More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4159 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4159  putative transposase  100 
 
 
176 aa  353  5e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  99.39 
 
 
286 aa  331  3e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  99.39 
 
 
286 aa  331  3e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  99.39 
 
 
286 aa  331  3e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  99.39 
 
 
286 aa  331  3e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  99.39 
 
 
286 aa  331  3e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  99.39 
 
 
286 aa  331  3e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  99.39 
 
 
286 aa  331  3e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  99.39 
 
 
286 aa  331  3e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  99.39 
 
 
286 aa  331  3e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  99.39 
 
 
286 aa  331  3e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  99.39 
 
 
286 aa  331  4e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  98.77 
 
 
286 aa  328  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  97.55 
 
 
286 aa  326  9e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  97.55 
 
 
286 aa  326  9e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  62.58 
 
 
286 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1089  Integrase catalytic region  61.96 
 
 
286 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  62.58 
 
 
286 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  62.58 
 
 
286 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  62.58 
 
 
286 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  62.58 
 
 
286 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0188  integrase catalytic region  61.35 
 
 
287 aa  210  7e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  50.68 
 
 
270 aa  159  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  50.68 
 
 
270 aa  159  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  50.68 
 
 
270 aa  159  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  50.68 
 
 
270 aa  159  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  50.68 
 
 
270 aa  159  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  47.95 
 
 
270 aa  157  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  47.95 
 
 
270 aa  157  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  48.34 
 
 
281 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1072  IS3 family transposase orfB  45.68 
 
 
302 aa  151  5.9999999999999996e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1116  IS3 family transposase orfB  45.68 
 
 
293 aa  150  7e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1846  putative transposase  47.02 
 
 
296 aa  149  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796912  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2087  putative IS3 family transposase orfB  47.02 
 
 
296 aa  149  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360317  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2544  IS3 family transposase orfB  47.02 
 
 
296 aa  149  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2735  putative IS3 transposase integrase  47.02 
 
 
296 aa  149  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0386866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3565  putative transposase  47.02 
 
 
296 aa  149  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0131  putative transposase  47.02 
 
 
296 aa  149  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0634  putative transposase  47.02 
 
 
296 aa  149  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214662  normal  0.0414488 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2848  integrase catalytic subunit  43.86 
 
 
302 aa  148  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  47.24 
 
 
288 aa  145  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1015  IS3 family transposase orfB  45.06 
 
 
293 aa  144  7.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1010  IS3 family transposase orfB  45.06 
 
 
302 aa  144  7.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0673  putative integrase  48.19 
 
 
283 aa  142  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.700911 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2445  putative IS3 type transposase integrase (orfB)  43.11 
 
 
226 aa  142  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00380003  normal  0.181797 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3769  putative transposase  43.11 
 
 
296 aa  142  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7355  integrase catalytic region  50 
 
 
319 aa  142  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.149793 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3739  integrase catalytic region  45.51 
 
 
285 aa  141  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  47.2 
 
 
291 aa  141  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  46.99 
 
 
296 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  46.99 
 
 
296 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  46.99 
 
 
296 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  46.99 
 
 
296 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  44.52 
 
 
277 aa  140  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6588  integrase catalytic region  41.32 
 
 
296 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  38.55 
 
 
294 aa  138  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  38.55 
 
 
294 aa  138  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  38.55 
 
 
294 aa  138  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  38.55 
 
 
294 aa  138  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  38.55 
 
 
294 aa  138  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0771  Integrase catalytic region  43.62 
 
 
274 aa  137  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4217  Integrase catalytic region  43.62 
 
 
274 aa  137  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5316  Integrase catalytic region  43.53 
 
 
297 aa  137  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5973  transposase catalytic site ISRme3  43.53 
 
 
297 aa  137  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291095  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6074  transposase catalytic site ISRme3  43.53 
 
 
297 aa  137  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0031  integrase catalytic subunit  43.53 
 
 
297 aa  137  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1612  integrase catalytic subunit  43.53 
 
 
297 aa  137  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853443  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3348  integrase catalytic subunit  43.53 
 
 
297 aa  137  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3771  transposase catalytic site ISRme3  43.53 
 
 
297 aa  137  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3942  transposase catalytic site ISRme3  43.53 
 
 
297 aa  137  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4659  transposase catalytic site ISRme3  43.53 
 
 
297 aa  137  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.936352  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5452  transposase catalytic site ISRme3  43.53 
 
 
297 aa  137  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5679  transposase catalytic site ISRme3  43.53 
 
 
297 aa  137  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3815  Integrase catalytic region  43.53 
 
 
297 aa  137  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.382453 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3928  Integrase catalytic region  43.53 
 
 
297 aa  137  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.210808 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  46.39 
 
 
296 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  46.39 
 
 
296 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2546  Integrase catalytic region  42.95 
 
 
274 aa  136  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0281  ISMca2, transposase, OrfB  44.94 
 
 
291 aa  135  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0907  ISMca2, transposase, OrfB  44.94 
 
 
291 aa  135  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  42.42 
 
 
291 aa  136  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2546  putative IS1 transposase, InsB  48.3 
 
 
275 aa  135  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31349  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02981  putative transposase  48.3 
 
 
270 aa  136  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5189  Integrase catalytic region  44.03 
 
 
289 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100014  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5327  Integrase catalytic region  44.03 
 
 
289 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0628  Integrase catalytic region  44.03 
 
 
289 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0842  Integrase catalytic region  49.23 
 
 
252 aa  134  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1013  integrase catalytic subunit  45.27 
 
 
232 aa  134  8e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3204  integrase catalytic subunit  43.71 
 
 
279 aa  134  9e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000772302  unclonable  0.0000000000217557 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4851  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  42.33 
 
 
379 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  42.33 
 
 
286 aa  133  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  42.33 
 
 
286 aa  133  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  42.33 
 
 
286 aa  133  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  42.33 
 
 
286 aa  133  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  42.33 
 
 
286 aa  133  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1292  IS3 ORF2  44.58 
 
 
168 aa  133  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.276871  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0616  integrase catalytic subunit  45.81 
 
 
232 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.243414  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04112  hypothetical protein  42.33 
 
 
294 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  42.42 
 
 
293 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  42.42 
 
 
293 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>