117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3600 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3600  PSP1 domain protein  100 
 
 
508 aa  1041    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5965  PSP1 domain protein  70.09 
 
 
398 aa  509  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.565053 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0292  hypothetical protein  68.94 
 
 
514 aa  449  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0076  PSP1 domain protein  47.7 
 
 
463 aa  372  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1476  PSP1 domain protein  54.61 
 
 
462 aa  363  4e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.71704  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0891  PSP1 domain-containing protein  52.92 
 
 
456 aa  355  8.999999999999999e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03465  hypothetical protein  52.11 
 
 
390 aa  354  2e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0874  PSP1 domain protein  52.23 
 
 
490 aa  340  4e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2253  PSP1 domain protein  49.47 
 
 
321 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.101089  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0400  hypothetical protein  44.56 
 
 
427 aa  271  2e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2758  PSP1 domain-containing protein  42.4 
 
 
301 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2443  PSP1 domain-containing protein  42 
 
 
301 aa  186  8e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1693  PSP-like protein  36.47 
 
 
366 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000254469  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0038  PSP1 domain-containing protein  38.66 
 
 
270 aa  179  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.214386  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0027  PSP1 domain-containing protein  39.22 
 
 
275 aa  178  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1076  PSP1 domain-containing protein  37.45 
 
 
508 aa  178  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0160  PSP1 domain protein  40.32 
 
 
291 aa  178  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.100809  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1663  PSP1 domain-containing protein  29.22 
 
 
362 aa  177  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0041  hypothetical protein  39.22 
 
 
275 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0037  hypothetical protein  39.22 
 
 
275 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.62662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5279  hypothetical protein  39.22 
 
 
275 aa  177  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0037  hypothetical protein  39.22 
 
 
275 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2231  hypothetical protein  38.37 
 
 
345 aa  177  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0131054  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0027  PSP1 domain-containing protein  39.22 
 
 
275 aa  177  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0030  hypothetical protein  39.22 
 
 
278 aa  177  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0031  hypothetical protein  39.22 
 
 
278 aa  177  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0028  signal peptidase-like protein  39.22 
 
 
278 aa  177  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0028  signal peptidase-like protein  39.22 
 
 
278 aa  177  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.356586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0029  hypothetical protein  39.22 
 
 
278 aa  177  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2320  PSP1  35.11 
 
 
348 aa  176  6e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.20089  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2254  PSP1 domain-containing protein  35.97 
 
 
406 aa  176  9e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0152861 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2118  PSP1 domain protein  43.12 
 
 
228 aa  176  9e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2104  PSP1  39.22 
 
 
291 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000520561  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1948  PSP1 domain protein  38.52 
 
 
364 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.640853  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0102  PSP1 domain protein  37.69 
 
 
270 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0883281  unclonable  0.000000000241869 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0506  PSP1 domain-containing protein  38.58 
 
 
267 aa  174  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0519  PSP1 domain-containing protein  38.58 
 
 
267 aa  174  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.34633  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3155  PSP1 domain-containing protein  40.36 
 
 
315 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00192464  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0057  PSP1 domain-containing protein  38.62 
 
 
293 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0516  PSP1 domain protein  37.6 
 
 
295 aa  172  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0840264  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1170  PSP1 domain-containing protein  36.76 
 
 
487 aa  172  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.475432 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0028  PSP1 domain protein  39.29 
 
 
275 aa  172  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0026  PSP1 domain protein  40.08 
 
 
275 aa  172  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0123  hypothetical protein  39.18 
 
 
267 aa  170  4e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1637  PSP1 domain-containing protein  34.78 
 
 
406 aa  170  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.293382  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0039  PSP1 domain protein  38.4 
 
 
302 aa  169  9e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2937  PSP1 domain protein  36 
 
 
302 aa  169  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1909  PSP1 domain protein  38.12 
 
 
410 aa  169  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.308511  normal  0.225055 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0044  Signal peptidase II  42.57 
 
 
239 aa  167  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.494362  hitchhiker  0.0000921267 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0512  PSP1 domain-containing protein  37.78 
 
 
277 aa  167  5e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3206  PSP1 domain protein  38.6 
 
 
312 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0232382  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1057  PSP1 domain protein  38.6 
 
 
312 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000216958 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6482  PSP1 domain protein  36.04 
 
 
646 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0536  hypothetical protein  37.78 
 
 
277 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0314  PSP1 domain protein  35.57 
 
 
384 aa  164  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0061  PSP1 domain-containing protein  38.37 
 
 
282 aa  163  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00221406  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_477  PSP1-like protein  37.33 
 
 
277 aa  162  9e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1490  PSP1 domain-containing protein  43.82 
 
 
294 aa  162  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0790  PSP1 domain protein  37.61 
 
 
300 aa  161  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0760  PSP1 domain protein  36.84 
 
 
558 aa  160  3e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20350  PSP1 domain protein  40.09 
 
 
288 aa  160  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1090  PSP1 domain protein  35.98 
 
 
517 aa  160  5e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.220883  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0124  PSP1 domain protein  41.47 
 
 
219 aa  160  7e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00134499  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3205  PSP1 domain-containing protein  38.79 
 
 
284 aa  158  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0043  hypothetical protein  42.27 
 
 
238 aa  158  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000138345  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0062  PSP1 domain protein  43.4 
 
 
282 aa  157  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0293146  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0155  PSP1 domain-containing protein  34.68 
 
 
265 aa  157  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3912  PSP1 domain-containing protein  41.85 
 
 
300 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16170  uncharacterized PSP1-like protein  32.58 
 
 
500 aa  157  6e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000203324 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1593  hypothetical protein  35.92 
 
 
374 aa  156  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.571552  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1017  PSP1 domain protein  43.59 
 
 
404 aa  150  6e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.298521  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1421  PSP1 domain protein  34.87 
 
 
362 aa  150  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.703416  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09190  uncharacterized PSP1-like protein  32.53 
 
 
443 aa  150  6e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.221137 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1868  PSP1 domain-containing protein  46.2 
 
 
520 aa  149  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.605977  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1147  PSP1 domain protein  29.95 
 
 
526 aa  149  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.233245  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3183  PSP1 domain protein  36.29 
 
 
423 aa  148  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0528  signaling phosphorelay regulator protein  32.42 
 
 
268 aa  146  1e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0080  PSP1 domain protein  37.7 
 
 
324 aa  145  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.918757  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1125  PSP1 domain protein  35.97 
 
 
266 aa  144  3e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000705514  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0038  PSP1 domain protein  43.29 
 
 
328 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0305  PSP1 domain-containing protein  41.51 
 
 
345 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.782798  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0154  PSP1 domain-containing protein  32.68 
 
 
271 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0156  PSP1 domain-containing protein  36.74 
 
 
271 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000326451  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0745  PSP1 domain protein  43.37 
 
 
276 aa  140  7e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3465  PSP1 domain-containing protein  26.07 
 
 
379 aa  139  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1195  PSP1 domain protein  32.26 
 
 
325 aa  139  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0954849  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0410  PSP1 domain-containing protein  35.34 
 
 
298 aa  138  3.0000000000000003e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1944  PSP1 domain-containing protein  36.77 
 
 
278 aa  136  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0237461  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9214  signal peptidase-like protein  41.5 
 
 
283 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0447  signaling phosphorelay regulator protein  36.27 
 
 
260 aa  134  3.9999999999999996e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0113  tpl protein  47.97 
 
 
304 aa  133  6e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1964  PSP1 domain-containing protein  41.04 
 
 
277 aa  133  7.999999999999999e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.71417  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4539  PSP1 domain protein  41.96 
 
 
275 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8391  PSP1 domain protein  48.36 
 
 
284 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.143768 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1404  hypothetical protein  29.93 
 
 
333 aa  131  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4308  PSP1  40.52 
 
 
315 aa  131  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.414025  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1112  PSP1 domain protein  32.85 
 
 
321 aa  130  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1187  hypothetical protein  30.04 
 
 
331 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.678391 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4018  PSP1 domain-containing protein  42.75 
 
 
277 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.670242 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0402  PSP1 domain protein  35.61 
 
 
290 aa  125  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>