117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1112 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1112  PSP1 domain protein  100 
 
 
321 aa  666    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1368  PSP1 domain protein  66.99 
 
 
313 aa  440  9.999999999999999e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.901756  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1195  PSP1 domain protein  60.92 
 
 
325 aa  412  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0954849  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1012  PSP1 domain-containing protein  56.17 
 
 
324 aa  382  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1404  hypothetical protein  54.63 
 
 
333 aa  378  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1187  hypothetical protein  53.68 
 
 
331 aa  376  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.678391 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1189  PSP1 domain protein  57.36 
 
 
326 aa  369  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2253  PSP1 domain protein  35.14 
 
 
321 aa  162  9e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.101089  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1476  PSP1 domain protein  31.54 
 
 
462 aa  139  6e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.71704  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0891  PSP1 domain-containing protein  32.09 
 
 
456 aa  139  7.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03465  hypothetical protein  32.56 
 
 
390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3600  PSP1 domain protein  32.85 
 
 
508 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0292  hypothetical protein  37.44 
 
 
514 aa  132  6e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0076  PSP1 domain protein  36.57 
 
 
463 aa  130  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0874  PSP1 domain protein  30.85 
 
 
490 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0026  PSP1 domain protein  32.45 
 
 
275 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0038  PSP1 domain-containing protein  32.01 
 
 
270 aa  129  8.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.214386  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0028  PSP1 domain protein  32.68 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5965  PSP1 domain protein  31.43 
 
 
398 aa  126  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.565053 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0039  PSP1 domain protein  32.64 
 
 
302 aa  126  6e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0160  PSP1 domain protein  33.73 
 
 
291 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.100809  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0027  PSP1 domain-containing protein  32.11 
 
 
275 aa  123  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0027  PSP1 domain-containing protein  32.52 
 
 
275 aa  122  9e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1948  PSP1 domain protein  31.88 
 
 
364 aa  122  9e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.640853  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2118  PSP1 domain protein  35.5 
 
 
228 aa  121  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0041  hypothetical protein  32.11 
 
 
275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0037  hypothetical protein  32.11 
 
 
275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.62662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5279  hypothetical protein  32.11 
 
 
275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0037  hypothetical protein  32.11 
 
 
275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0030  hypothetical protein  32.11 
 
 
278 aa  120  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0031  hypothetical protein  32.11 
 
 
278 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0028  signal peptidase-like protein  32.11 
 
 
278 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0028  signal peptidase-like protein  32.11 
 
 
278 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.356586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0029  hypothetical protein  32.11 
 
 
278 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2104  PSP1  33.48 
 
 
291 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000520561  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0043  hypothetical protein  37.31 
 
 
238 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000138345  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0061  PSP1 domain-containing protein  32.16 
 
 
282 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00221406  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3205  PSP1 domain-containing protein  31.7 
 
 
284 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0102  PSP1 domain protein  32.26 
 
 
270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0883281  unclonable  0.000000000241869 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2758  PSP1 domain-containing protein  31.34 
 
 
301 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2443  PSP1 domain-containing protein  32.42 
 
 
301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0057  PSP1 domain-containing protein  32.05 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3155  PSP1 domain-containing protein  35.27 
 
 
315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00192464  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1490  PSP1 domain-containing protein  27.55 
 
 
294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1663  PSP1 domain-containing protein  33.33 
 
 
362 aa  112  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0044  Signal peptidase II  31.25 
 
 
239 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.494362  hitchhiker  0.0000921267 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2231  hypothetical protein  36.24 
 
 
345 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0131054  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3912  PSP1 domain-containing protein  33.9 
 
 
300 aa  109  8.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1693  PSP-like protein  30.07 
 
 
366 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000254469  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1637  PSP1 domain-containing protein  29.12 
 
 
406 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.293382  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0062  PSP1 domain protein  34.3 
 
 
282 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0293146  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1909  PSP1 domain protein  32.1 
 
 
410 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.308511  normal  0.225055 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3206  PSP1 domain protein  35.02 
 
 
312 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0232382  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1057  PSP1 domain protein  35.02 
 
 
312 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000216958 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20350  PSP1 domain protein  33.82 
 
 
288 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2254  PSP1 domain-containing protein  34.39 
 
 
406 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0152861 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0124  PSP1 domain protein  31.96 
 
 
219 aa  106  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00134499  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1076  PSP1 domain-containing protein  29.83 
 
 
508 aa  106  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1421  PSP1 domain protein  34.01 
 
 
362 aa  106  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.703416  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0080  PSP1 domain protein  30.8 
 
 
324 aa  106  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.918757  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0447  signaling phosphorelay regulator protein  29.96 
 
 
260 aa  105  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1125  PSP1 domain protein  32.39 
 
 
266 aa  105  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000705514  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0400  hypothetical protein  32.56 
 
 
427 aa  104  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3465  PSP1 domain-containing protein  29.01 
 
 
379 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0038  PSP1 domain protein  33.85 
 
 
328 aa  104  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0123  hypothetical protein  30.59 
 
 
267 aa  103  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2937  PSP1 domain protein  30.47 
 
 
302 aa  103  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9214  signal peptidase-like protein  28.03 
 
 
283 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0528  signaling phosphorelay regulator protein  35.2 
 
 
268 aa  103  4e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0790  PSP1 domain protein  28.39 
 
 
300 aa  103  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1170  PSP1 domain-containing protein  30.88 
 
 
487 aa  103  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.475432 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0760  PSP1 domain protein  31.9 
 
 
558 aa  103  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0155  PSP1 domain-containing protein  31.72 
 
 
265 aa  102  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2320  PSP1  38.18 
 
 
348 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.20089  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0410  PSP1 domain-containing protein  26.28 
 
 
298 aa  100  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0506  PSP1 domain-containing protein  32.44 
 
 
267 aa  99.8  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0519  PSP1 domain-containing protein  32.44 
 
 
267 aa  99.8  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.34633  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0516  PSP1 domain protein  29.96 
 
 
295 aa  99.4  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0840264  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0536  hypothetical protein  25.81 
 
 
277 aa  98.6  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4539  PSP1 domain protein  27.31 
 
 
275 aa  97.8  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6482  PSP1 domain protein  29.34 
 
 
646 aa  97.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4018  PSP1 domain-containing protein  25.56 
 
 
277 aa  97.4  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.670242 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3183  PSP1 domain protein  29.74 
 
 
423 aa  97.4  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1017  PSP1 domain protein  28.41 
 
 
404 aa  97.1  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.298521  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1964  PSP1 domain-containing protein  26.44 
 
 
277 aa  96.3  6e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.71417  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0154  PSP1 domain-containing protein  27.92 
 
 
271 aa  96.3  6e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0512  PSP1 domain-containing protein  25.87 
 
 
277 aa  95.9  9e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0156  PSP1 domain-containing protein  26.79 
 
 
271 aa  95.5  9e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000326451  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0314  PSP1 domain protein  28.85 
 
 
384 aa  94  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_477  PSP1-like protein  25.87 
 
 
277 aa  92.8  6e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4399  PSP1 domain-containing protein  25.56 
 
 
277 aa  92.4  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0290276 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1593  hypothetical protein  32.98 
 
 
374 aa  92  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.571552  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09190  uncharacterized PSP1-like protein  27.47 
 
 
443 aa  91.7  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.221137 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1090  PSP1 domain protein  27.76 
 
 
517 aa  89  9e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.220883  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16170  uncharacterized PSP1-like protein  28.85 
 
 
500 aa  89  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000203324 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8391  PSP1 domain protein  30.69 
 
 
284 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.143768 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0305  PSP1 domain-containing protein  30.3 
 
 
345 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.782798  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1944  PSP1 domain-containing protein  24.18 
 
 
278 aa  85.5  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0237461  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0113  tpl protein  35.82 
 
 
304 aa  84.7  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0322  PSP1 domain protein  28.65 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.24972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>