55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0253 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0253  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  306  8e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0139  protein of unknown function DUF150  36.36 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1263  hypothetical protein  33.11 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1628  hypothetical protein  32 
 
 		 166 aa  70.5  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0651  protein of unknown function DUF150  31.09 
 
 		 169 aa  63.5  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00506938  normal  0.180527 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3420  hypothetical protein  34.25 
 
 		 167 aa  63.5  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01345  hypothetical protein  34.69 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1213  protein of unknown function DUF150  32.28 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0034  protein of unknown function DUF150  30.19 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.186641  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0365  protein of unknown function DUF150  36.59 
 
 		 179 aa  52.8  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00296353  normal  0.904382 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1757  hypothetical protein  33.88 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.47468  normal  0.0284791 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  31.03 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0989  hypothetical protein  33.06 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.233502  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1760  hypothetical protein  33.06 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0659337  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1474  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1738  hypothetical protein  33.06 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00684436  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0177  hypothetical protein  33.06 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00695056  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1509  hypothetical protein  33.06 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.985298  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1063  hypothetical protein  33.06 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.295932  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1781  hypothetical protein  31.39 
 
 		 191 aa  48.9  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000171519  normal  0.0471019 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2566  hypothetical protein  33.06 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000987168  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1498  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310765  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1018  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.680488  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4639  hypothetical protein  33.88 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0564312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1420  hypothetical protein  33.88 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.042517 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1913  hypothetical protein  32.23 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.454349  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1380  hypothetical protein  33.88 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.449131  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0498  protein of unknown function DUF150  33.64 
 
 		 157 aa  47.8  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  40.98 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2411  protein of unknown function DUF150  34.62 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0298  hypothetical protein  29.71 
 
 		 176 aa  45.1  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000302311  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1677  hypothetical protein  28.1 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00187557  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1690  hypothetical protein  32.91 
 
 		 144 aa  43.9  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332685  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3193  hypothetical protein  30.39 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0250324  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3333  protein of unknown function DUF150  28.46 
 
 		 205 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.295567  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1866  hypothetical protein  33.65 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.182542  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  37.68 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1507  protein of unknown function DUF150  35.71 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.417111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0699  hypothetical protein  32.22 
 
 		 161 aa  41.6  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.188397  normal  0.319675 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0606  protein of unknown function DUF150  26.83 
 
 		 147 aa  42  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000662285  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7750  protein of unknown function DUF150  27.12 
 
 		 203 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0723  protein of unknown function DUF150  30.09 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1005  hypothetical protein  32.91 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0545714  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2430  hypothetical protein  27.85 
 
 		 172 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.838305 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2125  hypothetical protein  29.27 
 
 		 192 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0426445  normal  0.0108816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2079  hypothetical protein  29.27 
 
 		 192 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.727896  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2062  hypothetical protein  29.27 
 
 		 192 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1518  hypothetical protein  29.27 
 
 		 170 aa  40.8  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1630  hypothetical protein  30.58 
 
 		 152 aa  40.8  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00641879 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1464  hypothetical protein  29.36 
 
 		 179 aa  40.4  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.222123  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4042  hypothetical protein  31.78 
 
 		 178 aa  40.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0029117  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3820  hypothetical protein  30.09 
 
 		 186 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.646345  normal  0.0215546 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  32 
 
 		 153 aa  40  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1017  protein of unknown function DUF150  27.34 
 
 		 177 aa  40.4  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1413  hypothetical protein  28.24 
 
 		 205 aa  40  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>