More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0960 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0960  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  321  2e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  62.89 
 
 
159 aa  215  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1585  hypothetical protein  64.78 
 
 
159 aa  209  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0279837  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1583  hypothetical protein  62.89 
 
 
159 aa  208  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324016  normal  0.240666 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1299  hypothetical protein  55.62 
 
 
160 aa  186  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000613288  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  59.35 
 
 
159 aa  183  9e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2984  hypothetical protein  55.77 
 
 
160 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.49788e-30 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1552  hypothetical protein  52.47 
 
 
162 aa  156  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175864  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  50 
 
 
158 aa  145  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3192  hypothetical protein  45.16 
 
 
153 aa  142  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000184124  normal  0.0994389 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  49.03 
 
 
154 aa  141  4e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3730  hypothetical protein  42.59 
 
 
185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.233176  normal  0.972926 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1138  hypothetical protein  44.87 
 
 
171 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0279371 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1099  hypothetical protein  42.58 
 
 
171 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1159  protein of unknown function DUF150  42.58 
 
 
171 aa  128  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.710629  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3680  hypothetical protein  44.87 
 
 
152 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000126023  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1227  protein of unknown function DUF150  42.58 
 
 
171 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0995  hypothetical protein  41.06 
 
 
154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000184773  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  45.7 
 
 
176 aa  125  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  46.15 
 
 
161 aa  124  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  40.27 
 
 
152 aa  122  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1961  hypothetical protein  36.48 
 
 
153 aa  121  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00677493  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4219  hypothetical protein  48.12 
 
 
169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000438537  normal  0.129114 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07810  hypothetical protein  43.95 
 
 
159 aa  117  7.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1431  protein of unknown function DUF150  39.51 
 
 
157 aa  117  7.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000199616  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2469  hypothetical protein  39.87 
 
 
156 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000177785  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  40.71 
 
 
165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1329  hypothetical protein  38.61 
 
 
156 aa  115  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000301231  hitchhiker  0.0000903983 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3855  hypothetical protein  37.97 
 
 
156 aa  114  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000468139  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3668  hypothetical protein  37.97 
 
 
156 aa  114  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000060287  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3558  hypothetical protein  37.97 
 
 
156 aa  114  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000119608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3576  hypothetical protein  37.97 
 
 
156 aa  114  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128893  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3954  hypothetical protein  37.97 
 
 
156 aa  114  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000590574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3829  hypothetical protein  37.97 
 
 
156 aa  114  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.0936e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3864  hypothetical protein  37.97 
 
 
156 aa  114  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000526442  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  43.36 
 
 
151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3639  hypothetical protein  36.94 
 
 
156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000125209  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1626  protein of unknown function DUF150  40.52 
 
 
154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2043  hypothetical protein  38.61 
 
 
157 aa  111  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1440  protein of unknown function DUF150  38.85 
 
 
154 aa  111  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.266374  normal  0.102283 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  39.19 
 
 
154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3915  hypothetical protein  37.97 
 
 
156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1066  hypothetical protein  41.29 
 
 
150 aa  111  5e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000674656  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  38.67 
 
 
153 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  37.75 
 
 
151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1226  hypothetical protein  39.61 
 
 
168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00744714  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0832  hypothetical protein  38.82 
 
 
155 aa  108  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0955131  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0573  protein of unknown function DUF150  40 
 
 
147 aa  108  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.300735  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1048  hypothetical protein  36.36 
 
 
151 aa  108  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000120853  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1151  hypothetical protein  37.58 
 
 
157 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962197  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  37.5 
 
 
151 aa  108  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  38 
 
 
152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  42.03 
 
 
151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  42.57 
 
 
151 aa  107  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1046  hypothetical protein  40 
 
 
150 aa  107  5e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000583244  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  38.16 
 
 
153 aa  107  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1649  hypothetical protein  42.55 
 
 
151 aa  107  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296961  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  38 
 
 
152 aa  107  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  37.16 
 
 
152 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  37.16 
 
 
152 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  37.91 
 
 
151 aa  106  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  37.75 
 
 
161 aa  105  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1205  protein of unknown function DUF150  37.42 
 
 
156 aa  105  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000854014  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  40.85 
 
 
140 aa  104  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  39.22 
 
 
153 aa  104  5e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0583  hypothetical protein  42.96 
 
 
191 aa  104  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  36.49 
 
 
169 aa  104  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  36.49 
 
 
169 aa  104  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  38 
 
 
153 aa  104  6e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  40.58 
 
 
151 aa  104  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  40.83 
 
 
173 aa  103  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2778  hypothetical protein  38.41 
 
 
155 aa  103  8e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000007785  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  41.55 
 
 
150 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  41.55 
 
 
140 aa  103  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  41.55 
 
 
154 aa  103  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  41.55 
 
 
154 aa  103  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  41.55 
 
 
150 aa  103  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  41.55 
 
 
150 aa  103  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1351  hypothetical protein  35.53 
 
 
155 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  41.55 
 
 
150 aa  103  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  41.55 
 
 
150 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  41.55 
 
 
150 aa  103  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1325  hypothetical protein  35.53 
 
 
155 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  38.36 
 
 
153 aa  102  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  43.62 
 
 
151 aa  102  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  35.81 
 
 
152 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1005  hypothetical protein  37.75 
 
 
151 aa  102  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0545714  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  40.85 
 
 
154 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0806  protein of unknown function DUF150  42.25 
 
 
140 aa  102  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4182  hypothetical protein  39.17 
 
 
158 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  40.85 
 
 
150 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  40.85 
 
 
150 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  40.85 
 
 
154 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  39.17 
 
 
169 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  40.85 
 
 
154 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  40.85 
 
 
150 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  37.32 
 
 
151 aa  101  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  36.65 
 
 
151 aa  101  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  38.1 
 
 
153 aa  101  5e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3037  hypothetical protein  40 
 
 
181 aa  101  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>