More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2411 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2411  protein of unknown function DUF150  100 
 
 
162 aa  335  1.9999999999999998e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0498  protein of unknown function DUF150  46.84 
 
 
157 aa  153  9e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3160  hypothetical protein  45.14 
 
 
173 aa  143  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000242539  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  44.22 
 
 
151 aa  142  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2430  hypothetical protein  43.02 
 
 
172 aa  136  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.838305 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1005  hypothetical protein  42.18 
 
 
151 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0545714  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3563  hypothetical protein  43.54 
 
 
151 aa  132  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.380474  hitchhiker  0.00000509959 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  39.46 
 
 
161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  40.54 
 
 
165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  43.06 
 
 
152 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  43.06 
 
 
152 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  42.95 
 
 
152 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3391  hypothetical protein  41.5 
 
 
172 aa  127  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000810372  hitchhiker  0.000625033 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0988  hypothetical protein  38.78 
 
 
165 aa  127  6e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  38.1 
 
 
151 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  38.1 
 
 
151 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3062  hypothetical protein  39.58 
 
 
151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525096  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  38.1 
 
 
151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  45.45 
 
 
173 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  37.41 
 
 
151 aa  124  6e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  41.89 
 
 
153 aa  122  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  36.73 
 
 
151 aa  123  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  38.19 
 
 
151 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3282  hypothetical protein  38.19 
 
 
151 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000111408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1126  hypothetical protein  38.19 
 
 
151 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017917  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  38.19 
 
 
151 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3610  hypothetical protein  43.75 
 
 
152 aa  120  8e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4182  hypothetical protein  40.97 
 
 
158 aa  120  9e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4492  hypothetical protein  41.67 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126815  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  43.36 
 
 
145 aa  119  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  39.58 
 
 
169 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  39.58 
 
 
169 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  39.58 
 
 
169 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  38.89 
 
 
152 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  37.67 
 
 
151 aa  116  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  36.81 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  37.24 
 
 
153 aa  113  8.999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2516  hypothetical protein  34.38 
 
 
226 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  41.22 
 
 
153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  38.62 
 
 
150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  38.62 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  36.3 
 
 
152 aa  110  8.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  36.3 
 
 
152 aa  110  8.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  38.19 
 
 
153 aa  110  9e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  36.73 
 
 
153 aa  110  9e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  38.89 
 
 
154 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0723  protein of unknown function DUF150  34.72 
 
 
151 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.244111  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  38.19 
 
 
153 aa  110  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  38.19 
 
 
150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  38.19 
 
 
150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  38.19 
 
 
150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  38.19 
 
 
154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  38.89 
 
 
151 aa  109  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  38.19 
 
 
150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  38.19 
 
 
154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  38.19 
 
 
150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  38.19 
 
 
150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  40 
 
 
154 aa  108  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  36.36 
 
 
154 aa  107  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  37.5 
 
 
151 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  37.5 
 
 
150 aa  107  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  37.5 
 
 
150 aa  107  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  37.5 
 
 
150 aa  107  9.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  36.81 
 
 
150 aa  106  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  38.62 
 
 
153 aa  107  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1469  protein of unknown function DUF150  37.91 
 
 
166 aa  105  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000542376  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  37.86 
 
 
140 aa  105  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0583  hypothetical protein  35.53 
 
 
191 aa  105  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0072  hypothetical protein  40.13 
 
 
166 aa  105  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.301721 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0067  hypothetical protein  40.13 
 
 
166 aa  105  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  36.81 
 
 
150 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  36.81 
 
 
150 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  36.81 
 
 
150 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  36.81 
 
 
151 aa  104  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  36.81 
 
 
154 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  36.81 
 
 
154 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  37.67 
 
 
151 aa  104  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0487  hypothetical protein  36.81 
 
 
150 aa  103  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249933  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  38.1 
 
 
176 aa  103  7e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  36.43 
 
 
140 aa  101  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0806  protein of unknown function DUF150  36.43 
 
 
140 aa  101  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  36.11 
 
 
151 aa  100  7e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0155  hypothetical protein  34.18 
 
 
166 aa  100  9e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  38.26 
 
 
161 aa  98.6  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0573  protein of unknown function DUF150  32.65 
 
 
147 aa  95.5  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.300735  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  36.73 
 
 
151 aa  94  7e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0960  hypothetical protein  31.87 
 
 
161 aa  93.6  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  32.41 
 
 
152 aa  93.2  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3730  hypothetical protein  30.86 
 
 
185 aa  93.2  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.233176  normal  0.972926 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1440  protein of unknown function DUF150  41.38 
 
 
154 aa  92.8  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.266374  normal  0.102283 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  37.25 
 
 
159 aa  91.7  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4219  hypothetical protein  35.06 
 
 
169 aa  91.3  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000438537  normal  0.129114 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3915  hypothetical protein  37.14 
 
 
156 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  32.26 
 
 
158 aa  90.9  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01301  hypothetical protein  35.51 
 
 
176 aa  90.9  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1205  protein of unknown function DUF150  32 
 
 
156 aa  90.5  8e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000854014  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1329  hypothetical protein  41.88 
 
 
156 aa  90.5  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000301231  hitchhiker  0.0000903983 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0062  protein of unknown function DUF150  30.37 
 
 
258 aa  90.5  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3639  hypothetical protein  37.14 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000125209  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  33.12 
 
 
159 aa  89.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>