More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10540 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10540  cytochrome C-type biogenesis protein ccsA  100 
 
 		 324 aa  635    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000241853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0688  cytochrome c assembly protein  76.95 
 
 		 334 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4512  cytochrome c assembly protein  78.29 
 
 		 328 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0695  cytochrome c assembly protein  76.95 
 
 		 334 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0708  cytochrome c assembly protein  76.95 
 
 		 334 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.034343 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0049  cytochrome c assembly protein  74.22 
 
 		 324 aa  463  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0869  cytochrome c assembly protein  76.78 
 
 		 327 aa  464  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.0057057  normal  0.189022 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5339  cytochrome c assembly protein  72.17 
 
 		 326 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5672  cytochrome c assembly protein  72.17 
 
 		 326 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3702  cytochrome c assembly protein  72.17 
 
 		 326 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2820  cytochrome c assembly protein  72.78 
 
 		 326 aa  448  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1039  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  52.31 
 
 		 361 aa  335  7.999999999999999e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0692  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  51.98 
 
 		 330 aa  313  1.9999999999999998e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0232519  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02970  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  51.8 
 
 		 333 aa  302  5.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6712  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  52.92 
 
 		 321 aa  294  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0929  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  46.04 
 
 		 346 aa  270  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4570  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  47.04 
 
 		 309 aa  262  6.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2701  CcsB  46.11 
 
 		 329 aa  246  4e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.223788  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0513  cytochrome c assembly protein  50.19 
 
 		 397 aa  240  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal  0.322787 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6117  cytochrome c assembly protein  48.65 
 
 		 396 aa  236  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.242647  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5011  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  43.38 
 
 		 330 aa  233  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4428  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  48.24 
 
 		 339 aa  231  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0254  cytochrome c assembly protein  45.99 
 
 		 378 aa  223  4e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.409306  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0272  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  46.99 
 
 		 323 aa  218  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2200  cytochrome c assembly protein  46.05 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0575  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like protein  39.7 
 
 		 320 aa  206  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8079  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  44.36 
 
 		 358 aa  202  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0986266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0447  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  47.13 
 
 		 321 aa  196  5.000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0824  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  44.98 
 
 		 357 aa  195  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.341691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3289  cytochrome c assembly protein  40.07 
 
 		 381 aa  192  5e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.794512  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4515  cytochrome c assembly protein  44.07 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4095  cytochrome c assembly protein  43.64 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.16923  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3088  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  40.68 
 
 		 360 aa  186  5e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24230  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  39.86 
 
 		 358 aa  186  6e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.795122  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24320  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  42 
 
 		 297 aa  186  7e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.909816 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4471  cytochrome c assembly protein  40.22 
 
 		 366 aa  185  7e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4302  cytochrome c assembly protein  40.22 
 
 		 366 aa  185  7e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.694809  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4202  cytochrome c assembly protein  40.22 
 
 		 366 aa  185  7e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0504  cytochrome c assembly protein  39.46 
 
 		 341 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0350668  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0631  cytochrome c assembly protein  42.38 
 
 		 328 aa  180  4e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244792  hitchhiker  0.001469 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4574  cytochrome c assembly protein  43.92 
 
 		 360 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0524  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  39.43 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389658 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17940  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  44.16 
 
 		 366 aa  172  5.999999999999999e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3251  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  39.02 
 
 		 351 aa  171  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.165529  normal  0.248135 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07230  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.5 
 
 		 340 aa  171  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  40.32 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.4 
 
 		 271 aa  165  8e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2731  cytochrome c assembly protein  37.57 
 
 		 341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0354846  normal  0.099851 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  39.69 
 
 		 276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.41 
 
 		 283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.55 
 
 		 282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  39.04 
 
 		 278 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  38.2 
 
 		 283 aa  162  6e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38 
 
 		 271 aa  161  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  34.77 
 
 		 283 aa  157  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  35.55 
 
 		 284 aa  157  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.28 
 
 		 284 aa  156  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.92 
 
 		 283 aa  154  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  38.31 
 
 		 271 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  34.39 
 
 		 284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  36.58 
 
 		 285 aa  152  5e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  39.56 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  38.64 
 
 		 284 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  33.07 
 
 		 278 aa  149  6e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  35.18 
 
 		 282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1894  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.49 
 
 		 272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.29708  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.4 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000138241  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2075  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.46 
 
 		 258 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  37.29 
 
 		 283 aa  145  8.000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1519  cytochrome c assembly protein  36.25 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.57 
 
 		 282 aa  144  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.57 
 
 		 282 aa  143  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1049  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.36 
 
 		 310 aa  143  5e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143982  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.59 
 
 		 405 aa  139  4.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2995  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.78 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2297  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.11 
 
 		 341 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2348  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.11 
 
 		 341 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0113  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.82 
 
 		 373 aa  132  6e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000313165  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0171  putative heme transporter  34.06 
 
 		 315 aa  132  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4463  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.44 
 
 		 349 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08031  putative heme transporter  34.36 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.966125 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1231  heme transporter  39.11 
 
 		 304 aa  129  7.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.892503  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2851  cytochrome c assembly protein  40.88 
 
 		 395 aa  127  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0091  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.29 
 
 		 454 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.89 
 
 		 390 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.854137 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2711  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.32 
 
 		 395 aa  126  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0072374  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3113  cytochrome c-type biogenesis protein ResC  31.94 
 
 		 352 aa  126  6e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0234  cytochrome c assembly protein  37.05 
 
 		 381 aa  125  7e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0049  cytochrome c assembly protein  30.65 
 
 		 391 aa  125  8.000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00321304  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0511  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like  34.14 
 
 		 325 aa  125  8.000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3145  cytochrome c assembly protein  36.05 
 
 		 401 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3282  cytochrome c assembly protein  36.09 
 
 		 407 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2985  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  36.36 
 
 		 395 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0773  putative heme transporter  38.07 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.694231  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2916  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.5 
 
 		 395 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652315  hitchhiker  0.00362581 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3263  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.5 
 
 		 395 aa  122  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0283  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  40.25 
 
 		 396 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0310  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  40.25 
 
 		 396 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.269517 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2725  cytochrome c assembly protein  40.25 
 
 		 396 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0301  cytochrome c assembly protein  40.25 
 
 		 396 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>