More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3160 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3160  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  358  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000242539  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2430  hypothetical protein  47.06 
 
 		 172 aa  161  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.838305 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2516  hypothetical protein  39.9 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0498  protein of unknown function DUF150  45.12 
 
 		 157 aa  144  6e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2411  protein of unknown function DUF150  45.14 
 
 		 162 aa  143  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  41.82 
 
 		 154 aa  128  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  41.4 
 
 		 153 aa  123  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  44.59 
 
 		 153 aa  122  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  44.36 
 
 		 150 aa  121  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  44.36 
 
 		 150 aa  121  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  36.42 
 
 		 151 aa  122  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  36.42 
 
 		 151 aa  122  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  44.36 
 
 		 150 aa  121  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  37.65 
 
 		 151 aa  121  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  39.87 
 
 		 152 aa  120  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  39.87 
 
 		 152 aa  120  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  39.63 
 
 		 161 aa  120  8e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  40 
 
 		 154 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  40 
 
 		 154 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  40.37 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  40.37 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  42.86 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  40.37 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  42.34 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  40.37 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1005  hypothetical protein  37.65 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0545714  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  42.86 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  40.37 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  42.34 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  40.37 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  42.86 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  35.8 
 
 		 151 aa  118  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  35.8 
 
 		 151 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  35.19 
 
 		 151 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0583  hypothetical protein  43.61 
 
 		 191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4182  hypothetical protein  47.24 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0988  hypothetical protein  35.19 
 
 		 165 aa  115  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  40.12 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3563  hypothetical protein  39.51 
 
 		 151 aa  114  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.380474  hitchhiker  0.00000509959 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3062  hypothetical protein  36.42 
 
 		 151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525096  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  35.19 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3391  hypothetical protein  36.59 
 
 		 172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000810372  hitchhiker  0.000625033 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1126  hypothetical protein  35.19 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017917  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3282  hypothetical protein  35.19 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000111408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  35.19 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  45.53 
 
 		 140 aa  112  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  43.09 
 
 		 140 aa  112  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  38.89 
 
 		 151 aa  112  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  39.13 
 
 		 150 aa  112  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4492  hypothetical protein  47.15 
 
 		 158 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126815  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  38.89 
 
 		 151 aa  111  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  39.85 
 
 		 152 aa  111  6e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  38.89 
 
 		 151 aa  111  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0487  hypothetical protein  35.4 
 
 		 150 aa  110  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249933  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3610  hypothetical protein  45.69 
 
 		 152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  39.49 
 
 		 153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  39.1 
 
 		 152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1469  protein of unknown function DUF150  36.75 
 
 		 166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000542376  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0806  protein of unknown function DUF150  43.9 
 
 		 140 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  44.88 
 
 		 173 aa  108  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  38.35 
 
 		 151 aa  107  7.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  38.85 
 
 		 153 aa  107  8.000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  41.73 
 
 		 169 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  41.73 
 
 		 169 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0723  protein of unknown function DUF150  43.41 
 
 		 151 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  41.48 
 
 		 153 aa  106  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  34.15 
 
 		 153 aa  106  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  40.94 
 
 		 169 aa  104  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  42.24 
 
 		 152 aa  104  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  38.27 
 
 		 176 aa  104  7e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  44.14 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  43.44 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  35.9 
 
 		 151 aa  101  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  35.71 
 
 		 151 aa  100  9e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1552  hypothetical protein  37.13 
 
 		 162 aa  99.8  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175864  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  31.9 
 
 		 152 aa  99.8  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0155  hypothetical protein  36.47 
 
 		 166 aa  99  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  37.5 
 
 		 154 aa  98.2  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  37.34 
 
 		 150 aa  95.9  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  35.56 
 
 		 165 aa  95.1  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0067  hypothetical protein  36.26 
 
 		 166 aa  95.1  5e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  35.54 
 
 		 159 aa  94.7  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  33.12 
 
 		 151 aa  94.4  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  33.93 
 
 		 161 aa  94.4  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2591  hypothetical protein  38.04 
 
 		 206 aa  92  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  34.76 
 
 		 154 aa  91.7  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0072  hypothetical protein  35.09 
 
 		 166 aa  92  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.301721 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0995  hypothetical protein  42.98 
 
 		 154 aa  90.9  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000184773  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1138  hypothetical protein  36.63 
 
 		 171 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0279371 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0573  protein of unknown function DUF150  35.16 
 
 		 147 aa  90.1  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.300735  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0062  protein of unknown function DUF150  29.11 
 
 		 258 aa  89.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2754  hypothetical protein  36.69 
 
 		 204 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.229577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07810  hypothetical protein  33.94 
 
 		 159 aa  89.4  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  35.46 
 
 		 152 aa  89.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08070  hypothetical protein  35.44 
 
 		 177 aa  89.4  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0408486  normal  0.217563 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2909  hypothetical protein  36.64 
 
 		 203 aa  89  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  37.01 
 
 		 151 aa  87.8  6e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1162  hypothetical protein  35.34 
 
 		 204 aa  87.8  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0960  hypothetical protein  38.46 
 
 		 161 aa  87.4  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2823  hypothetical protein  35.34 
 
 		 204 aa  87.4  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>