More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2445 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2445  putative IS3 type transposase integrase (orfB)  100 
 
 
226 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00380003  normal  0.181797 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3769  putative transposase  100 
 
 
296 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6588  integrase catalytic region  88.5 
 
 
296 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5316  Integrase catalytic region  85.07 
 
 
297 aa  361  5.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5973  transposase catalytic site ISRme3  85.07 
 
 
297 aa  361  5.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291095  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6074  transposase catalytic site ISRme3  85.07 
 
 
297 aa  361  5.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0031  integrase catalytic subunit  85.07 
 
 
297 aa  361  5.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1612  integrase catalytic subunit  85.07 
 
 
297 aa  361  5.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853443  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3348  integrase catalytic subunit  85.07 
 
 
297 aa  361  5.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3771  transposase catalytic site ISRme3  85.07 
 
 
297 aa  361  5.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3942  transposase catalytic site ISRme3  85.07 
 
 
297 aa  361  5.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4659  transposase catalytic site ISRme3  85.07 
 
 
297 aa  361  5.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.936352  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5452  transposase catalytic site ISRme3  85.07 
 
 
297 aa  361  5.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5679  transposase catalytic site ISRme3  85.07 
 
 
297 aa  361  5.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3928  Integrase catalytic region  85.07 
 
 
297 aa  361  5.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.210808 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3815  Integrase catalytic region  85.07 
 
 
297 aa  361  5.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.382453 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1846  putative transposase  66 
 
 
296 aa  291  8e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796912  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2087  putative IS3 family transposase orfB  66 
 
 
296 aa  291  8e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360317  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2544  IS3 family transposase orfB  66 
 
 
296 aa  291  8e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2735  putative IS3 transposase integrase  66 
 
 
296 aa  291  8e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0386866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3565  putative transposase  66 
 
 
296 aa  291  8e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0131  putative transposase  66 
 
 
296 aa  291  8e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0634  putative transposase  66 
 
 
296 aa  291  8e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214662  normal  0.0414488 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2848  integrase catalytic subunit  65.69 
 
 
302 aa  287  8e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1059  ISMca2 transposase OrfB  66.49 
 
 
291 aa  271  5.000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0004  ISMca2 transposase OrfB  66.49 
 
 
291 aa  271  5.000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0575577 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0070  ISMca2 transposase OrfB  66.49 
 
 
291 aa  271  5.000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0088066 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0185  ISMca2 transposase OrfB  66.49 
 
 
291 aa  271  5.000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.213513 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0549  ISMca2 transposase OrfB  66.49 
 
 
291 aa  271  5.000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.151699  normal  0.0449666 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0571  ISMca2 transposase OrfB  66.49 
 
 
291 aa  271  5.000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23921  normal  0.0300939 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0587  ISMca2 transposase OrfB  66.49 
 
 
291 aa  271  5.000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000761461 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2475  integrase catalytic subunit  64.77 
 
 
231 aa  261  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0180519  normal  0.0292129 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0628  Integrase catalytic region  65.8 
 
 
289 aa  260  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5189  Integrase catalytic region  65.8 
 
 
289 aa  260  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100014  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5327  Integrase catalytic region  65.8 
 
 
289 aa  260  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0281  ISMca2, transposase, OrfB  62.3 
 
 
291 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0907  ISMca2, transposase, OrfB  62.3 
 
 
291 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2765  integrase catalytic subunit  61.41 
 
 
282 aa  239  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189225  normal  0.0315769 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4525  integrase catalytic subunit  61.41 
 
 
282 aa  239  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4683  integrase catalytic subunit  60.87 
 
 
282 aa  237  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4709  integrase catalytic subunit  60.87 
 
 
282 aa  237  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.240732 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2526  integrase catalytic subunit  61.41 
 
 
282 aa  235  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  57.5 
 
 
296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  57.5 
 
 
296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  56 
 
 
296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  56 
 
 
296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  56 
 
 
296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  56 
 
 
296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0673  putative integrase  54.5 
 
 
283 aa  221  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.700911 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0105  integrase catalytic subunit  56.04 
 
 
273 aa  216  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3810  integrase catalytic subunit  56.04 
 
 
273 aa  216  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000660644 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  53.44 
 
 
281 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  49.25 
 
 
286 aa  194  9e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  49.25 
 
 
286 aa  194  9e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  49.25 
 
 
286 aa  194  9e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  49.25 
 
 
286 aa  194  9e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  49.25 
 
 
286 aa  194  9e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1089  Integrase catalytic region  49.25 
 
 
286 aa  194  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3767  putative transposase  55.56 
 
 
263 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4851  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  47.24 
 
 
379 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  49.73 
 
 
277 aa  186  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  44.02 
 
 
294 aa  186  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  44.02 
 
 
294 aa  186  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  44.02 
 
 
294 aa  186  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  44.02 
 
 
294 aa  186  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04112  hypothetical protein  47.24 
 
 
294 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  44.02 
 
 
294 aa  186  4e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  50.75 
 
 
289 aa  186  4e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  48 
 
 
286 aa  184  7e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  48 
 
 
286 aa  184  7e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  48 
 
 
286 aa  184  7e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  48 
 
 
286 aa  184  7e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  48 
 
 
286 aa  184  7e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1015  IS3 family transposase orfB  45 
 
 
293 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1980  integrase catalytic subunit  50.25 
 
 
269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.340546  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1010  IS3 family transposase orfB  45 
 
 
302 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1127  integrase catalytic subunit  50.25 
 
 
289 aa  182  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.70947  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  50.25 
 
 
289 aa  181  6e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0652  integrase catalytic subunit  50.25 
 
 
260 aa  181  7e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00967506  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1991  integrase catalytic subunit  50.25 
 
 
260 aa  181  7e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.752349 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  46.7 
 
 
270 aa  180  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1072  IS3 family transposase orfB  44.5 
 
 
302 aa  180  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1116  IS3 family transposase orfB  44.5 
 
 
293 aa  180  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  46.7 
 
 
270 aa  180  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3739  integrase catalytic region  47 
 
 
285 aa  177  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  46.7 
 
 
270 aa  175  6e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  46.7 
 
 
270 aa  175  6e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  46.7 
 
 
270 aa  175  6e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  46.7 
 
 
270 aa  175  6e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  46.7 
 
 
270 aa  175  6e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3714  Integrase catalytic region  46.07 
 
 
286 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0904484 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  44 
 
 
291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0188  integrase catalytic region  47.26 
 
 
287 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2546  putative IS1 transposase, InsB  47.28 
 
 
275 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31349  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  44.5 
 
 
286 aa  171  6.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  44.5 
 
 
286 aa  171  6.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  44.5 
 
 
286 aa  171  6.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  44.5 
 
 
286 aa  171  6.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  44.5 
 
 
286 aa  171  7.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1312  ISSd1, transposase orfB  47.54 
 
 
272 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>