116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1404 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1404  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  694    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1195  PSP1 domain protein  67.87 
 
 
325 aa  474  1e-132  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0954849  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1187  hypothetical protein  63.47 
 
 
331 aa  429  1e-119  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.678391 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1012  PSP1 domain-containing protein  61.9 
 
 
324 aa  431  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1189  PSP1 domain protein  61.86 
 
 
326 aa  404  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1112  PSP1 domain protein  54.63 
 
 
321 aa  378  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1368  PSP1 domain protein  50.77 
 
 
313 aa  338  5.9999999999999996e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.901756  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2253  PSP1 domain protein  33.7 
 
 
321 aa  158  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.101089  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0026  PSP1 domain protein  31.66 
 
 
275 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0028  PSP1 domain protein  29.41 
 
 
275 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0039  PSP1 domain protein  29.3 
 
 
302 aa  138  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0292  hypothetical protein  32.16 
 
 
514 aa  134  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0038  PSP1 domain-containing protein  29.07 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.214386  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1476  PSP1 domain protein  30.55 
 
 
462 aa  135  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.71704  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0057  PSP1 domain-containing protein  29 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2758  PSP1 domain-containing protein  29.71 
 
 
301 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2443  PSP1 domain-containing protein  29.71 
 
 
301 aa  133  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0027  PSP1 domain-containing protein  30.2 
 
 
275 aa  134  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3600  PSP1 domain protein  29.93 
 
 
508 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0030  hypothetical protein  30.35 
 
 
278 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0031  hypothetical protein  30.35 
 
 
278 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0028  signal peptidase-like protein  30.35 
 
 
278 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0028  signal peptidase-like protein  30.35 
 
 
278 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.356586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0029  hypothetical protein  30.35 
 
 
278 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0027  PSP1 domain-containing protein  30.2 
 
 
275 aa  133  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0041  hypothetical protein  30.35 
 
 
275 aa  133  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0037  hypothetical protein  30.35 
 
 
275 aa  133  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.62662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5279  hypothetical protein  30.35 
 
 
275 aa  133  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0037  hypothetical protein  30.35 
 
 
275 aa  133  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0160  PSP1 domain protein  31.62 
 
 
291 aa  133  5e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.100809  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5965  PSP1 domain protein  31.6 
 
 
398 aa  133  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.565053 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2104  PSP1  32.93 
 
 
291 aa  130  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000520561  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0061  PSP1 domain-containing protein  29.56 
 
 
282 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00221406  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0891  PSP1 domain-containing protein  29.35 
 
 
456 aa  129  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2118  PSP1 domain protein  36.98 
 
 
228 aa  127  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0102  PSP1 domain protein  28.04 
 
 
270 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0883281  unclonable  0.000000000241869 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0124  PSP1 domain protein  34.26 
 
 
219 aa  125  8.000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00134499  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1909  PSP1 domain protein  28.14 
 
 
410 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.308511  normal  0.225055 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03465  hypothetical protein  29.91 
 
 
390 aa  124  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0043  hypothetical protein  35.05 
 
 
238 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000138345  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2937  PSP1 domain protein  31.05 
 
 
302 aa  120  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20350  PSP1 domain protein  30.16 
 
 
288 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0076  PSP1 domain protein  31.8 
 
 
463 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1637  PSP1 domain-containing protein  27.37 
 
 
406 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.293382  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2254  PSP1 domain-containing protein  27.37 
 
 
406 aa  115  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0152861 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0516  PSP1 domain protein  25.86 
 
 
295 aa  114  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0840264  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0874  PSP1 domain protein  28.01 
 
 
490 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0400  hypothetical protein  31.48 
 
 
427 aa  112  9e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1490  PSP1 domain-containing protein  27.02 
 
 
294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1693  PSP-like protein  28.47 
 
 
366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000254469  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3155  PSP1 domain-containing protein  27.47 
 
 
315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00192464  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1948  PSP1 domain protein  31.94 
 
 
364 aa  110  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.640853  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0123  hypothetical protein  25.61 
 
 
267 aa  110  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2231  hypothetical protein  28.51 
 
 
345 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0131054  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3205  PSP1 domain-containing protein  28.57 
 
 
284 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3912  PSP1 domain-containing protein  30.37 
 
 
300 aa  108  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0062  PSP1 domain protein  29.82 
 
 
282 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0293146  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0044  Signal peptidase II  28.44 
 
 
239 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.494362  hitchhiker  0.0000921267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9214  signal peptidase-like protein  31.37 
 
 
283 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1076  PSP1 domain-containing protein  28.57 
 
 
508 aa  105  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0506  PSP1 domain-containing protein  24.65 
 
 
267 aa  105  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0519  PSP1 domain-containing protein  24.65 
 
 
267 aa  105  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.34633  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1057  PSP1 domain protein  29.63 
 
 
312 aa  105  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000216958 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3206  PSP1 domain protein  29.63 
 
 
312 aa  105  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0232382  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3465  PSP1 domain-containing protein  28.3 
 
 
379 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1421  PSP1 domain protein  33.83 
 
 
362 aa  104  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.703416  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2320  PSP1  30.32 
 
 
348 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.20089  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0760  PSP1 domain protein  30.88 
 
 
558 aa  102  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1663  PSP1 domain-containing protein  31.05 
 
 
362 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1017  PSP1 domain protein  33.93 
 
 
404 aa  100  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.298521  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0447  signaling phosphorelay regulator protein  25.28 
 
 
260 aa  100  4e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16170  uncharacterized PSP1-like protein  27.37 
 
 
500 aa  100  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000203324 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0314  PSP1 domain protein  31.84 
 
 
384 aa  99.8  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0080  PSP1 domain protein  26.74 
 
 
324 aa  99.8  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.918757  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0790  PSP1 domain protein  24.47 
 
 
300 aa  99.4  7e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0038  PSP1 domain protein  34.08 
 
 
328 aa  99.4  8e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1090  PSP1 domain protein  26.55 
 
 
517 aa  99.4  8e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.220883  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0410  PSP1 domain-containing protein  29.22 
 
 
298 aa  99  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1170  PSP1 domain-containing protein  30.88 
 
 
487 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.475432 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4539  PSP1 domain protein  30.1 
 
 
275 aa  98.2  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3183  PSP1 domain protein  27.54 
 
 
423 aa  96.3  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0528  signaling phosphorelay regulator protein  28.1 
 
 
268 aa  96.3  7e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1125  PSP1 domain protein  25.62 
 
 
266 aa  95.9  9e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000705514  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4018  PSP1 domain-containing protein  25.35 
 
 
277 aa  94.7  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.670242 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0512  PSP1 domain-containing protein  22.1 
 
 
277 aa  95.1  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1593  hypothetical protein  30.88 
 
 
374 aa  94.4  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.571552  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1964  PSP1 domain-containing protein  30.43 
 
 
277 aa  94  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.71417  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6482  PSP1 domain protein  29.36 
 
 
646 aa  94  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0536  hypothetical protein  22.1 
 
 
277 aa  93.2  6e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0155  PSP1 domain-containing protein  26.79 
 
 
265 aa  93.2  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_477  PSP1-like protein  23.22 
 
 
277 aa  92  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0305  PSP1 domain-containing protein  29.78 
 
 
345 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.782798  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0154  PSP1 domain-containing protein  26.32 
 
 
271 aa  90.5  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09190  uncharacterized PSP1-like protein  25.61 
 
 
443 aa  89.7  7e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.221137 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0156  PSP1 domain-containing protein  25.88 
 
 
271 aa  89  9e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000326451  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1944  PSP1 domain-containing protein  23.64 
 
 
278 aa  86.7  5e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0237461  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4399  PSP1 domain-containing protein  26.41 
 
 
277 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0290276 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0745  PSP1 domain protein  30.07 
 
 
276 aa  84.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2781  hypothetical protein  32.23 
 
 
268 aa  83.2  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8391  PSP1 domain protein  26.2 
 
 
284 aa  82.8  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.143768 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>