aa  206  4e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.882657  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.84 
 
 
334 aa  205  7e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5166  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.06 
 
 
311 aa  205  7e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.627946 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.56 
 
 
313 aa  204  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5121  putative ABC transporter permease protein  39.32 
 
 
298 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.407731 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0982  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  37.25 
 
 
306 aa  204  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.32 
 
 
335 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.205321  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.83 
 
 
313 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.98 
 
 
313 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.18227  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0980  glutathione ABC transporter permease  37.58 
 
 
306 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0951  glutathione ABC transporter permease  37.58 
 
 
306 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.258662  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0891  glutathione ABC transporter, permease protein  37.86 
 
 
306 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.976092  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1001  glutathione ABC transporter permease  37.86 
 
 
306 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.93 
 
 
311 aa  202  6e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2517  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  37.25 
 
 
306 aa  202  6e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503163  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.44 
 
 
340 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.19 
 
 
313 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0918  inner membrane ABC transporter permease protein YddR  37.25 
 
 
306 aa  201  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0779  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
313 aa  201  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.29 
 
 
318 aa  201  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.74 
 
 
314 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0845824 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.22 
 
 
327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0558864 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.63 
 
 
306 aa  200  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.579769  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0644  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.92 
 
 
314 aa  200  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3257  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  37.79 
 
 
306 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.22 
 
 
327 aa  200  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.395027  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2849  ABC transporter permease protein  35.69 
 
 
313 aa  199  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
306 aa  199  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0078  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.44 
 
 
315 aa  199  6e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.98 
 
 
308 aa  199  7e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311261  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.38 
 
 
317 aa  198  9e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8312  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  40.06 
 
 
317 aa  198  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.577715  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1931  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.51 
 
 
340 aa  198  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.284622  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.01 
 
 
306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.91 
 
 
306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.81 
 
 
316 aa  196  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.00000000419237  n/a   
 
 
 
NC_009429  Rsph17025_3276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.819891  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.25 
 
 
306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.79 
 
 
340 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.14 
 
 
318 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.77 
 
 
307 aa  196  5.000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.801835  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19550  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  39.94 
 
 
336 aa  196  5.000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1224  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.3 
 
 
313 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.65 
 
 
313 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.932563 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.33 
 
 
313 aa  196  6e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00533013  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.88 
 
 
315 aa  195  9e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2869  transmembrane dipeptide transport system permease ABC transporter protein  39.24 
 
 
325 aa  194  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0598671  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.1 
 
 
314 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.965219  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0253  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter permease  35.39 
 
 
308 aa  194  1e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0169931  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5256  putative ABC transporter (permease protein)  36.89 
 
 
313 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.132635 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
326 aa  195  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.844486 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3004  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.6 
 
 
306 aa  193  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0984  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.57 
 
 
313 aa  194  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>