More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1844 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1844  cytochrome c assembly protein  100 
 
 		 266 aa  526  1e-148  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1808  cytochrome c assembly protein  67.94 
 
 		 265 aa  368  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2044  cytochrome c assembly protein  74.72 
 
 		 264 aa  352  2.9999999999999997e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.15181  normal  0.240775 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2776  cytochrome c assembly protein  70.04 
 
 		 265 aa  347  1e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.638359  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0653  cytochrome c assembly protein  68.18 
 
 		 266 aa  343  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0399  cytochrome c assembly protein  69.32 
 
 		 266 aa  336  1.9999999999999998e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0598105  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1681  cytochrome c biogenesis protein  66.67 
 
 		 265 aa  316  2e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.228999  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1574  cytochrome c biogenesis protein  66.03 
 
 		 265 aa  315  7e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0338041 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1103  cytochrome c assembly protein  44.32 
 
 		 264 aa  233  3e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1817  hypothetical protein  41.78 
 
 		 271 aa  176  4e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  34.72 
 
 		 278 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  33.46 
 
 		 283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0865  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.11 
 
 		 285 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0813  cytochrome c assembly protein  34.67 
 
 		 285 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.444267  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0861  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.11 
 
 		 285 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  28.96 
 
 		 284 aa  105  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  33.04 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.62 
 
 		 284 aa  102  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.76 
 
 		 283 aa  101  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.46 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0272  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.02 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.25 
 
 		 271 aa  99.8  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  28.12 
 
 		 284 aa  99  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08251  putative heme transporter  31.18 
 
 		 309 aa  98.2  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379611  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  27.63 
 
 		 283 aa  97.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.57 
 
 		 282 aa  97.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0447  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.41 
 
 		 321 aa  97.1  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1894  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.76 
 
 		 272 aa  96.3  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.29708  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2075  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  40.97 
 
 		 258 aa  96.3  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1248  heme transporter  32.43 
 
 		 304 aa  95.5  8e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.771877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08181  putative heme transporter  36.26 
 
 		 312 aa  95.5  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.11 
 
 		 282 aa  95.5  9e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1231  heme transporter  33.47 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.892503  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  29.46 
 
 		 284 aa  94.7  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1519  cytochrome c assembly protein  38.56 
 
 		 255 aa  95.1  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08271  putative heme transporter  35.71 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.958198  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4515  cytochrome c assembly protein  39.75 
 
 		 330 aa  93.6  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4095  cytochrome c assembly protein  39.13 
 
 		 325 aa  93.6  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.16923  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  30.8 
 
 		 285 aa  93.2  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0524  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.84 
 
 		 301 aa  93.2  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389658 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0824  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.99 
 
 		 357 aa  92.8  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.341691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  28.7 
 
 		 271 aa  92.4  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.27 
 
 		 271 aa  92.4  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000138241  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.99 
 
 		 283 aa  92  8e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0773  putative heme transporter  35 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.694231  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3263  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.15 
 
 		 395 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  30.26 
 
 		 278 aa  90.9  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  29.77 
 
 		 271 aa  90.5  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07230  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.96 
 
 		 340 aa  90.5  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4570  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.1 
 
 		 309 aa  89.7  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2916  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.89 
 
 		 395 aa  89.7  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652315  hitchhiker  0.00362581 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0197  outer membrane lipoprotein MapA  27.06 
 
 		 1027 aa  89  7e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  30.4 
 
 		 276 aa  88.6  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1528  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.94 
 
 		 394 aa  87.8  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.890342  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0916  cytochrome c assembly protein  28.03 
 
 		 1041 aa  88.6  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.307598  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3113  cytochrome c-type biogenesis protein ResC  36.94 
 
 		 352 aa  87.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2985  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  29.28 
 
 		 395 aa  87.8  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2701  CcsB  35.5 
 
 		 329 aa  87.8  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.223788  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3145  cytochrome c assembly protein  37.91 
 
 		 401 aa  87.8  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0575  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like protein  33.16 
 
 		 320 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08031  putative heme transporter  28.47 
 
 		 315 aa  87.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.966125 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5011  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.4 
 
 		 330 aa  87.8  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2711  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.94 
 
 		 395 aa  87.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0072374  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1116  cytochrome c biogenesis protein, CcmF/CycK/CcsA family  29.24 
 
 		 1076 aa  87.8  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0171  putative heme transporter  28.47 
 
 		 315 aa  87  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0513  cytochrome c assembly protein  43.24 
 
 		 351 aa  86.7  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4428  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.85 
 
 		 339 aa  87  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3282  cytochrome c assembly protein  37.91 
 
 		 407 aa  86.7  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4471  cytochrome c assembly protein  29.96 
 
 		 366 aa  87  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4302  cytochrome c assembly protein  29.96 
 
 		 366 aa  87  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.694809  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4202  cytochrome c assembly protein  29.96 
 
 		 366 aa  87  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0404  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  33.75 
 
 		 1024 aa  86.7  3e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0048  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  39.2 
 
 		 350 aa  86.7  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2297  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  42.34 
 
 		 341 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  34.91 
 
 		 283 aa  86.7  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3034  cytochrome c assembly family protein  38.56 
 
 		 396 aa  86.3  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2348  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  42.34 
 
 		 341 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0049  cytochrome c assembly protein  32.32 
 
 		 324 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3712  cytochrome C assembly protein  38.56 
 
 		 396 aa  86.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10540  cytochrome C-type biogenesis protein ccsA  33.54 
 
 		 324 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000241853  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2597  cytochrome c assembly family protein  38.56 
 
 		 396 aa  86.3  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3481  cytochrome c assembly protein  37.91 
 
 		 396 aa  86.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3512  cytochrome C assembly protein  38.56 
 
 		 396 aa  86.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.58 
 
 		 405 aa  86.3  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3135  cytochrome C assembly protein  38.56 
 
 		 396 aa  86.3  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1958  cytochrome C assembly protein  38.56 
 
 		 396 aa  86.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.32068  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0283  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  37.91 
 
 		 396 aa  85.9  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1049  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.62 
 
 		 310 aa  85.9  6e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143982  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3741  cytochrome c assembly family protein  38.56 
 
 		 408 aa  85.9  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124691  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6117  cytochrome c assembly protein  33.63 
 
 		 396 aa  85.9  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.242647  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0310  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  37.91 
 
 		 396 aa  85.9  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.269517 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3770  cytochrome C assembly protein  38.56 
 
 		 396 aa  85.9  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0361  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  37.91 
 
 		 396 aa  85.9  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0301  cytochrome c assembly protein  37.91 
 
 		 396 aa  85.9  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816512  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2725  cytochrome c assembly protein  37.91 
 
 		 396 aa  85.9  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0382  cytochrome c assembly protein  37.91 
 
 		 396 aa  85.9  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09971  putative heme transporter  45.1 
 
 		 311 aa  85.5  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.671585  normal  0.218138 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0091  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.6 
 
 		 454 aa  85.5  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2200  cytochrome c assembly protein  32.62 
 
 		 327 aa  85.5  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>