117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0061 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0061  PSP1 domain-containing protein  100 
 
 
282 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00221406  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0102  PSP1 domain protein  69.29 
 
 
270 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0883281  unclonable  0.000000000241869 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0038  PSP1 domain-containing protein  65.28 
 
 
270 aa  367  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.214386  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0039  PSP1 domain protein  64.62 
 
 
302 aa  364  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0028  PSP1 domain protein  63.46 
 
 
275 aa  347  9e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0027  PSP1 domain-containing protein  63.46 
 
 
275 aa  345  7e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0030  hypothetical protein  62.26 
 
 
278 aa  343  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0031  hypothetical protein  62.26 
 
 
278 aa  343  2e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0028  signal peptidase-like protein  62.26 
 
 
278 aa  343  2e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0028  signal peptidase-like protein  62.26 
 
 
278 aa  343  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.356586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0029  hypothetical protein  62.26 
 
 
278 aa  343  2e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0027  PSP1 domain-containing protein  63.08 
 
 
275 aa  343  2e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0041  hypothetical protein  62.26 
 
 
275 aa  342  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0037  hypothetical protein  62.26 
 
 
275 aa  342  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.62662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5279  hypothetical protein  62.26 
 
 
275 aa  342  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0037  hypothetical protein  62.26 
 
 
275 aa  342  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0026  PSP1 domain protein  62.69 
 
 
275 aa  338  5e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0057  PSP1 domain-containing protein  62.99 
 
 
293 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2758  PSP1 domain-containing protein  58.82 
 
 
301 aa  332  5e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2443  PSP1 domain-containing protein  58.82 
 
 
301 aa  331  8e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0160  PSP1 domain protein  60.67 
 
 
291 aa  331  9e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.100809  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2104  PSP1  59.33 
 
 
291 aa  329  3e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000520561  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20350  PSP1 domain protein  57.14 
 
 
288 aa  325  7e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3912  PSP1 domain-containing protein  58.58 
 
 
300 aa  324  9e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0062  PSP1 domain protein  70.56 
 
 
282 aa  322  5e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0293146  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0516  PSP1 domain protein  57.3 
 
 
295 aa  317  2e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0840264  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0044  Signal peptidase II  62.55 
 
 
239 aa  311  7.999999999999999e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.494362  hitchhiker  0.0000921267 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0124  PSP1 domain protein  65.74 
 
 
219 aa  302  4.0000000000000003e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00134499  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0043  hypothetical protein  64.52 
 
 
238 aa  292  3e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000138345  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1909  PSP1 domain protein  50.76 
 
 
410 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.308511  normal  0.225055 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0155  PSP1 domain-containing protein  53.75 
 
 
265 aa  280  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1637  PSP1 domain-containing protein  52.67 
 
 
406 aa  280  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.293382  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1693  PSP-like protein  50.56 
 
 
366 aa  278  6e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000254469  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1076  PSP1 domain-containing protein  52.61 
 
 
508 aa  278  6e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0123  hypothetical protein  51.15 
 
 
267 aa  277  2e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2231  hypothetical protein  54.33 
 
 
345 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0131054  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3155  PSP1 domain-containing protein  54.25 
 
 
315 aa  271  7e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00192464  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2118  PSP1 domain protein  63.46 
 
 
228 aa  271  7e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0506  PSP1 domain-containing protein  52.49 
 
 
267 aa  271  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0519  PSP1 domain-containing protein  52.49 
 
 
267 aa  271  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.34633  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1948  PSP1 domain protein  50.39 
 
 
364 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.640853  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2254  PSP1 domain-containing protein  51.17 
 
 
406 aa  265  5e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0152861 
 
 
-
 
NC_002936  DET0536  hypothetical protein  51.3 
 
 
277 aa  258  7e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2320  PSP1  51.18 
 
 
348 aa  258  7e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.20089  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1663  PSP1 domain-containing protein  50.39 
 
 
362 aa  258  7e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3206  PSP1 domain protein  52.65 
 
 
312 aa  258  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0232382  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1057  PSP1 domain protein  52.65 
 
 
312 aa  258  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000216958 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_477  PSP1-like protein  51.3 
 
 
277 aa  256  2e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0512  PSP1 domain-containing protein  50.56 
 
 
277 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16170  uncharacterized PSP1-like protein  47.01 
 
 
500 aa  249  4e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000203324 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3205  PSP1 domain-containing protein  50.21 
 
 
284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0790  PSP1 domain protein  49.02 
 
 
300 aa  241  1e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1593  hypothetical protein  49.43 
 
 
374 aa  237  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.571552  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1125  PSP1 domain protein  46.18 
 
 
266 aa  237  1e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000705514  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0760  PSP1 domain protein  49.24 
 
 
558 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0156  PSP1 domain-containing protein  43.61 
 
 
271 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000326451  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0154  PSP1 domain-containing protein  42.86 
 
 
271 aa  228  8e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09190  uncharacterized PSP1-like protein  44.32 
 
 
443 aa  227  1e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.221137 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1147  PSP1 domain protein  46.04 
 
 
526 aa  227  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.233245  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3183  PSP1 domain protein  48.37 
 
 
423 aa  227  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1170  PSP1 domain-containing protein  48.15 
 
 
487 aa  223  3e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.475432 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2937  PSP1 domain protein  40.44 
 
 
302 aa  219  3e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1090  PSP1 domain protein  42.2 
 
 
517 aa  219  6e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.220883  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2253  PSP1 domain protein  44.75 
 
 
321 aa  216  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.101089  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1421  PSP1 domain protein  46.53 
 
 
362 aa  215  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.703416  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0410  PSP1 domain-containing protein  36.69 
 
 
298 aa  214  9.999999999999999e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0528  signaling phosphorelay regulator protein  41.22 
 
 
268 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6482  PSP1 domain protein  43.75 
 
 
646 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9214  signal peptidase-like protein  43.82 
 
 
283 aa  212  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0314  PSP1 domain protein  41.79 
 
 
384 aa  211  9e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3465  PSP1 domain-containing protein  44.18 
 
 
379 aa  211  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4539  PSP1 domain protein  43.6 
 
 
275 aa  209  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8391  PSP1 domain protein  45.42 
 
 
284 aa  208  8e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.143768 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1490  PSP1 domain-containing protein  38.49 
 
 
294 aa  207  2e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1017  PSP1 domain protein  44.49 
 
 
404 aa  206  5e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.298521  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0305  PSP1 domain-containing protein  44.26 
 
 
345 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.782798  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0447  signaling phosphorelay regulator protein  39.84 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1964  PSP1 domain-containing protein  42.57 
 
 
277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.71417  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4399  PSP1 domain-containing protein  42.05 
 
 
277 aa  199  5e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0290276 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1944  PSP1 domain-containing protein  39.13 
 
 
278 aa  198  6e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0237461  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4308  PSP1  42.8 
 
 
315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.414025  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1868  PSP1 domain-containing protein  45.06 
 
 
520 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.605977  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4018  PSP1 domain-containing protein  40.53 
 
 
277 aa  195  6e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.670242 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0113  tpl protein  46.46 
 
 
304 aa  189  2.9999999999999997e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1476  PSP1 domain protein  40.16 
 
 
462 aa  182  7e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.71704  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0080  PSP1 domain protein  38.14 
 
 
324 aa  180  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.918757  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0874  PSP1 domain protein  37.73 
 
 
490 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03465  hypothetical protein  38.58 
 
 
390 aa  179  4e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0292  hypothetical protein  37.97 
 
 
514 aa  179  4.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0891  PSP1 domain-containing protein  38.1 
 
 
456 aa  176  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5965  PSP1 domain protein  41.27 
 
 
398 aa  175  8e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.565053 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0745  PSP1 domain protein  36.18 
 
 
276 aa  171  7.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0038  PSP1 domain protein  46.11 
 
 
328 aa  170  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3600  PSP1 domain protein  38.37 
 
 
508 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0076  PSP1 domain protein  39.53 
 
 
463 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0400  hypothetical protein  37.1 
 
 
427 aa  161  1e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1762  PSP1 domain-containing protein  35.71 
 
 
259 aa  159  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0647  PSP1 domain protein  35.8 
 
 
258 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.145217 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0402  PSP1 domain protein  35.17 
 
 
290 aa  149  4e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0231  PSP1  36 
 
 
279 aa  144  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>