More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1808 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1808  cytochrome c assembly protein  100 
 
 		 265 aa  529  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2776  cytochrome c assembly protein  76.6 
 
 		 265 aa  387  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.638359  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0399  cytochrome c assembly protein  71.76 
 
 		 266 aa  346  2e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0598105  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1681  cytochrome c biogenesis protein  70.57 
 
 		 265 aa  344  8.999999999999999e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.228999  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1574  cytochrome c biogenesis protein  71.32 
 
 		 265 aa  343  1e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0338041 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0653  cytochrome c assembly protein  65.52 
 
 		 266 aa  339  2.9999999999999998e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1844  cytochrome c assembly protein  67.94 
 
 		 266 aa  333  1e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2044  cytochrome c assembly protein  69.47 
 
 		 264 aa  324  8.000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.15181  normal  0.240775 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1103  cytochrome c assembly protein  46.18 
 
 		 264 aa  231  9e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1817  hypothetical protein  43.75 
 
 		 271 aa  173  1.9999999999999998e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  33.46 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0861  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.05 
 
 		 285 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0813  cytochrome c assembly protein  33.62 
 
 		 285 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.444267  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0865  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.05 
 
 		 285 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.59 
 
 		 271 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.42 
 
 		 283 aa  102  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.59 
 
 		 271 aa  102  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  31.97 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.91 
 
 		 284 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08181  putative heme transporter  37.99 
 
 		 312 aa  99.8  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2075  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  41.48 
 
 		 258 aa  99  7e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0447  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.09 
 
 		 321 aa  98.6  8e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08251  putative heme transporter  36.67 
 
 		 309 aa  97.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379611  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0773  putative heme transporter  38.67 
 
 		 309 aa  98.2  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.694231  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.36 
 
 		 282 aa  97.4  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  34.78 
 
 		 283 aa  97.8  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08271  putative heme transporter  36.67 
 
 		 309 aa  96.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.958198  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31 
 
 		 282 aa  95.9  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  29.3 
 
 		 271 aa  95.1  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4095  cytochrome c assembly protein  37.74 
 
 		 325 aa  94.7  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.16923  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.91 
 
 		 282 aa  94.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0272  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.41 
 
 		 323 aa  94.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  30.67 
 
 		 284 aa  94.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4515  cytochrome c assembly protein  37.74 
 
 		 330 aa  94  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  30.84 
 
 		 283 aa  93.6  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  29.44 
 
 		 284 aa  93.6  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  28.88 
 
 		 282 aa  93.2  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2701  CcsB  35.15 
 
 		 329 aa  92.8  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.223788  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1231  heme transporter  30.17 
 
 		 304 aa  92.4  7e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.892503  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24320  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.78 
 
 		 297 aa  92.4  7e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.909816 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  28.52 
 
 		 271 aa  92  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0824  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.98 
 
 		 357 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.341691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.73 
 
 		 283 aa  92  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  28.85 
 
 		 271 aa  91.3  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  31.78 
 
 		 284 aa  90.9  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1519  cytochrome c assembly protein  36.67 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08031  putative heme transporter  34.31 
 
 		 315 aa  90.5  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.966125 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0171  putative heme transporter  34.31 
 
 		 315 aa  90.5  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3289  cytochrome c assembly protein  28.68 
 
 		 381 aa  90.5  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.794512  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  29.78 
 
 		 278 aa  90.1  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1248  heme transporter  29.54 
 
 		 304 aa  89.7  4e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.771877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1049  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.04 
 
 		 310 aa  89.7  4e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143982  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5011  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.96 
 
 		 330 aa  89.7  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07230  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.57 
 
 		 340 aa  89.4  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09971  putative heme transporter  44.23 
 
 		 311 aa  89.4  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.671585  normal  0.218138 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0524  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.43 
 
 		 301 aa  89  7e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389658 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0688  cytochrome c assembly protein  32.92 
 
 		 334 aa  89  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0091  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.72 
 
 		 454 aa  89  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0695  cytochrome c assembly protein  32.92 
 
 		 334 aa  89  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0708  cytochrome c assembly protein  32.92 
 
 		 334 aa  89  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.034343 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0049  cytochrome c assembly protein  34.57 
 
 		 324 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1894  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.44 
 
 		 272 aa  88.2  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.29708  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0869  cytochrome c assembly protein  35.37 
 
 		 327 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.0057057  normal  0.189022 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2995  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.52 
 
 		 328 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4570  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.52 
 
 		 309 aa  87  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10540  cytochrome C-type biogenesis protein ccsA  34.15 
 
 		 324 aa  87  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000241853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1528  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.18 
 
 		 394 aa  86.7  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.890342  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0575  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like protein  30.43 
 
 		 320 aa  86.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2711  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.45 
 
 		 395 aa  85.9  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0072374  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16811  putative heme transporter  31.55 
 
 		 318 aa  85.5  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3113  cytochrome c-type biogenesis protein ResC  30.45 
 
 		 352 aa  85.5  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0254  cytochrome c assembly protein  31.89 
 
 		 378 aa  85.5  8e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.409306  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2985  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  31.78 
 
 		 395 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4512  cytochrome c assembly protein  30.91 
 
 		 328 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  30.22 
 
 		 285 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2916  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.78 
 
 		 395 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652315  hitchhiker  0.00362581 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2297  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  42.57 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3263  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.99 
 
 		 395 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2348  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  42.57 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.17 
 
 		 271 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000138241  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0513  cytochrome c assembly protein  42.57 
 
 		 351 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1116  cytochrome c biogenesis protein, CcmF/CycK/CcsA family  33.51 
 
 		 1076 aa  84.3  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0234  cytochrome c assembly protein  38.31 
 
 		 381 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2851  cytochrome c assembly protein  31.34 
 
 		 395 aa  84  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43520  plastid-localized, cytochrome c assembly protein  35.86 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.635998 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2747  cytochrome c assembly protein  29.17 
 
 		 782 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.250515  normal  0.330673 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0633  cytochrome c assembly protein  44.9 
 
 		 351 aa  83.6  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008383 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0048  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  42.57 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0916  cytochrome c assembly protein  30.15 
 
 		 1041 aa  83.2  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.307598  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0404  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  32.34 
 
 		 1024 aa  83.2  0.000000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3145  cytochrome c assembly protein  36.36 
 
 		 401 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2820  cytochrome c assembly protein  32.93 
 
 		 326 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0480  cytochrome c assembly protein  30.46 
 
 		 1045 aa  82  0.000000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  33.93 
 
 		 283 aa  82  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4471  cytochrome c assembly protein  31.29 
 
 		 366 aa  82.4  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4302  cytochrome c assembly protein  31.29 
 
 		 366 aa  82.4  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.694809  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4202  cytochrome c assembly protein  31.29 
 
 		 366 aa  82.4  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3088  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.67 
 
 		 360 aa  82  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3282  cytochrome c assembly protein  36.36 
 
 		 407 aa  82  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3741  cytochrome c assembly family protein  33.73 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>