More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK01620 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006680  CNK01620  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 643 aa  1322    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06915  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13640)  29.26 
 
 		 585 aa  238  2e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.727522 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35345  predicted protein  43.71 
 
 		 160 aa  122  9.999999999999999e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15267  predicted protein  42.65 
 
 		 167 aa  63.5  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_56471  thioredoxin h  35.29 
 
 		 105 aa  63.5  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  33.01 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  32.11 
 
 		 135 aa  59.7  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1362  thioredoxin  36.56 
 
 		 106 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01639  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09090)  28.83 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0623  thioredoxin reductase  27.81 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.66148  normal  0.453769 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  30 
 
 		 120 aa  58.2  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  36.45 
 
 		 106 aa  58.2  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  36.78 
 
 		 460 aa  58.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  33.64 
 
 		 106 aa  57.8  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  34.41 
 
 		 107 aa  57.8  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0776  thioredoxin  33.33 
 
 		 138 aa  57.8  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.116689 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05698  thioredoxin 2  32.08 
 
 		 162 aa  57.8  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  31.37 
 
 		 107 aa  57.4  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  29.82 
 
 		 107 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  25.95 
 
 		 119 aa  56.2  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  33.33 
 
 		 293 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_56519  predicted protein  30.77 
 
 		 700 aa  56.2  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.532885  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1428  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.93 
 
 		 440 aa  56.2  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.156652  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00170  Thioredoxin (Trx) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P29429]  32.11 
 
 		 189 aa  55.5  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2606  putative thioredoxin-like protein  32.32 
 
 		 136 aa  55.5  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.888104  normal  0.656305 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  29.63 
 
 		 133 aa  55.5  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  35.51 
 
 		 106 aa  55.5  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  30.97 
 
 		 123 aa  55.5  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  29.36 
 
 		 114 aa  55.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  30.84 
 
 		 105 aa  55.1  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  32.74 
 
 		 141 aa  55.1  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  33.63 
 
 		 105 aa  54.7  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  31 
 
 		 110 aa  54.7  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  33.33 
 
 		 293 aa  54.7  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  32.38 
 
 		 106 aa  54.7  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  33.33 
 
 		 144 aa  54.3  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  27.27 
 
 		 286 aa  54.3  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  34.21 
 
 		 105 aa  54.3  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  32.73 
 
 		 110 aa  53.9  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  33.33 
 
 		 110 aa  53.9  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  30.51 
 
 		 109 aa  54.3  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7793  predicted protein  28.79 
 
 		 153 aa  53.5  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.813084 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31831  Thioredoxin (Trx)  29.73 
 
 		 129 aa  53.5  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.986588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  30.93 
 
 		 106 aa  53.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000083  thioredoxin 2  30.48 
 
 		 144 aa  53.5  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.396729  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  31.78 
 
 		 104 aa  53.5  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  32.99 
 
 		 106 aa  52.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  32.58 
 
 		 139 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  32.58 
 
 		 139 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  33.01 
 
 		 289 aa  52.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  32.67 
 
 		 238 aa  53.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  32.58 
 
 		 139 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  32.58 
 
 		 139 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  32.58 
 
 		 139 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  32.58 
 
 		 139 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  33.01 
 
 		 289 aa  52.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  31.37 
 
 		 107 aa  52.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  31.78 
 
 		 105 aa  52.4  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  32.58 
 
 		 139 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2493  thioredoxin  25.2 
 
 		 154 aa  53.1  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  32.58 
 
 		 139 aa  52.8  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  29.41 
 
 		 259 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  32.58 
 
 		 139 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1675  thioredoxin  36 
 
 		 110 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  28.89 
 
 		 277 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  35.53 
 
 		 456 aa  52.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  29.91 
 
 		 104 aa  52.4  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2639  thioredoxin  27.93 
 
 		 110 aa  52  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0886828  hitchhiker  0.00590655 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  32.58 
 
 		 139 aa  52  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  32.58 
 
 		 139 aa  52  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28263  thioredoxin  27.36 
 
 		 338 aa  51.6  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.135642  normal  0.918036 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  29.13 
 
 		 302 aa  52  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  32 
 
 		 108 aa  51.6  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  32.58 
 
 		 139 aa  52  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  31 
 
 		 107 aa  52  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  31 
 
 		 107 aa  52  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  32.58 
 
 		 139 aa  52  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  32.58 
 
 		 139 aa  52  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  32.67 
 
 		 107 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2614  thioredoxin family protein  31.73 
 
 		 271 aa  51.2  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  35.11 
 
 		 107 aa  51.2  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  33.64 
 
 		 106 aa  51.6  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39568  thioredoxin  32.69 
 
 		 103 aa  51.6  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.187057 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  29.41 
 
 		 124 aa  51.6  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  36.47 
 
 		 104 aa  51.6  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  31.73 
 
 		 124 aa  51.2  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  29.41 
 
 		 107 aa  51.2  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  28.44 
 
 		 107 aa  51.2  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  30.09 
 
 		 109 aa  51.2  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1093  thioredoxin  31.63 
 
 		 268 aa  50.8  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0251638  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  29.87 
 
 		 326 aa  50.8  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37753  predicted protein  31.07 
 
 		 101 aa  50.8  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0200499  hitchhiker  0.00126408 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  32.67 
 
 		 119 aa  50.8  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_56521  predicted protein  27.48 
 
 		 169 aa  50.8  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  29.36 
 
 		 107 aa  50.8  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  29.47 
 
 		 110 aa  50.8  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  33.68 
 
 		 269 aa  50.8  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0646  thioredoxin  27.35 
 
 		 111 aa  50.8  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  31.91 
 
 		 109 aa  50.4  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4061  thioredoxin reductase  26.61 
 
 		 453 aa  50.4  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>