More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1078 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0569  copper-translocating P-type ATPase  62.34 
 
 		 699 aa  853    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1295  copper-translocating P-type ATPase  61.93 
 
 		 699 aa  852    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1078  cation-transporting ATPase, P-type  100 
 
 		 706 aa  1396    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.507171  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1176  copper-translocating P-type ATPase  61.79 
 
 		 699 aa  853    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.627262  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0531  copper-translocating P-type ATPase  41.45 
 
 		 723 aa  535  1e-150  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0398615  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  35.23 
 
 		 894 aa  424  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1233  heavy metal translocating P-type ATPase  38.13 
 
 		 622 aa  399  9.999999999999999e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.518664  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  33.88 
 
 		 797 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  32.75 
 
 		 814 aa  396  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  31.47 
 
 		 837 aa  388  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6890  copper-translocating P-type ATPase  32.64 
 
 		 754 aa  386  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  33.42 
 
 		 798 aa  385  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0422  heavy metal translocating P-type ATPase  34.26 
 
 		 723 aa  383  1e-105  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00260  putative copper transport-related membrane protein  34.44 
 
 		 741 aa  384  1e-105  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.348825  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1442  heavy metal translocating P-type ATPase  33.95 
 
 		 791 aa  384  1e-105  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.153784  normal  0.0826398 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0564  heavy metal translocating P-type ATPase  34.34 
 
 		 789 aa  381  1e-104  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0385  copper-transporter ATPase CopA  34.2 
 
 		 744 aa  380  1e-104  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0876  heavy metal translocating P-type ATPase  31.88 
 
 		 750 aa  380  1e-104  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  33.97 
 
 		 889 aa  380  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  32.93 
 
 		 828 aa  377  1e-103  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6644  copper-translocating P-type ATPase  32.55 
 
 		 753 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.935468  normal  0.257295 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  33.06 
 
 		 828 aa  376  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  33.38 
 
 		 839 aa  377  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  33.85 
 
 		 976 aa  373  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_824  cation transport ATPase  32.93 
 
 		 828 aa  374  1e-102  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  32.76 
 
 		 867 aa  374  1e-102  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  33.51 
 
 		 758 aa  373  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  33.74 
 
 		 889 aa  373  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0600  heavy metal translocating P-type ATPase  30.77 
 
 		 720 aa  374  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000362838  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 798 aa  371  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 798 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1506  heavy metal translocating P-type ATPase  34.35 
 
 		 723 aa  370  1e-101  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  33.86 
 
 		 758 aa  371  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0614  heavy metal translocating P-type ATPase  30.63 
 
 		 726 aa  369  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000274586  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0682  heavy metal translocating P-type ATPase  32.47 
 
 		 741 aa  367  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0741733  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3006  copper-translocating P-type ATPase  31.29 
 
 		 850 aa  367  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40662  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  32.48 
 
 		 836 aa  366  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3106  copper-translocating P-type ATPase  32.02 
 
 		 742 aa  369  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  34.14 
 
 		 818 aa  367  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3058  copper-translocating P-type ATPase  32.6 
 
 		 740 aa  365  1e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  31.19 
 
 		 857 aa  365  1e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  31.23 
 
 		 752 aa  366  1e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11220  copper/silver-translocating P-type ATPase  31.13 
 
 		 925 aa  365  2e-99  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.363514 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  31.59 
 
 		 730 aa  363  8e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  33.38 
 
 		 839 aa  362  1e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4950  copper-translocating P-type ATPase  32.19 
 
 		 748 aa  362  1e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.113213 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  30.03 
 
 		 849 aa  362  2e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  33.1 
 
 		 802 aa  361  2e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  33.1 
 
 		 802 aa  361  2e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  31.7 
 
 		 759 aa  361  3e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  31.7 
 
 		 759 aa  361  3e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  32.6 
 
 		 797 aa  360  4e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  31.82 
 
 		 759 aa  360  4e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  32.69 
 
 		 805 aa  359  9e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0413  heavy metal translocating P-type ATPase  34.4 
 
 		 723 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  32.88 
 
 		 815 aa  358  1.9999999999999998e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  27.9 
 
 		 885 aa  358  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  32.14 
 
 		 794 aa  358  2.9999999999999997e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1873  heavy metal translocating P-type ATPase  31.28 
 
 		 821 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3543  heavy metal translocating P-type ATPase  30.23 
 
 		 740 aa  357  3.9999999999999996e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2925  heavy metal translocating P-type ATPase  31.03 
 
 		 767 aa  357  3.9999999999999996e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01260  copper/silver-translocating P-type ATPase  31.45 
 
 		 905 aa  357  3.9999999999999996e-97  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00355  Cation transport ATPase  30.81 
 
 		 782 aa  357  5e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  31.06 
 
 		 826 aa  357  5.999999999999999e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0485  heavy metal translocating P-type ATPase  32.78 
 
 		 724 aa  356  6.999999999999999e-97  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.265664  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0905  heavy metal translocating P-type ATPase  30.72 
 
 		 802 aa  356  6.999999999999999e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.631984  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  29.94 
 
 		 905 aa  356  6.999999999999999e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0727  heavy metal translocating P-type ATPase  31.01 
 
 		 792 aa  356  8.999999999999999e-97  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000426608 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  30.97 
 
 		 837 aa  356  8.999999999999999e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  30.86 
 
 		 753 aa  355  1e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01268  cation transport ATPase  32.88 
 
 		 898 aa  355  1e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0715  heavy metal translocating P-type ATPase  30.88 
 
 		 739 aa  356  1e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.073863  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  31.46 
 
 		 803 aa  355  2e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  30.09 
 
 		 836 aa  354  4e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  32.38 
 
 		 796 aa  353  7e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1952  putative cation-transporting ATPase membrane protein  32.83 
 
 		 724 aa  353  7e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.51624  normal  0.45395 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  31.86 
 
 		 797 aa  353  7e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3217  heavy metal translocating P-type ATPase  29.78 
 
 		 741 aa  353  8e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  31.56 
 
 		 826 aa  352  8.999999999999999e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0297  heavy metal translocating P-type ATPase  33.06 
 
 		 744 aa  352  1e-95  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1313  heavy metal translocating P-type ATPase  29.47 
 
 		 868 aa  351  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000605467  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  31.21 
 
 		 942 aa  351  2e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  30.81 
 
 		 750 aa  351  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004188  copper-translocating P-type ATPase  31.84 
 
 		 909 aa  351  3e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1570  heavy metal translocating P-type ATPase  30.74 
 
 		 747 aa  350  5e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.706467  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3877  copper-translocating P-type ATPase  31.11 
 
 		 760 aa  349  1e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00336349  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  32.47 
 
 		 821 aa  347  3e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  32.69 
 
 		 806 aa  347  3e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  30.66 
 
 		 838 aa  347  4e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0431  copper-translocating P-type ATPase  34.49 
 
 		 645 aa  347  5e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000145431  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  30.91 
 
 		 790 aa  347  6e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  32.42 
 
 		 743 aa  346  7e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1871  heavy metal translocating P-type ATPase  30.68 
 
 		 866 aa  346  8e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000734074  normal  0.315442 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  31.04 
 
 		 837 aa  345  1e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2080  heavy metal translocating P-type ATPase  29.3 
 
 		 814 aa  346  1e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0351429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  32.83 
 
 		 806 aa  346  1e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1546  cation transport ATPase  31.67 
 
 		 742 aa  346  1e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3348  cation-transporting ATPase transmembrane protein  28.73 
 
 		 748 aa  345  2e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.701828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1251  heavy metal translocating P-type ATPase  31.8 
 
 		 806 aa  345  2e-93  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000992397 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  30.1 
 
 		 861 aa  344  4e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>