More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2776 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2776  cytochrome c assembly protein  100 
 
 		 265 aa  533  1e-151  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.638359  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1808  cytochrome c assembly protein  76.6 
 
 		 265 aa  409  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1681  cytochrome c biogenesis protein  75.85 
 
 		 265 aa  382  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.228999  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0399  cytochrome c assembly protein  70.23 
 
 		 266 aa  348  5e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0598105  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1574  cytochrome c biogenesis protein  70.57 
 
 		 265 aa  347  9e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0338041 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0653  cytochrome c assembly protein  63.85 
 
 		 266 aa  336  2.9999999999999997e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1844  cytochrome c assembly protein  67.56 
 
 		 266 aa  331  8e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2044  cytochrome c assembly protein  67.18 
 
 		 264 aa  328  5.0000000000000004e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.15181  normal  0.240775 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1103  cytochrome c assembly protein  45.21 
 
 		 264 aa  236  3e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1817  hypothetical protein  43.61 
 
 		 271 aa  194  1e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  33.02 
 
 		 278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0861  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.04 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0813  cytochrome c assembly protein  37.42 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.444267  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0865  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.04 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.13 
 
 		 283 aa  105  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08251  putative heme transporter  34.02 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379611  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0773  putative heme transporter  39.05 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.694231  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08271  putative heme transporter  33.61 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.958198  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.2 
 
 		 284 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0447  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.34 
 
 		 321 aa  101  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08181  putative heme transporter  37.21 
 
 		 312 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.17 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.83 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  26.67 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  28.29 
 
 		 284 aa  99.8  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.6 
 
 		 271 aa  98.6  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  28.46 
 
 		 283 aa  97.8  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2075  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  39.01 
 
 		 258 aa  97.8  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  36.08 
 
 		 283 aa  97.4  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.51 
 
 		 282 aa  96.7  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  28.63 
 
 		 284 aa  96.3  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1231  heme transporter  30.34 
 
 		 304 aa  96.3  5e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.892503  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.8 
 
 		 271 aa  95.5  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.97 
 
 		 283 aa  94.7  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2747  cytochrome c assembly protein  31.52 
 
 		 782 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.250515  normal  0.330673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0575  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like protein  30.77 
 
 		 320 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2348  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  44.44 
 
 		 341 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2297  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  44.44 
 
 		 341 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3113  cytochrome c-type biogenesis protein ResC  32.13 
 
 		 352 aa  92.8  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2711  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.13 
 
 		 395 aa  92.8  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0072374  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0171  putative heme transporter  34.72 
 
 		 315 aa  92.4  7e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08031  putative heme transporter  34.72 
 
 		 315 aa  92.4  7e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.966125 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0272  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.24 
 
 		 323 aa  92.4  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  27.38 
 
 		 284 aa  91.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1894  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.86 
 
 		 272 aa  91.3  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.29708  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5011  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.34 
 
 		 330 aa  91.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09971  putative heme transporter  42.06 
 
 		 311 aa  90.9  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.671585  normal  0.218138 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0524  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.21 
 
 		 301 aa  91.3  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389658 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2995  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  40.14 
 
 		 328 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1519  cytochrome c assembly protein  36.36 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0513  cytochrome c assembly protein  45.92 
 
 		 351 aa  89.7  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1248  heme transporter  30.34 
 
 		 304 aa  90.1  4e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.771877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  29.74 
 
 		 276 aa  89.7  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4515  cytochrome c assembly protein  38.78 
 
 		 330 aa  89.4  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4095  cytochrome c assembly protein  38.1 
 
 		 325 aa  89  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.16923  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2701  CcsB  33.33 
 
 		 329 aa  88.6  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.223788  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2194  cytochrome c assembly protein  28.03 
 
 		 749 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0128686  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0633  cytochrome c assembly protein  45.92 
 
 		 351 aa  87.8  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008383 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0511  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like  45.92 
 
 		 325 aa  87  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16811  putative heme transporter  31.63 
 
 		 318 aa  87  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07230  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.54 
 
 		 340 aa  87  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5339  cytochrome c assembly protein  34.16 
 
 		 326 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0048  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  43.56 
 
 		 350 aa  86.7  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4463  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  46.94 
 
 		 349 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5672  cytochrome c assembly protein  34.16 
 
 		 326 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3702  cytochrome c assembly protein  34.16 
 
 		 326 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0091  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.77 
 
 		 454 aa  86.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2851  cytochrome c assembly protein  34.16 
 
 		 395 aa  85.9  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4570  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.12 
 
 		 309 aa  85.9  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1683  cytochrome c assembly protein  28.03 
 
 		 760 aa  85.5  8e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00910499  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0049  cytochrome c assembly protein  36.49 
 
 		 324 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1754  cytochrome c assembly protein  28.35 
 
 		 748 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.133127  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  31.46 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4471  cytochrome c assembly protein  27.66 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4302  cytochrome c assembly protein  27.66 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.694809  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4202  cytochrome c assembly protein  27.66 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2200  cytochrome c assembly protein  31.58 
 
 		 327 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0824  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.73 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.341691  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  29.09 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10540  cytochrome C-type biogenesis protein ccsA  35.33 
 
 		 324 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000241853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  28.57 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.85 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  27.98 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2820  cytochrome c assembly protein  32.92 
 
 		 326 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1049  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.7 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143982  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3289  cytochrome c assembly protein  30.65 
 
 		 381 aa  82.8  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.794512  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43520  plastid-localized, cytochrome c assembly protein  35.57 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.635998 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0254  cytochrome c assembly protein  33.91 
 
 		 378 aa  82.4  0.000000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.409306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1528  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.25 
 
 		 394 aa  82.4  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.890342  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2916  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.84 
 
 		 395 aa  82  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652315  hitchhiker  0.00362581 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0695  cytochrome c assembly protein  33.33 
 
 		 334 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0688  cytochrome c assembly protein  33.33 
 
 		 334 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0708  cytochrome c assembly protein  33.33 
 
 		 334 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.034343 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2985  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  34.19 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3741  cytochrome c assembly family protein  35.71 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124691  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4512  cytochrome c assembly protein  33.77 
 
 		 328 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24320  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.57 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.909816 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  27.35 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0234  cytochrome c assembly protein  29.17 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3088  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.15 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>