More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0399 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0399  cytochrome c assembly protein  100 
 
 		 266 aa  532  1e-150  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0598105  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1808  cytochrome c assembly protein  71.76 
 
 		 265 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2776  cytochrome c assembly protein  70.5 
 
 		 265 aa  361  7.0000000000000005e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.638359  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0653  cytochrome c assembly protein  66.04 
 
 		 266 aa  345  5e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1844  cytochrome c assembly protein  69.32 
 
 		 266 aa  336  2.9999999999999997e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1681  cytochrome c biogenesis protein  68.44 
 
 		 265 aa  332  5e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.228999  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2044  cytochrome c assembly protein  71.21 
 
 		 264 aa  326  3e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.15181  normal  0.240775 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1574  cytochrome c biogenesis protein  67.94 
 
 		 265 aa  315  4e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0338041 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1103  cytochrome c assembly protein  46.74 
 
 		 264 aa  241  7.999999999999999e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1817  hypothetical protein  43.69 
 
 		 271 aa  180  2e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0861  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.4 
 
 		 285 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0813  cytochrome c assembly protein  35.96 
 
 		 285 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.444267  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0865  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.4 
 
 		 285 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  33.61 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0773  putative heme transporter  37.84 
 
 		 309 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.694231  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08181  putative heme transporter  39.25 
 
 		 312 aa  99.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08251  putative heme transporter  37.99 
 
 		 309 aa  99  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379611  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08271  putative heme transporter  37.78 
 
 		 309 aa  99  8e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.958198  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.42 
 
 		 283 aa  97.8  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5011  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.41 
 
 		 330 aa  97.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.3 
 
 		 282 aa  96.7  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.51 
 
 		 271 aa  96.7  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4515  cytochrome c assembly protein  42.14 
 
 		 330 aa  96.3  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  32.05 
 
 		 283 aa  95.1  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.08 
 
 		 271 aa  94.7  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4095  cytochrome c assembly protein  40.88 
 
 		 325 aa  94.7  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.16923  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.82 
 
 		 284 aa  94  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0824  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.82 
 
 		 357 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.341691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0272  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.57 
 
 		 323 aa  93.2  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.43 
 
 		 282 aa  92.8  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  28.99 
 
 		 271 aa  92.8  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1049  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.38 
 
 		 310 aa  92.4  6e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143982  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1231  heme transporter  33.99 
 
 		 304 aa  92.4  7e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.892503  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0254  cytochrome c assembly protein  33.67 
 
 		 378 aa  91.3  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.409306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  31.28 
 
 		 284 aa  91.3  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  28.95 
 
 		 271 aa  90.9  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1894  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.33 
 
 		 272 aa  90.5  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.29708  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2701  CcsB  36.02 
 
 		 329 aa  89.4  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.223788  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  29.82 
 
 		 284 aa  89.4  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.49 
 
 		 282 aa  89.4  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2711  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.64 
 
 		 395 aa  89.4  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0072374  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3113  cytochrome c-type biogenesis protein ResC  33.64 
 
 		 352 aa  89  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  31.38 
 
 		 271 aa  88.2  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.29 
 
 		 283 aa  88.2  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0575  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like protein  33.51 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0447  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.65 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2075  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  42.55 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  31.44 
 
 		 283 aa  87.4  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0171  putative heme transporter  35.16 
 
 		 315 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1248  heme transporter  34.98 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.771877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  29.57 
 
 		 282 aa  87.8  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09971  putative heme transporter  47.96 
 
 		 311 aa  87.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.671585  normal  0.218138 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08031  putative heme transporter  35.16 
 
 		 315 aa  87.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.966125 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16811  putative heme transporter  34.34 
 
 		 318 aa  86.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  30.47 
 
 		 284 aa  86.3  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1519  cytochrome c assembly protein  38.96 
 
 		 255 aa  86.3  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.13 
 
 		 271 aa  85.9  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000138241  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2348  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  46.39 
 
 		 341 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2851  cytochrome c assembly protein  32.56 
 
 		 395 aa  85.9  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2297  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  46.39 
 
 		 341 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2995  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  46.39 
 
 		 328 aa  85.9  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1116  cytochrome c biogenesis protein, CcmF/CycK/CcsA family  30.22 
 
 		 1076 aa  85.9  7e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2985  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  31.13 
 
 		 395 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0513  cytochrome c assembly protein  45.36 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43520  plastid-localized, cytochrome c assembly protein  39.86 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.635998 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0633  cytochrome c assembly protein  46.94 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008383 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0524  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.68 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389658 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2916  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.13 
 
 		 395 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652315  hitchhiker  0.00362581 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  29.82 
 
 		 276 aa  84.3  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4428  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.14 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4471  cytochrome c assembly protein  34.97 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4302  cytochrome c assembly protein  34.97 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.694809  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4202  cytochrome c assembly protein  34.97 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0048  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  39.39 
 
 		 350 aa  84.3  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1528  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.13 
 
 		 394 aa  84  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.890342  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2747  cytochrome c assembly protein  30.56 
 
 		 782 aa  83.2  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.250515  normal  0.330673 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0049  cytochrome c assembly protein  34.18 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0234  cytochrome c assembly protein  37.91 
 
 		 381 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0511  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like  45.36 
 
 		 325 aa  82.4  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3282  cytochrome c assembly protein  38.56 
 
 		 407 aa  82  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3263  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.66 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2597  cytochrome c assembly family protein  36.53 
 
 		 396 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3145  cytochrome c assembly protein  37.91 
 
 		 401 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0185  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  35.29 
 
 		 379 aa  81.6  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107492  normal  0.161414 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3741  cytochrome c assembly family protein  36.53 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124691  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  31.11 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07230  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.12 
 
 		 340 aa  81.6  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24230  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  45.36 
 
 		 358 aa  82  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.795122  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1958  cytochrome C assembly protein  36.53 
 
 		 396 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.32068  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3034  cytochrome c assembly family protein  36.53 
 
 		 396 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3135  cytochrome C assembly protein  36.53 
 
 		 396 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3770  cytochrome C assembly protein  36.31 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3512  cytochrome C assembly protein  36.53 
 
 		 396 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3712  cytochrome C assembly protein  36.53 
 
 		 396 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0869  cytochrome c assembly protein  34.38 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.0057057  normal  0.189022 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4570  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.18 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3781  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.05 
 
 		 1054 aa  80.9  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000633001  normal  0.0119892 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5339  cytochrome c assembly protein  32.32 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0404  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  30.05 
 
 		 1024 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5672  cytochrome c assembly protein  32.32 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.593468 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>