More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3645 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  310  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  310  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  310  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  99.33 
 
 		 154 aa  308  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  99.33 
 
 		 154 aa  308  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  95.33 
 
 		 150 aa  298  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  95.33 
 
 		 150 aa  298  1e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  95.33 
 
 		 150 aa  298  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  95.33 
 
 		 150 aa  298  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  95.33 
 
 		 150 aa  298  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  95.33 
 
 		 150 aa  298  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  94.67 
 
 		 154 aa  297  3e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  94.67 
 
 		 154 aa  297  3e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  92.67 
 
 		 150 aa  290  5e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0487  hypothetical protein  90 
 
 		 150 aa  286  9e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249933  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  91.33 
 
 		 154 aa  286  1e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  90.67 
 
 		 150 aa  285  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  90.67 
 
 		 150 aa  285  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  90.67 
 
 		 150 aa  285  2e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  95 
 
 		 140 aa  279  1e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0583  hypothetical protein  88 
 
 		 191 aa  275  1e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  91.43 
 
 		 140 aa  270  4.0000000000000004e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0806  protein of unknown function DUF150  87.14 
 
 		 140 aa  257  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  73.51 
 
 		 151 aa  232  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  73.51 
 
 		 151 aa  230  4.0000000000000004e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  67.55 
 
 		 151 aa  218  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  66.89 
 
 		 151 aa  213  5.9999999999999996e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  60.93 
 
 		 153 aa  203  6e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  59.87 
 
 		 152 aa  186  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  58.28 
 
 		 151 aa  185  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1126  hypothetical protein  58.28 
 
 		 151 aa  185  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017917  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3282  hypothetical protein  58.28 
 
 		 151 aa  185  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000111408  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0988  hypothetical protein  56.95 
 
 		 165 aa  185  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  58.28 
 
 		 151 aa  185  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  56.95 
 
 		 151 aa  183  6e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  56.95 
 
 		 151 aa  183  6e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  56.29 
 
 		 161 aa  183  9e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  56.95 
 
 		 151 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  56.29 
 
 		 151 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  56.95 
 
 		 151 aa  179  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  56.29 
 
 		 165 aa  179  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  54.97 
 
 		 151 aa  178  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1005  hypothetical protein  54.3 
 
 		 151 aa  175  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0545714  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3062  hypothetical protein  54.3 
 
 		 151 aa  174  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525096  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  53.95 
 
 		 153 aa  168  2e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3563  hypothetical protein  51.66 
 
 		 151 aa  167  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.380474  hitchhiker  0.00000509959 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3391  hypothetical protein  50.99 
 
 		 172 aa  165  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000810372  hitchhiker  0.000625033 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  50.33 
 
 		 151 aa  152  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  48.34 
 
 		 152 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  48.34 
 
 		 152 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  47.68 
 
 		 151 aa  147  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  46.36 
 
 		 153 aa  145  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  43.54 
 
 		 151 aa  144  6e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  48.97 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  49.66 
 
 		 153 aa  140  4e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  48.68 
 
 		 153 aa  140  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  48.34 
 
 		 173 aa  140  9e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  48.67 
 
 		 169 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  48.67 
 
 		 169 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  46.36 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  47.71 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  50.35 
 
 		 145 aa  138  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3610  hypothetical protein  47.02 
 
 		 152 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  48 
 
 		 169 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  45.33 
 
 		 151 aa  137  6e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4182  hypothetical protein  48.67 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1469  protein of unknown function DUF150  44.74 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000542376  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4492  hypothetical protein  48.67 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126815  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0498  protein of unknown function DUF150  40.97 
 
 		 157 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  48.25 
 
 		 151 aa  131  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  44.22 
 
 		 150 aa  130  5e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  46.31 
 
 		 176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  43.84 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  43.26 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  46.97 
 
 		 152 aa  124  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01301  hypothetical protein  47.1 
 
 		 176 aa  120  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2817  hypothetical protein  42.14 
 
 		 196 aa  119  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3160  hypothetical protein  42.86 
 
 		 173 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000242539  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2591  hypothetical protein  43.45 
 
 		 206 aa  116  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2909  hypothetical protein  43.85 
 
 		 203 aa  113  8.999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0723  protein of unknown function DUF150  40.54 
 
 		 151 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  39.71 
 
 		 152 aa  110  9e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1866  hypothetical protein  43.75 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.182542  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1630  hypothetical protein  43.62 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00641879 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0065  hypothetical protein  39.31 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000828588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2754  hypothetical protein  39.71 
 
 		 204 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.229577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0041  hypothetical protein  38.46 
 
 		 194 aa  107  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1287  hypothetical protein  44.37 
 
 		 162 aa  107  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00293096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1208  hypothetical protein  43.05 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.951265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4639  hypothetical protein  42.28 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0564312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1474  hypothetical protein  42.28 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1018  hypothetical protein  42.28 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.680488  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3560  hypothetical protein  40 
 
 		 196 aa  105  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1498  hypothetical protein  42.28 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310765  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1420  hypothetical protein  42.28 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.042517 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2822  hypothetical protein  42.57 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00822471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1115  hypothetical protein  43.05 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473183  normal  0.794169 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1731  hypothetical protein  42.57 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08070  hypothetical protein  35.57 
 
 		 177 aa  105  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0408486  normal  0.217563 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  41.67 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>