180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0298 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0298  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  353  6.999999999999999e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000302311  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0367  hypothetical protein  54.86 
 
 		 173 aa  184  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000973153  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1781  hypothetical protein  52.3 
 
 		 191 aa  171  5e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000171519  normal  0.0471019 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0396  hypothetical protein  47.4 
 
 		 173 aa  166  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0150175  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0365  protein of unknown function DUF150  44.12 
 
 		 179 aa  134  6.0000000000000005e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00296353  normal  0.904382 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1464  hypothetical protein  42.13 
 
 		 179 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.222123  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0400  protein of unknown function DUF150  40 
 
 		 180 aa  104  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00158996  normal  0.629594 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0034  protein of unknown function DUF150  41.41 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.186641  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3420  hypothetical protein  36.67 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0651  protein of unknown function DUF150  33.33 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00506938  normal  0.180527 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1213  protein of unknown function DUF150  39.8 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1324  hypothetical protein  33.94 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.777494  normal  0.0380271 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1424  protein of unknown function DUF150  33.33 
 
 		 222 aa  62  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000944308 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4219  hypothetical protein  30.32 
 
 		 169 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000438537  normal  0.129114 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  26.92 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1046  hypothetical protein  31.03 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000583244  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1418  hypothetical protein  33.33 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1413  hypothetical protein  32.19 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149258  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1585  hypothetical protein  34.86 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0279837  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0960  hypothetical protein  33.96 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1367  hypothetical protein  32.79 
 
 		 220 aa  57.8  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.54901  normal  0.305959 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3680  hypothetical protein  34.62 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000126023  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0139  protein of unknown function DUF150  42.47 
 
 		 154 aa  57  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1066  hypothetical protein  32.85 
 
 		 150 aa  57.4  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000674656  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3333  protein of unknown function DUF150  33 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.295567  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3193  hypothetical protein  29.13 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0250324  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1583  hypothetical protein  33.96 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324016  normal  0.240666 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  26.95 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  26.95 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  26.95 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1307  protein of unknown function DUF150  35.51 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.481915  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1518  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3968  protein of unknown function DUF150  33.02 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  29.35 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  29.32 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  36.84 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  28.57 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  29.81 
 
 		 140 aa  53.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3595  protein of unknown function DUF150  32.94 
 
 		 160 aa  53.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  28.45 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2411  protein of unknown function DUF150  26.77 
 
 		 162 aa  52.8  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2079  hypothetical protein  31.17 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.727896  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2125  hypothetical protein  31.17 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0426445  normal  0.0108816 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2062  hypothetical protein  31.17 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1263  hypothetical protein  28.8 
 
 		 155 aa  52.4  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  29.81 
 
 		 154 aa  52.4  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1048  hypothetical protein  30.1 
 
 		 151 aa  52  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000120853  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1628  hypothetical protein  29.66 
 
 		 166 aa  52  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  26.24 
 
 		 150 aa  51.6  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  26.24 
 
 		 150 aa  51.6  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14540  hypothetical protein  31.87 
 
 		 179 aa  51.6  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  26.24 
 
 		 150 aa  51.6  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7750  protein of unknown function DUF150  32.04 
 
 		 203 aa  51.6  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  26.24 
 
 		 150 aa  51.6  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  26.24 
 
 		 150 aa  51.6  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  26.24 
 
 		 150 aa  51.6  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2311  hypothetical protein  29.8 
 
 		 176 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0442926  normal  0.0676785 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1151  hypothetical protein  29 
 
 		 157 aa  51.2  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962197  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  28.85 
 
 		 140 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  28.85 
 
 		 154 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  28.85 
 
 		 154 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  31.73 
 
 		 154 aa  50.8  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01345  hypothetical protein  37.84 
 
 		 153 aa  50.8  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  27.59 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  31.07 
 
 		 161 aa  50.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  26.27 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0806  protein of unknown function DUF150  28.85 
 
 		 140 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  25.53 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  25.53 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  25.95 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  31.03 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1299  hypothetical protein  33.03 
 
 		 160 aa  50.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000613288  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2469  hypothetical protein  31.71 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000177785  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0583  hypothetical protein  28.85 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  27.87 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0487  hypothetical protein  26.95 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249933  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  25.53 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  25.93 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  27.88 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2984  hypothetical protein  33.03 
 
 		 160 aa  50.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.49788e-30 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  27.36 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  27.36 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  28.24 
 
 		 152 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  32.2 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1126  hypothetical protein  31.71 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017917  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  31.71 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  28.24 
 
 		 152 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3282  hypothetical protein  31.71 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000111408  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  27.88 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  31.71 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0529  hypothetical protein  26.32 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1552  hypothetical protein  34.58 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175864  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  26.21 
 
 		 152 aa  49.3  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  25.53 
 
 		 150 aa  49.3  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  29.17 
 
 		 151 aa  49.3  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  30.25 
 
 		 151 aa  48.9  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08070  hypothetical protein  27.12 
 
 		 177 aa  48.5  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0408486  normal  0.217563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2114  hypothetical protein  31.48 
 
 		 166 aa  48.5  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3192  hypothetical protein  30.69 
 
 		 153 aa  48.5  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000184124  normal  0.0994389 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2150  protein of unknown function DUF150  31.13 
 
 		 179 aa  48.5  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>