115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0305 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0305  PSP1 domain-containing protein  100 
 
 		 345 aa  689    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.782798  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4308  PSP1  76.81 
 
 		 315 aa  412  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.414025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4539  PSP1 domain protein  66.05 
 
 		 275 aa  375  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3465  PSP1 domain-containing protein  59.88 
 
 		 379 aa  377  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9214  signal peptidase-like protein  63.12 
 
 		 283 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4018  PSP1 domain-containing protein  64.96 
 
 		 277 aa  361  1e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.670242 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1964  PSP1 domain-containing protein  64.07 
 
 		 277 aa  354  1e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.71417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4399  PSP1 domain-containing protein  66.67 
 
 		 277 aa  344  1e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0290276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8391  PSP1 domain protein  62.82 
 
 		 284 aa  320  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.143768 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0745  PSP1 domain protein  55.56 
 
 		 276 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2781  hypothetical protein  55.35 
 
 		 268 aa  255  6e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1909  PSP1 domain protein  46.64 
 
 		 410 aa  230  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.308511  normal  0.225055 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0038  PSP1 domain-containing protein  48.18 
 
 		 270 aa  227  2e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.214386  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0506  PSP1 domain-containing protein  44.22 
 
 		 267 aa  226  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0519  PSP1 domain-containing protein  44.22 
 
 		 267 aa  226  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.34633  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2254  PSP1 domain-containing protein  50.58 
 
 		 406 aa  225  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0152861 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2758  PSP1 domain-containing protein  43.37 
 
 		 301 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2104  PSP1  43.82 
 
 		 291 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000520561  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0028  PSP1 domain protein  45.1 
 
 		 275 aa  222  6e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0026  PSP1 domain protein  45.67 
 
 		 275 aa  222  7e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2443  PSP1 domain-containing protein  43.37 
 
 		 301 aa  222  8e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0057  PSP1 domain-containing protein  42.17 
 
 		 293 aa  222  9e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0039  PSP1 domain protein  39.44 
 
 		 302 aa  221  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0160  PSP1 domain protein  42.29 
 
 		 291 aa  218  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.100809  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0102  PSP1 domain protein  41.6 
 
 		 270 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0883281  unclonable  0.000000000241869 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1637  PSP1 domain-containing protein  46.06 
 
 		 406 aa  217  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.293382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20350  PSP1 domain protein  40.62 
 
 		 288 aa  218  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0027  PSP1 domain-containing protein  43.78 
 
 		 275 aa  216  5e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0041  hypothetical protein  43.37 
 
 		 275 aa  215  7e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0037  hypothetical protein  43.37 
 
 		 275 aa  215  7e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.62662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5279  hypothetical protein  43.37 
 
 		 275 aa  215  7e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0037  hypothetical protein  43.37 
 
 		 275 aa  215  7e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0030  hypothetical protein  44.03 
 
 		 278 aa  215  9e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0031  hypothetical protein  44.03 
 
 		 278 aa  215  9e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0028  signal peptidase-like protein  44.03 
 
 		 278 aa  215  9e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0028  signal peptidase-like protein  44.03 
 
 		 278 aa  215  9e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.356586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0029  hypothetical protein  44.03 
 
 		 278 aa  215  9e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0061  PSP1 domain-containing protein  44.44 
 
 		 282 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00221406  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0027  PSP1 domain-containing protein  42.97 
 
 		 275 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0123  hypothetical protein  42.63 
 
 		 267 aa  210  3e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0512  PSP1 domain-containing protein  40.15 
 
 		 277 aa  209  4e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1076  PSP1 domain-containing protein  45.67 
 
 		 508 aa  209  6e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_477  PSP1-like protein  40.08 
 
 		 277 aa  207  2e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0536  hypothetical protein  40.15 
 
 		 277 aa  206  7e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0516  PSP1 domain protein  39.6 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0840264  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1663  PSP1 domain-containing protein  39.04 
 
 		 362 aa  202  9e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0044  Signal peptidase II  45.74 
 
 		 239 aa  201  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.494362  hitchhiker  0.0000921267 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0062  PSP1 domain protein  47.66 
 
 		 282 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0293146  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2118  PSP1 domain protein  47.14 
 
 		 228 aa  200  3e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0155  PSP1 domain-containing protein  38.98 
 
 		 265 aa  199  5e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1948  PSP1 domain protein  40.08 
 
 		 364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.640853  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16170  uncharacterized PSP1-like protein  39.11 
 
 		 500 aa  197  2.0000000000000003e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000203324 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1693  PSP-like protein  40.71 
 
 		 366 aa  197  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000254469  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3912  PSP1 domain-containing protein  40.64 
 
 		 300 aa  195  9e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2231  hypothetical protein  42 
 
 		 345 aa  193  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0131054  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3206  PSP1 domain protein  40.96 
 
 		 312 aa  193  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0232382  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1057  PSP1 domain protein  40.96 
 
 		 312 aa  194  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000216958 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2320  PSP1  39.92 
 
 		 348 aa  193  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.20089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6482  PSP1 domain protein  43.67 
 
 		 646 aa  193  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0124  PSP1 domain protein  47.2 
 
 		 219 aa  193  5e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00134499  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3155  PSP1 domain-containing protein  39.13 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00192464  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09190  uncharacterized PSP1-like protein  41.09 
 
 		 443 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.221137 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1090  PSP1 domain protein  37.35 
 
 		 517 aa  188  1e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.220883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0790  PSP1 domain protein  37.55 
 
 		 300 aa  186  4e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1125  PSP1 domain protein  38.37 
 
 		 266 aa  181  2e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000705514  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0314  PSP1 domain protein  33.03 
 
 		 384 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2253  PSP1 domain protein  38.87 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.101089  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1593  hypothetical protein  37.26 
 
 		 374 aa  177  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.571552  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1017  PSP1 domain protein  39.02 
 
 		 404 aa  177  3e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.298521  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1170  PSP1 domain-containing protein  36.51 
 
 		 487 aa  176  5e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.475432 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0528  signaling phosphorelay regulator protein  38.43 
 
 		 268 aa  176  6e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3205  PSP1 domain-containing protein  35.16 
 
 		 284 aa  176  6e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0043  hypothetical protein  39.83 
 
 		 238 aa  175  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000138345  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1421  PSP1 domain protein  38.79 
 
 		 362 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.703416  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1868  PSP1 domain-containing protein  50 
 
 		 520 aa  171  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.605977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0760  PSP1 domain protein  37.96 
 
 		 558 aa  172  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1147  PSP1 domain protein  35.11 
 
 		 526 aa  168  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.233245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3183  PSP1 domain protein  33.84 
 
 		 423 aa  166  5e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0447  signaling phosphorelay regulator protein  46.34 
 
 		 260 aa  166  6.9999999999999995e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0154  PSP1 domain-containing protein  38.75 
 
 		 271 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0156  PSP1 domain-containing protein  38.33 
 
 		 271 aa  162  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000326451  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1944  PSP1 domain-containing protein  35.48 
 
 		 278 aa  160  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0237461  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2937  PSP1 domain protein  31.33 
 
 		 302 aa  157  4e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0410  PSP1 domain-containing protein  32.92 
 
 		 298 aa  154  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1490  PSP1 domain-containing protein  31.8 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0080  PSP1 domain protein  35.86 
 
 		 324 aa  152  5.9999999999999996e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.918757  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0891  PSP1 domain-containing protein  39.36 
 
 		 456 aa  151  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3600  PSP1 domain protein  39.27 
 
 		 508 aa  150  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5965  PSP1 domain protein  34.98 
 
 		 398 aa  149  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.565053 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0292  hypothetical protein  32.92 
 
 		 514 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1476  PSP1 domain protein  32 
 
 		 462 aa  144  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.71704  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1762  PSP1 domain-containing protein  36.13 
 
 		 259 aa  144  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0231  PSP1  39.73 
 
 		 279 aa  143  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03465  hypothetical protein  30.95 
 
 		 390 aa  140  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0113  tpl protein  34.65 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0402  PSP1 domain protein  29.89 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0874  PSP1 domain protein  40.35 
 
 		 490 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0038  PSP1 domain protein  40.62 
 
 		 328 aa  136  6.0000000000000005e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0076  PSP1 domain protein  41.56 
 
 		 463 aa  134  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0400  hypothetical protein  31.33 
 
 		 427 aa  129  7.000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>