117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2104 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2104  PSP1  100 
 
 
291 aa  585  1e-166  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000520561  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0160  PSP1 domain protein  78.16 
 
 
291 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.100809  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2758  PSP1 domain-containing protein  64.08 
 
 
301 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2443  PSP1 domain-containing protein  63.73 
 
 
301 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0057  PSP1 domain-containing protein  70.28 
 
 
293 aa  358  7e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0026  PSP1 domain protein  67.87 
 
 
275 aa  350  1e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0028  PSP1 domain protein  67.07 
 
 
275 aa  348  6e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0039  PSP1 domain protein  59.67 
 
 
302 aa  344  8e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0027  PSP1 domain-containing protein  63.45 
 
 
275 aa  341  9e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0027  PSP1 domain-containing protein  63.45 
 
 
275 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0041  hypothetical protein  63.45 
 
 
275 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0037  hypothetical protein  63.45 
 
 
275 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.62662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5279  hypothetical protein  63.45 
 
 
275 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0037  hypothetical protein  63.45 
 
 
275 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0030  hypothetical protein  63.05 
 
 
278 aa  338  7e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0031  hypothetical protein  63.05 
 
 
278 aa  338  7e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0028  signal peptidase-like protein  63.05 
 
 
278 aa  338  7e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0028  signal peptidase-like protein  63.05 
 
 
278 aa  338  7e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.356586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0029  hypothetical protein  63.05 
 
 
278 aa  338  7e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0516  PSP1 domain protein  60.58 
 
 
295 aa  336  1.9999999999999998e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0840264  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3912  PSP1 domain-containing protein  62.31 
 
 
300 aa  335  5e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20350  PSP1 domain protein  64.37 
 
 
288 aa  331  9e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0061  PSP1 domain-containing protein  59.33 
 
 
282 aa  329  3e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00221406  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0102  PSP1 domain protein  64.26 
 
 
270 aa  324  1e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0883281  unclonable  0.000000000241869 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0062  PSP1 domain protein  71.96 
 
 
282 aa  322  6e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0293146  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0124  PSP1 domain protein  68.69 
 
 
219 aa  313  1.9999999999999998e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00134499  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0038  PSP1 domain-containing protein  61.54 
 
 
270 aa  298  6e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.214386  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1909  PSP1 domain protein  56.63 
 
 
410 aa  298  1e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.308511  normal  0.225055 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1693  PSP-like protein  51.81 
 
 
366 aa  291  9e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000254469  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0044  Signal peptidase II  60.26 
 
 
239 aa  291  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.494362  hitchhiker  0.0000921267 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0043  hypothetical protein  65.26 
 
 
238 aa  289  3e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000138345  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0506  PSP1 domain-containing protein  53.2 
 
 
267 aa  285  7e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0519  PSP1 domain-containing protein  53.2 
 
 
267 aa  285  7e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.34633  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0123  hypothetical protein  52.4 
 
 
267 aa  283  3.0000000000000004e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1948  PSP1 domain protein  53.05 
 
 
364 aa  276  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.640853  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2320  PSP1  53.88 
 
 
348 aa  273  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.20089  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1663  PSP1 domain-containing protein  49.1 
 
 
362 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2254  PSP1 domain-containing protein  50.53 
 
 
406 aa  272  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0152861 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1637  PSP1 domain-containing protein  53.6 
 
 
406 aa  271  7e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.293382  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2118  PSP1 domain protein  63.21 
 
 
228 aa  271  9e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2231  hypothetical protein  51.5 
 
 
345 aa  270  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0131054  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1076  PSP1 domain-containing protein  47.39 
 
 
508 aa  270  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0155  PSP1 domain-containing protein  52.9 
 
 
265 aa  268  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1125  PSP1 domain protein  50.81 
 
 
266 aa  263  2e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000705514  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_477  PSP1-like protein  52 
 
 
277 aa  263  3e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3155  PSP1 domain-containing protein  49.47 
 
 
315 aa  263  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00192464  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0536  hypothetical protein  52 
 
 
277 aa  263  4e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0512  PSP1 domain-containing protein  51.2 
 
 
277 aa  262  6e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3206  PSP1 domain protein  52.42 
 
 
312 aa  256  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0232382  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1057  PSP1 domain protein  52.42 
 
 
312 aa  256  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000216958 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1147  PSP1 domain protein  50 
 
 
526 aa  251  1e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.233245  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16170  uncharacterized PSP1-like protein  49.2 
 
 
500 aa  245  6e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000203324 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1593  hypothetical protein  46.02 
 
 
374 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.571552  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0314  PSP1 domain protein  47.06 
 
 
384 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3205  PSP1 domain-containing protein  50.21 
 
 
284 aa  240  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09190  uncharacterized PSP1-like protein  47.62 
 
 
443 aa  240  2e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.221137 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0790  PSP1 domain protein  47.88 
 
 
300 aa  232  7.000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3183  PSP1 domain protein  46.96 
 
 
423 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1090  PSP1 domain protein  46.27 
 
 
517 aa  231  1e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.220883  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0760  PSP1 domain protein  44.86 
 
 
558 aa  229  3e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4539  PSP1 domain protein  45.6 
 
 
275 aa  228  8e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3465  PSP1 domain-containing protein  45.45 
 
 
379 aa  227  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9214  signal peptidase-like protein  46.15 
 
 
283 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0154  PSP1 domain-containing protein  45.85 
 
 
271 aa  226  4e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2937  PSP1 domain protein  41.46 
 
 
302 aa  223  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1170  PSP1 domain-containing protein  43.79 
 
 
487 aa  223  3e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.475432 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0156  PSP1 domain-containing protein  45.06 
 
 
271 aa  223  4e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000326451  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2253  PSP1 domain protein  43.51 
 
 
321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.101089  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1964  PSP1 domain-containing protein  43.43 
 
 
277 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.71417  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1421  PSP1 domain protein  43.95 
 
 
362 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.703416  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0305  PSP1 domain-containing protein  44.4 
 
 
345 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.782798  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0528  signaling phosphorelay regulator protein  41.83 
 
 
268 aa  210  2e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6482  PSP1 domain protein  41.35 
 
 
646 aa  209  6e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8391  PSP1 domain protein  41.73 
 
 
284 aa  202  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.143768 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1944  PSP1 domain-containing protein  40 
 
 
278 aa  201  8e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0237461  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4308  PSP1  41.18 
 
 
315 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.414025  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1017  PSP1 domain protein  41.98 
 
 
404 aa  194  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.298521  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4399  PSP1 domain-containing protein  42.86 
 
 
277 aa  193  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0290276 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0038  PSP1 domain protein  54.94 
 
 
328 aa  191  1e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0113  tpl protein  46.82 
 
 
304 aa  190  2e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0410  PSP1 domain-containing protein  38.87 
 
 
298 aa  191  2e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4018  PSP1 domain-containing protein  41.27 
 
 
277 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.670242 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0080  PSP1 domain protein  44.86 
 
 
324 aa  188  9e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.918757  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1868  PSP1 domain-containing protein  42.5 
 
 
520 aa  186  5e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.605977  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0745  PSP1 domain protein  39.76 
 
 
276 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1490  PSP1 domain-containing protein  36.84 
 
 
294 aa  180  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0447  signaling phosphorelay regulator protein  41.77 
 
 
260 aa  179  5.999999999999999e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3600  PSP1 domain protein  39.22 
 
 
508 aa  179  7e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5965  PSP1 domain protein  38.31 
 
 
398 aa  174  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.565053 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0874  PSP1 domain protein  36.15 
 
 
490 aa  172  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03465  hypothetical protein  36.59 
 
 
390 aa  169  3e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0292  hypothetical protein  35.89 
 
 
514 aa  169  5e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1476  PSP1 domain protein  34.46 
 
 
462 aa  168  8e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.71704  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1762  PSP1 domain-containing protein  33.83 
 
 
259 aa  159  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0891  PSP1 domain-containing protein  32.67 
 
 
456 aa  156  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0076  PSP1 domain protein  33.7 
 
 
463 aa  154  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0647  PSP1 domain protein  36.32 
 
 
258 aa  150  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.145217 
 
 
-
 
NC_002950  PG0400  hypothetical protein  37.02 
 
 
427 aa  149  6e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2781  hypothetical protein  35.98 
 
 
268 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0402  PSP1 domain protein  34.5 
 
 
290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>