More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0653 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0653  cytochrome c assembly protein  100 
 
 
266 aa  535  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1808  cytochrome c assembly protein  65.52 
 
 
265 aa  362  4e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1844  cytochrome c assembly protein  68.18 
 
 
266 aa  340  1e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2776  cytochrome c assembly protein  63.85 
 
 
265 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.638359  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0399  cytochrome c assembly protein  66.04 
 
 
266 aa  333  1e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0598105  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2044  cytochrome c assembly protein  68.42 
 
 
264 aa  331  9e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.15181  normal  0.240775 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1574  cytochrome c biogenesis protein  61.69 
 
 
265 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0338041 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1681  cytochrome c biogenesis protein  63.08 
 
 
265 aa  303  1.0000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.228999  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1103  cytochrome c assembly protein  45.83 
 
 
264 aa  229  5e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1817  hypothetical protein  42.92 
 
 
271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  34.4 
 
 
278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0861  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  40 
 
 
285 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0813  cytochrome c assembly protein  39.38 
 
 
285 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.444267  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0865  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  40 
 
 
285 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30 
 
 
283 aa  93.6  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.23 
 
 
271 aa  92  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1231  heme transporter  30.59 
 
 
304 aa  90.9  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.892503  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  30.23 
 
 
283 aa  90.5  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1248  heme transporter  31.7 
 
 
304 aa  90.1  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.771877  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.94 
 
 
271 aa  90.1  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08181  putative heme transporter  32.62 
 
 
312 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08271  putative heme transporter  32.34 
 
 
309 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.958198  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.07 
 
 
282 aa  88.2  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08251  putative heme transporter  32.62 
 
 
309 aa  87.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379611  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0773  putative heme transporter  33.69 
 
 
309 aa  87.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.694231  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.63 
 
 
282 aa  86.7  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  27.41 
 
 
282 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0824  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.57 
 
 
357 aa  84  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.341691  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  28.08 
 
 
271 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0404  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  29.26 
 
 
1024 aa  83.6  0.000000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1116  cytochrome c biogenesis protein, CcmF/CycK/CcsA family  28.69 
 
 
1076 aa  83.2  0.000000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1461  cytochrome C assembly protein  29 
 
 
1031 aa  82.8  0.000000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.57 
 
 
284 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0049  cytochrome c assembly protein  35.8 
 
 
324 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0197  outer membrane lipoprotein MapA  29.36 
 
 
1027 aa  82  0.000000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  25.88 
 
 
271 aa  82  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.31 
 
 
282 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2985  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  39.22 
 
 
395 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0272  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.75 
 
 
323 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480455  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  28.83 
 
 
283 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  26.07 
 
 
271 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0916  cytochrome c assembly protein  28.33 
 
 
1041 aa  80.5  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.307598  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2075  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  39.26 
 
 
258 aa  80.5  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2916  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.72 
 
 
395 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652315  hitchhiker  0.00362581 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  27.92 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0091  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.31 
 
 
454 aa  80.5  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0447  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.54 
 
 
321 aa  79.7  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2951  cytochrome c assembly protein  27.17 
 
 
1074 aa  80.1  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.693523  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0869  cytochrome c assembly protein  35.19 
 
 
327 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.0057057  normal  0.189022 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3263  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.41 
 
 
395 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10540  cytochrome C-type biogenesis protein ccsA  36.02 
 
 
324 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000241853  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1894  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.78 
 
 
272 aa  78.6  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.29708  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16811  putative heme transporter  30.52 
 
 
318 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0185  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  39.22 
 
 
379 aa  78.6  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107492  normal  0.161414 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5339  cytochrome c assembly protein  34.76 
 
 
326 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08031  putative heme transporter  28.84 
 
 
315 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.966125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3702  cytochrome c assembly protein  34.76 
 
 
326 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.7 
 
 
271 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000138241  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5672  cytochrome c assembly protein  34.76 
 
 
326 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.33 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2701  CcsB  34.73 
 
 
329 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.223788  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6712  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.53 
 
 
321 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0234  cytochrome c assembly protein  38.16 
 
 
381 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0575  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like protein  32.29 
 
 
320 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4512  cytochrome c assembly protein  33.94 
 
 
328 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0695  cytochrome c assembly protein  33.54 
 
 
334 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0524  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.4 
 
 
301 aa  77.4  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00389658 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2820  cytochrome c assembly protein  29.27 
 
 
326 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0688  cytochrome c assembly protein  33.54 
 
 
334 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0708  cytochrome c assembly protein  33.54 
 
 
334 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.034343 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0809  cytochrome c biogenesis protein  26.34 
 
 
899 aa  77  0.0000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.747072  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3145  cytochrome c assembly protein  38.16 
 
 
401 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4515  cytochrome c assembly protein  35.85 
 
 
330 aa  76.6  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0708  cytochrome c assembly protein  31.71 
 
 
791 aa  76.3  0.0000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3282  cytochrome c assembly protein  38.16 
 
 
407 aa  76.3  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1519  cytochrome c assembly protein  34.84 
 
 
255 aa  76.3  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0171  putative heme transporter  28.46 
 
 
315 aa  75.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  28.38 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09971  putative heme transporter  26.97 
 
 
311 aa  75.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.671585  normal  0.218138 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24320  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.78 
 
 
297 aa  75.5  0.0000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.909816 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  27.65 
 
 
284 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5011  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.74 
 
 
330 aa  75.5  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4095  cytochrome c assembly protein  34.32 
 
 
325 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.16923  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0066  cytochrome c biogenesis protein  24.62 
 
 
901 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1528  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.28 
 
 
394 aa  75.1  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.890342  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2597  cytochrome c assembly family protein  38.16 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3609  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.84 
 
 
401 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.122456  hitchhiker  0.00000004022 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3741  cytochrome c assembly family protein  38.16 
 
 
408 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124691  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09813  hypothetical protein  26.04 
 
 
1054 aa  74.3  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3770  cytochrome C assembly protein  38.16 
 
 
396 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3512  cytochrome C assembly protein  38.16 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3034  cytochrome c assembly family protein  38.16 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3135  cytochrome C assembly protein  38.16 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0348  cytochrome c assembly protein  36.84 
 
 
403 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00374335 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3712  cytochrome C assembly protein  38.16 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1958  cytochrome C assembly protein  38.16 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.32068  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0301  cytochrome c assembly protein  37.5 
 
 
396 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816512  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3113  cytochrome c-type biogenesis protein ResC  31.28 
 
 
352 aa  74.3  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2711  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.28 
 
 
395 aa  74.7  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0072374  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2805  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.16 
 
 
405 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>