More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2044 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2044  cytochrome c assembly protein  100 
 
 		 264 aa  529  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.15181  normal  0.240775 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1808  cytochrome c assembly protein  69.47 
 
 		 265 aa  376  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1844  cytochrome c assembly protein  74.72 
 
 		 266 aa  369  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2776  cytochrome c assembly protein  67.18 
 
 		 265 aa  357  9e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.638359  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0653  cytochrome c assembly protein  68.42 
 
 		 266 aa  352  2.9999999999999997e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0399  cytochrome c assembly protein  71.21 
 
 		 266 aa  343  2e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0598105  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1574  cytochrome c biogenesis protein  67.8 
 
 		 265 aa  325  5e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0338041 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1681  cytochrome c biogenesis protein  65.9 
 
 		 265 aa  318  7.999999999999999e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.228999  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1103  cytochrome c assembly protein  47.08 
 
 		 264 aa  230  2e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1817  hypothetical protein  41.78 
 
 		 271 aa  187  2e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0861  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  37.83 
 
 		 285 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0813  cytochrome c assembly protein  37.39 
 
 		 285 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.444267  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0865  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  37.83 
 
 		 285 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  34.72 
 
 		 278 aa  124  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  31.95 
 
 		 283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1894  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  37.44 
 
 		 272 aa  108  7.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.29708  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.73 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  29.55 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.68 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.93 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.18 
 
 		 282 aa  107  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0447  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.17 
 
 		 321 aa  106  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.97 
 
 		 284 aa  105  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.36 
 
 		 282 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.39 
 
 		 283 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4515  cytochrome c assembly protein  41.51 
 
 		 330 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.48 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4095  cytochrome c assembly protein  40.88 
 
 		 325 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.16923  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0272  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  37.76 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2075  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  44.29 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  26.44 
 
 		 284 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  30.4 
 
 		 271 aa  99  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  28.29 
 
 		 284 aa  99  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0091  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.51 
 
 		 454 aa  98.6  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08251  putative heme transporter  37.43 
 
 		 309 aa  98.6  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379611  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0773  putative heme transporter  37.43 
 
 		 309 aa  98.2  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.694231  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07230  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.9 
 
 		 340 aa  97.8  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1519  cytochrome c assembly protein  40.13 
 
 		 255 aa  98.2  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08271  putative heme transporter  37.43 
 
 		 309 aa  97.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.958198  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0524  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.82 
 
 		 301 aa  97.1  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389658 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  40.12 
 
 		 276 aa  97.4  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2916  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.26 
 
 		 395 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652315  hitchhiker  0.00362581 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3263  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.18 
 
 		 395 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0824  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  39.02 
 
 		 357 aa  97.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.341691  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2985  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  32.72 
 
 		 395 aa  96.3  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1528  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.57 
 
 		 394 aa  95.9  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.890342  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08181  putative heme transporter  34.62 
 
 		 312 aa  95.9  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  29.55 
 
 		 271 aa  95.5  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  29.68 
 
 		 283 aa  94.7  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0575  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like protein  32.97 
 
 		 320 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1231  heme transporter  35.15 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.892503  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  28.83 
 
 		 284 aa  95.1  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  29.02 
 
 		 271 aa  94  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  32.54 
 
 		 278 aa  94.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5011  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.66 
 
 		 330 aa  94.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1049  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.87 
 
 		 310 aa  93.6  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143982  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2701  CcsB  37.27 
 
 		 329 aa  93.2  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.223788  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3145  cytochrome c assembly protein  32.72 
 
 		 401 aa  93.2  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0185  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  29.96 
 
 		 379 aa  93.2  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107492  normal  0.161414 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.84 
 
 		 405 aa  92.4  6e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3282  cytochrome c assembly protein  32.26 
 
 		 407 aa  92  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  34.52 
 
 		 283 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4570  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  37.18 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1248  heme transporter  38.99 
 
 		 304 aa  91.7  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.771877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08031  putative heme transporter  34.48 
 
 		 315 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.966125 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0234  cytochrome c assembly protein  31.11 
 
 		 381 aa  91.7  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2805  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.34 
 
 		 405 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0171  putative heme transporter  34.48 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2348  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  45.95 
 
 		 341 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2297  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  45.95 
 
 		 341 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0254  cytochrome c assembly protein  36.96 
 
 		 378 aa  90.9  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.409306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09971  putative heme transporter  47.06 
 
 		 311 aa  90.1  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.671585  normal  0.218138 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.09 
 
 		 271 aa  89.7  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000138241  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3481  cytochrome c assembly protein  29.76 
 
 		 396 aa  89.7  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3034  cytochrome c assembly family protein  30.16 
 
 		 396 aa  89.7  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0310  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.76 
 
 		 396 aa  89.7  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.269517 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.22 
 
 		 390 aa  89.7  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.854137 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0301  cytochrome c assembly protein  29.76 
 
 		 396 aa  89.7  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816512  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3289  cytochrome c assembly protein  31.5 
 
 		 381 aa  89.7  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.794512  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0348  cytochrome c assembly protein  31.19 
 
 		 403 aa  89.7  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00374335 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3609  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.19 
 
 		 401 aa  89.7  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.122456  hitchhiker  0.00000004022 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0283  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.63 
 
 		 396 aa  89.4  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0197  outer membrane lipoprotein MapA  27.09 
 
 		 1027 aa  89.4  6e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0382  cytochrome c assembly protein  29.76 
 
 		 396 aa  89.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0361  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.76 
 
 		 396 aa  89.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3088  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31 
 
 		 360 aa  89  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4471  cytochrome c assembly protein  31.12 
 
 		 366 aa  88.6  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4302  cytochrome c assembly protein  31.12 
 
 		 366 aa  88.6  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.694809  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4202  cytochrome c assembly protein  31.12 
 
 		 366 aa  88.6  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0511  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like  29.57 
 
 		 325 aa  88.6  9e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0049  cytochrome c assembly protein  33.54 
 
 		 324 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2995  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  44.86 
 
 		 328 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2597  cytochrome c assembly family protein  31.19 
 
 		 396 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3741  cytochrome c assembly family protein  31.19 
 
 		 408 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124691  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2711  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.57 
 
 		 395 aa  87.8  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0072374  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2747  cytochrome c assembly protein  28.74 
 
 		 782 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.250515  normal  0.330673 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0049  cytochrome c assembly protein  29.7 
 
 		 391 aa  88.2  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00321304  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3135  cytochrome C assembly protein  31.19 
 
 		 396 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3770  cytochrome C assembly protein  31.19 
 
 		 396 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1116  cytochrome c biogenesis protein, CcmF/CycK/CcsA family  32.95 
 
 		 1076 aa  88.2  1e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>