116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1195 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1195  PSP1 domain protein  100 
 
 		 325 aa  674    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0954849  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1012  PSP1 domain-containing protein  70.46 
 
 		 324 aa  478  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1189  PSP1 domain protein  73.56 
 
 		 326 aa  477  1e-133  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1404  hypothetical protein  67.87 
 
 		 333 aa  474  1e-132  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1187  hypothetical protein  63.72 
 
 		 331 aa  454  1e-127  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.678391 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1112  PSP1 domain protein  60.92 
 
 		 321 aa  412  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1368  PSP1 domain protein  57.41 
 
 		 313 aa  376  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.901756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2253  PSP1 domain protein  34.96 
 
 		 321 aa  153  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.101089  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0891  PSP1 domain-containing protein  31.67 
 
 		 456 aa  149  7e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03465  hypothetical protein  32.32 
 
 		 390 aa  143  5e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3600  PSP1 domain protein  32.26 
 
 		 508 aa  142  8e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0292  hypothetical protein  32.74 
 
 		 514 aa  142  9e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5965  PSP1 domain protein  32.38 
 
 		 398 aa  138  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.565053 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0028  PSP1 domain protein  34.14 
 
 		 275 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1476  PSP1 domain protein  32.12 
 
 		 462 aa  138  1e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.71704  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0039  PSP1 domain protein  33.33 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0026  PSP1 domain protein  34.32 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2104  PSP1  33.07 
 
 		 291 aa  133  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000520561  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0030  hypothetical protein  29.18 
 
 		 278 aa  132  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0031  hypothetical protein  29.18 
 
 		 278 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0028  signal peptidase-like protein  29.18 
 
 		 278 aa  132  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0028  signal peptidase-like protein  29.18 
 
 		 278 aa  132  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.356586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0029  hypothetical protein  29.18 
 
 		 278 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0041  hypothetical protein  29.18 
 
 		 275 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0037  hypothetical protein  29.18 
 
 		 275 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.62662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5279  hypothetical protein  29.18 
 
 		 275 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0037  hypothetical protein  29.18 
 
 		 275 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0027  PSP1 domain-containing protein  29.18 
 
 		 275 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0027  PSP1 domain-containing protein  28.83 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0076  PSP1 domain protein  32.57 
 
 		 463 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0874  PSP1 domain protein  32.29 
 
 		 490 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0102  PSP1 domain protein  33.58 
 
 		 270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0883281  unclonable  0.000000000241869 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2758  PSP1 domain-containing protein  33.59 
 
 		 301 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2443  PSP1 domain-containing protein  33.59 
 
 		 301 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1909  PSP1 domain protein  34.12 
 
 		 410 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.308511  normal  0.225055 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0061  PSP1 domain-containing protein  29.81 
 
 		 282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00221406  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0124  PSP1 domain protein  34.25 
 
 		 219 aa  127  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00134499  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2118  PSP1 domain protein  34.98 
 
 		 228 aa  126  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2254  PSP1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 406 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0152861 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0057  PSP1 domain-containing protein  33.19 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0160  PSP1 domain protein  33.33 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.100809  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1637  PSP1 domain-containing protein  32.94 
 
 		 406 aa  122  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.293382  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0400  hypothetical protein  33.64 
 
 		 427 aa  121  9.999999999999999e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0038  PSP1 domain-containing protein  29.24 
 
 		 270 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.214386  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9214  signal peptidase-like protein  36.98 
 
 		 283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2937  PSP1 domain protein  31.5 
 
 		 302 aa  114  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3912  PSP1 domain-containing protein  32.82 
 
 		 300 aa  112  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1076  PSP1 domain-containing protein  31.4 
 
 		 508 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0044  Signal peptidase II  28.63 
 
 		 239 aa  110  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.494362  hitchhiker  0.0000921267 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1490  PSP1 domain-containing protein  28.46 
 
 		 294 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0043  hypothetical protein  36.6 
 
 		 238 aa  109  7.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000138345  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0516  PSP1 domain protein  28.04 
 
 		 295 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0840264  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20350  PSP1 domain protein  32.37 
 
 		 288 aa  106  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3205  PSP1 domain-containing protein  30.71 
 
 		 284 aa  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1948  PSP1 domain protein  29.92 
 
 		 364 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.640853  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0062  PSP1 domain protein  30.91 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0293146  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1017  PSP1 domain protein  29.73 
 
 		 404 aa  104  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.298521  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0080  PSP1 domain protein  31.35 
 
 		 324 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.918757  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2320  PSP1  35.57 
 
 		 348 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.20089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0760  PSP1 domain protein  31.63 
 
 		 558 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0536  hypothetical protein  27.44 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1693  PSP-like protein  32.57 
 
 		 366 aa  103  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000254469  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3155  PSP1 domain-containing protein  33.94 
 
 		 315 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00192464  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3206  PSP1 domain protein  34.78 
 
 		 312 aa  104  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0232382  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1057  PSP1 domain protein  34.78 
 
 		 312 aa  103  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000216958 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2231  hypothetical protein  36.08 
 
 		 345 aa  103  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0131054  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3465  PSP1 domain-containing protein  34.03 
 
 		 379 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1421  PSP1 domain protein  32.68 
 
 		 362 aa  103  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.703416  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0410  PSP1 domain-containing protein  31.94 
 
 		 298 aa  103  5e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1170  PSP1 domain-containing protein  31.3 
 
 		 487 aa  102  7e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.475432 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0038  PSP1 domain protein  32.47 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_477  PSP1-like protein  28.99 
 
 		 277 aa  101  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0512  PSP1 domain-containing protein  27.07 
 
 		 277 aa  100  4e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1125  PSP1 domain protein  28.03 
 
 		 266 aa  100  4e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000705514  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16170  uncharacterized PSP1-like protein  30 
 
 		 500 aa  98.6  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000203324 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6482  PSP1 domain protein  27.05 
 
 		 646 aa  98.6  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0790  PSP1 domain protein  25.85 
 
 		 300 aa  98.2  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0506  PSP1 domain-containing protein  31.84 
 
 		 267 aa  97.4  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0519  PSP1 domain-containing protein  31.84 
 
 		 267 aa  97.4  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.34633  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3183  PSP1 domain protein  28.87 
 
 		 423 aa  97.4  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0123  hypothetical protein  29.29 
 
 		 267 aa  97.1  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4539  PSP1 domain protein  33.95 
 
 		 275 aa  97.1  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0528  signaling phosphorelay regulator protein  33.33 
 
 		 268 aa  97.1  4e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0155  PSP1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 265 aa  97.1  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1964  PSP1 domain-containing protein  33.73 
 
 		 277 aa  95.9  8e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.71417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1663  PSP1 domain-containing protein  33.85 
 
 		 362 aa  95.9  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1593  hypothetical protein  29.17 
 
 		 374 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.571552  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0447  signaling phosphorelay regulator protein  28.99 
 
 		 260 aa  95.5  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1944  PSP1 domain-containing protein  25.52 
 
 		 278 aa  95.5  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0237461  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8391  PSP1 domain protein  32.37 
 
 		 284 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.143768 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4018  PSP1 domain-containing protein  31.63 
 
 		 277 aa  93.2  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.670242 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4399  PSP1 domain-containing protein  27.7 
 
 		 277 aa  92.8  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0290276 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0314  PSP1 domain protein  30.95 
 
 		 384 aa  92  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0154  PSP1 domain-containing protein  31.25 
 
 		 271 aa  90.9  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09190  uncharacterized PSP1-like protein  26.79 
 
 		 443 aa  90.1  4e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.221137 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1147  PSP1 domain protein  29.62 
 
 		 526 aa  89.7  6e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.233245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0156  PSP1 domain-containing protein  31.25 
 
 		 271 aa  89.7  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000326451  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0305  PSP1 domain-containing protein  33.13 
 
 		 345 aa  87  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.782798  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1090  PSP1 domain protein  27.52 
 
 		 517 aa  87  4e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.220883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1868  PSP1 domain-containing protein  29.86 
 
 		 520 aa  86.3  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.605977  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>