116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0076 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0076  PSP1 domain protein  100 
 
 
463 aa  963    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03465  hypothetical protein  55.8 
 
 
390 aa  417  9.999999999999999e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0891  PSP1 domain-containing protein  55.98 
 
 
456 aa  413  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0874  PSP1 domain protein  53.83 
 
 
490 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1476  PSP1 domain protein  53.78 
 
 
462 aa  396  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.71704  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3600  PSP1 domain protein  46.38 
 
 
508 aa  372  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0292  hypothetical protein  53.77 
 
 
514 aa  354  2e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5965  PSP1 domain protein  51.06 
 
 
398 aa  353  4e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.565053 
 
 
-
 
NC_002950  PG0400  hypothetical protein  40.29 
 
 
427 aa  287  2.9999999999999996e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2253  PSP1 domain protein  46.23 
 
 
321 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.101089  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2758  PSP1 domain-containing protein  39.31 
 
 
301 aa  178  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2443  PSP1 domain-containing protein  39.42 
 
 
301 aa  178  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0027  PSP1 domain-containing protein  38.38 
 
 
275 aa  176  7e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3155  PSP1 domain-containing protein  42.22 
 
 
315 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00192464  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0041  hypothetical protein  38.01 
 
 
275 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0037  hypothetical protein  38.01 
 
 
275 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.62662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5279  hypothetical protein  38.01 
 
 
275 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0037  hypothetical protein  38.01 
 
 
275 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0030  hypothetical protein  38.01 
 
 
278 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0031  hypothetical protein  38.01 
 
 
278 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0028  signal peptidase-like protein  38.01 
 
 
278 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0028  signal peptidase-like protein  38.01 
 
 
278 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.356586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0029  hypothetical protein  38.01 
 
 
278 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0038  PSP1 domain-containing protein  37.74 
 
 
270 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.214386  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0027  PSP1 domain-containing protein  37.64 
 
 
275 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0102  PSP1 domain protein  37.6 
 
 
270 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0883281  unclonable  0.000000000241869 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0026  PSP1 domain protein  39.02 
 
 
275 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0044  Signal peptidase II  42.38 
 
 
239 aa  171  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.494362  hitchhiker  0.0000921267 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0039  PSP1 domain protein  38.85 
 
 
302 aa  170  6e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1663  PSP1 domain-containing protein  41.96 
 
 
362 aa  168  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3205  PSP1 domain-containing protein  40.43 
 
 
284 aa  166  8e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0123  hypothetical protein  35.06 
 
 
267 aa  165  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0028  PSP1 domain protein  38.98 
 
 
275 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0061  PSP1 domain-containing protein  39.53 
 
 
282 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00221406  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1693  PSP-like protein  39.29 
 
 
366 aa  164  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000254469  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0057  PSP1 domain-containing protein  39.65 
 
 
293 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20350  PSP1 domain protein  37.5 
 
 
288 aa  162  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1076  PSP1 domain-containing protein  35.29 
 
 
508 aa  161  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3206  PSP1 domain protein  48.73 
 
 
312 aa  160  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0232382  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0124  PSP1 domain protein  42.08 
 
 
219 aa  160  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00134499  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1057  PSP1 domain protein  48.73 
 
 
312 aa  160  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000216958 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2231  hypothetical protein  38.39 
 
 
345 aa  159  9e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0131054  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1909  PSP1 domain protein  35.37 
 
 
410 aa  159  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.308511  normal  0.225055 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0160  PSP1 domain protein  37.89 
 
 
291 aa  159  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.100809  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0062  PSP1 domain protein  43.12 
 
 
282 aa  158  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0293146  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2118  PSP1 domain protein  40.18 
 
 
228 aa  158  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1948  PSP1 domain protein  38.84 
 
 
364 aa  157  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.640853  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1637  PSP1 domain-containing protein  32.47 
 
 
406 aa  156  7e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.293382  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2320  PSP1  55.28 
 
 
348 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.20089  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0516  PSP1 domain protein  35.03 
 
 
295 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0840264  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6482  PSP1 domain protein  37.05 
 
 
646 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0043  hypothetical protein  40.18 
 
 
238 aa  154  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000138345  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0155  PSP1 domain-containing protein  45.45 
 
 
265 aa  152  8.999999999999999e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2104  PSP1  34.07 
 
 
291 aa  152  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000520561  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0506  PSP1 domain-containing protein  33.21 
 
 
267 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0519  PSP1 domain-containing protein  33.21 
 
 
267 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.34633  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2254  PSP1 domain-containing protein  31.37 
 
 
406 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0152861 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1490  PSP1 domain-containing protein  35.86 
 
 
294 aa  150  4e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0314  PSP1 domain protein  41.82 
 
 
384 aa  147  5e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0536  hypothetical protein  35.27 
 
 
277 aa  147  6e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2937  PSP1 domain protein  31.78 
 
 
302 aa  146  6e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0154  PSP1 domain-containing protein  34.54 
 
 
271 aa  146  6e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0512  PSP1 domain-containing protein  34.82 
 
 
277 aa  146  9e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1090  PSP1 domain protein  26.73 
 
 
517 aa  146  9e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.220883  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0790  PSP1 domain protein  40.83 
 
 
300 aa  145  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3183  PSP1 domain protein  26.64 
 
 
423 aa  145  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1868  PSP1 domain-containing protein  45.06 
 
 
520 aa  145  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.605977  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_477  PSP1-like protein  34.47 
 
 
277 aa  144  3e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1170  PSP1 domain-containing protein  30.26 
 
 
487 aa  144  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.475432 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0156  PSP1 domain-containing protein  36.92 
 
 
271 aa  144  5e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000326451  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09190  uncharacterized PSP1-like protein  35.91 
 
 
443 aa  142  9e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.221137 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3912  PSP1 domain-containing protein  38.79 
 
 
300 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1147  PSP1 domain protein  35.96 
 
 
526 aa  142  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.233245  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1944  PSP1 domain-containing protein  31 
 
 
278 aa  141  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0237461  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1017  PSP1 domain protein  35.18 
 
 
404 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.298521  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0447  signaling phosphorelay regulator protein  44.65 
 
 
260 aa  137  4e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0410  PSP1 domain-containing protein  36.13 
 
 
298 aa  137  4e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1593  hypothetical protein  32.11 
 
 
374 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.571552  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0038  PSP1 domain protein  41.77 
 
 
328 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0760  PSP1 domain protein  28 
 
 
558 aa  133  9e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0080  PSP1 domain protein  33.18 
 
 
324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.918757  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1421  PSP1 domain protein  30.47 
 
 
362 aa  131  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.703416  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16170  uncharacterized PSP1-like protein  40.38 
 
 
500 aa  131  3e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000203324 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1195  PSP1 domain protein  32.57 
 
 
325 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0954849  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0113  tpl protein  46.34 
 
 
304 aa  130  6e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1112  PSP1 domain protein  36.57 
 
 
321 aa  130  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9214  signal peptidase-like protein  47.15 
 
 
283 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1187  hypothetical protein  34.72 
 
 
331 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.678391 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4308  PSP1  37.85 
 
 
315 aa  129  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.414025  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1125  PSP1 domain protein  33.19 
 
 
266 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000705514  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0305  PSP1 domain-containing protein  46.34 
 
 
345 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.782798  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3465  PSP1 domain-containing protein  39.39 
 
 
379 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0528  signaling phosphorelay regulator protein  36.61 
 
 
268 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4539  PSP1 domain protein  39.51 
 
 
275 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8391  PSP1 domain protein  43.07 
 
 
284 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.143768 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0402  PSP1 domain protein  38.12 
 
 
290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0745  PSP1 domain protein  32.2 
 
 
276 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1189  PSP1 domain protein  32.84 
 
 
326 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1012  PSP1 domain-containing protein  31.16 
 
 
324 aa  120  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1368  PSP1 domain protein  34.72 
 
 
313 aa  119  7.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.901756  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>