268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3420 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3420  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  336  9.999999999999999e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1213  protein of unknown function DUF150  41.18 
 
 		 170 aa  107  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0034  protein of unknown function DUF150  35.53 
 
 		 160 aa  90.1  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.186641  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0139  protein of unknown function DUF150  33.13 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2114  hypothetical protein  29.45 
 
 		 166 aa  80.1  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0651  protein of unknown function DUF150  35.29 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00506938  normal  0.180527 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1781  hypothetical protein  34.56 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000171519  normal  0.0471019 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3595  protein of unknown function DUF150  29.73 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3333  protein of unknown function DUF150  33.7 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.295567  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1263  hypothetical protein  28.12 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3193  hypothetical protein  28.17 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0250324  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3192  hypothetical protein  32.58 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000184124  normal  0.0994389 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0400  protein of unknown function DUF150  32.48 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00158996  normal  0.629594 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3968  protein of unknown function DUF150  39.47 
 
 		 196 aa  67.4  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2430  hypothetical protein  29.87 
 
 		 172 aa  67  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.838305 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  38.46 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1418  hypothetical protein  35.16 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0298  hypothetical protein  36.67 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000302311  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14540  hypothetical protein  28.38 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0396  hypothetical protein  36.13 
 
 		 173 aa  64.7  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0150175  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  33.06 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1307  protein of unknown function DUF150  28.14 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.481915  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0253  hypothetical protein  34.25 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  37.25 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1628  hypothetical protein  31.41 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1440  protein of unknown function DUF150  36.54 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.626738 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1058  hypothetical protein  36.84 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0222222  normal  0.0438439 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1413  hypothetical protein  26.17 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149258  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1649  hypothetical protein  36.79 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296961  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1464  hypothetical protein  32.38 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.222123  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  33.93 
 
 		 152 aa  62  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  33.93 
 
 		 152 aa  62  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1518  hypothetical protein  38.36 
 
 		 170 aa  62  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0367  hypothetical protein  29.93 
 
 		 173 aa  62  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000973153  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1712  protein of unknown function DUF150  26.76 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2778  hypothetical protein  30.91 
 
 		 155 aa  60.5  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000007785  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  32.43 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0365  protein of unknown function DUF150  36.56 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00296353  normal  0.904382 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1507  protein of unknown function DUF150  28.57 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.417111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1005  hypothetical protein  36.71 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0545714  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  31.53 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  32.33 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2492  protein of unknown function DUF150  33.61 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2311  hypothetical protein  33.64 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0442926  normal  0.0676785 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  32.12 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  38.36 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7750  protein of unknown function DUF150  28.35 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2150  protein of unknown function DUF150  31.3 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  30.41 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  32.81 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4042  hypothetical protein  29.23 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0029117  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2079  hypothetical protein  27.93 
 
 		 192 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.727896  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2125  hypothetical protein  27.93 
 
 		 192 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0426445  normal  0.0108816 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2062  hypothetical protein  27.93 
 
 		 192 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11450  hypothetical protein  34.18 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0199556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0665  hypothetical protein  27.67 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658224 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1424  protein of unknown function DUF150  27.52 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000944308 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5837  hypothetical protein  39.47 
 
 		 174 aa  57  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1552  hypothetical protein  35.64 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175864  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4219  hypothetical protein  26 
 
 		 169 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000438537  normal  0.129114 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3062  hypothetical protein  34.48 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525096  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  38.57 
 
 		 151 aa  57.4  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  30.17 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1048  hypothetical protein  36.45 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000120853  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  34.88 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  33.33 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1813  protein of unknown function DUF150  35.16 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.549773  normal  0.686814 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1324  hypothetical protein  30.17 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.777494  normal  0.0380271 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  36.84 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  36.05 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0995  hypothetical protein  32 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000184773  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  31.48 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  31.48 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  27.15 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  31.48 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1126  hypothetical protein  28.67 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017917  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3282  hypothetical protein  28.67 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000111408  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  34.12 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  28.67 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3040  hypothetical protein  38.75 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  28.67 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0487  hypothetical protein  31.48 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249933  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1046  hypothetical protein  29.85 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000583244  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1431  protein of unknown function DUF150  31.19 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000199616  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  32.91 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  35.23 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0988  hypothetical protein  35.44 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  32.41 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1961  hypothetical protein  29.63 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00677493  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  32.43 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  28.12 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2411  protein of unknown function DUF150  30.63 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0960  hypothetical protein  33.33 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  30.77 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2043  hypothetical protein  34.95 
 
 		 157 aa  53.9  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  30.77 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1159  protein of unknown function DUF150  34.34 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.710629  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  30.77 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3610  hypothetical protein  42.03 
 
 		 152 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  30.77 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>