More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4714 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  308  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  98.68 
 
 		 169 aa  305  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  98.68 
 
 		 169 aa  305  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  97.37 
 
 		 169 aa  278  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  83.55 
 
 		 152 aa  271  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  83.55 
 
 		 152 aa  271  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3610  hypothetical protein  85.53 
 
 		 152 aa  249  8.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4182  hypothetical protein  84.87 
 
 		 158 aa  246  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  82.89 
 
 		 173 aa  243  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4492  hypothetical protein  83.55 
 
 		 158 aa  243  9e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126815  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  80.69 
 
 		 145 aa  227  5e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  59.87 
 
 		 153 aa  200  7e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  61.44 
 
 		 153 aa  198  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  64.71 
 
 		 153 aa  195  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  58.94 
 
 		 151 aa  193  6e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  58.28 
 
 		 161 aa  184  5e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  54.97 
 
 		 151 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  54.97 
 
 		 151 aa  176  8e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  53.64 
 
 		 151 aa  176  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  53.29 
 
 		 153 aa  176  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3563  hypothetical protein  52.32 
 
 		 151 aa  175  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.380474  hitchhiker  0.00000509959 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  54.3 
 
 		 151 aa  175  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  54.3 
 
 		 151 aa  175  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  54.3 
 
 		 151 aa  175  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3062  hypothetical protein  51.66 
 
 		 151 aa  174  5e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525096  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3391  hypothetical protein  54.48 
 
 		 172 aa  173  9e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000810372  hitchhiker  0.000625033 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3282  hypothetical protein  54.48 
 
 		 151 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000111408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1126  hypothetical protein  54.48 
 
 		 151 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017917  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  54.48 
 
 		 151 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  54.48 
 
 		 151 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  53.06 
 
 		 151 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0988  hypothetical protein  50.34 
 
 		 165 aa  169  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  53.06 
 
 		 165 aa  168  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1005  hypothetical protein  49.01 
 
 		 151 aa  167  6e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0545714  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  54 
 
 		 151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  50.99 
 
 		 152 aa  161  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  49.02 
 
 		 153 aa  154  4e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  49.66 
 
 		 176 aa  153  8e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  50.67 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0723  protein of unknown function DUF150  49.32 
 
 		 151 aa  151  4e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  48.23 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  45.7 
 
 		 153 aa  147  5e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  46.36 
 
 		 150 aa  147  6e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  46.36 
 
 		 150 aa  147  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  45.03 
 
 		 150 aa  147  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  46.36 
 
 		 150 aa  147  6e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  45.07 
 
 		 152 aa  147  6e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  46.36 
 
 		 150 aa  147  6e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  46.36 
 
 		 150 aa  147  6e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  46.36 
 
 		 150 aa  147  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  46.36 
 
 		 150 aa  147  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  46.36 
 
 		 150 aa  147  6e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  46.36 
 
 		 150 aa  147  6e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  45.03 
 
 		 150 aa  147  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  45.03 
 
 		 150 aa  147  6e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  48 
 
 		 154 aa  145  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  48 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  48 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  48 
 
 		 154 aa  145  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  49.31 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  45.03 
 
 		 153 aa  145  3e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  46.36 
 
 		 151 aa  144  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  44.37 
 
 		 152 aa  144  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  48.23 
 
 		 140 aa  144  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  48.68 
 
 		 151 aa  143  9e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  48.94 
 
 		 140 aa  142  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  44.37 
 
 		 150 aa  142  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  48.3 
 
 		 150 aa  141  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0487  hypothetical protein  43.71 
 
 		 150 aa  141  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249933  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2817  hypothetical protein  47.17 
 
 		 196 aa  140  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  44.44 
 
 		 151 aa  137  7e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  45.89 
 
 		 151 aa  136  7.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  43.71 
 
 		 151 aa  136  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0583  hypothetical protein  44 
 
 		 191 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0806  protein of unknown function DUF150  43.97 
 
 		 140 aa  132  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3192  hypothetical protein  42.86 
 
 		 153 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000184124  normal  0.0994389 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01301  hypothetical protein  52.9 
 
 		 176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3680  hypothetical protein  41.61 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000126023  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  46.97 
 
 		 152 aa  127  7.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0177  hypothetical protein  45.91 
 
 		 199 aa  125  3e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.020604  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1205  protein of unknown function DUF150  41.5 
 
 		 156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000854014  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0201  hypothetical protein  45.91 
 
 		 215 aa  124  5e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0967046  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1944  hypothetical protein  43.26 
 
 		 154 aa  123  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2411  protein of unknown function DUF150  38.89 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1662  hypothetical protein  42.55 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0498  protein of unknown function DUF150  37.58 
 
 		 157 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1440  protein of unknown function DUF150  41.38 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.266374  normal  0.102283 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0155  hypothetical protein  39.38 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1048  hypothetical protein  39.07 
 
 		 151 aa  118  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000120853  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  40.28 
 
 		 161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3160  hypothetical protein  37.97 
 
 		 173 aa  117  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000242539  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1552  hypothetical protein  38.46 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175864  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1226  hypothetical protein  40.56 
 
 		 168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00744714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3560  hypothetical protein  41.89 
 
 		 196 aa  114  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1469  protein of unknown function DUF150  39.19 
 
 		 166 aa  115  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000542376  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  40.27 
 
 		 159 aa  114  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0072  hypothetical protein  38.12 
 
 		 166 aa  114  6e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.301721 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0065  hypothetical protein  42.18 
 
 		 144 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000828588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0067  hypothetical protein  37.5 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1099  hypothetical protein  40.27 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>