More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0995 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0995  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  303  7e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000184773  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  68.42 
 
 		 152 aa  223  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1649  hypothetical protein  59.73 
 
 		 151 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296961  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3192  hypothetical protein  51.32 
 
 		 153 aa  163  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000184124  normal  0.0994389 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1961  hypothetical protein  49.67 
 
 		 153 aa  159  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00677493  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1431  protein of unknown function DUF150  46.5 
 
 		 157 aa  157  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000199616  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2778  hypothetical protein  50.97 
 
 		 155 aa  157  7e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000007785  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3639  hypothetical protein  48.05 
 
 		 156 aa  153  7e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000125209  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2469  hypothetical protein  47.4 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000177785  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0695  hypothetical protein  46.05 
 
 		 157 aa  150  4e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000302569  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3915  hypothetical protein  46.75 
 
 		 156 aa  150  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1329  hypothetical protein  46.75 
 
 		 156 aa  150  8e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000301231  hitchhiker  0.0000903983 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3855  hypothetical protein  46.1 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000468139  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3829  hypothetical protein  46.1 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.0936e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3668  hypothetical protein  46.1 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000060287  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3558  hypothetical protein  46.1 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000119608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3576  hypothetical protein  46.1 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128893  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3954  hypothetical protein  46.1 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000590574  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3864  hypothetical protein  46.1 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000526442  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3680  hypothetical protein  50.34 
 
 		 152 aa  147  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000126023  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  48.53 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  43.51 
 
 		 154 aa  145  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  43.24 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1151  hypothetical protein  44.16 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962197  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2043  hypothetical protein  42.86 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1048  hypothetical protein  54.55 
 
 		 151 aa  134  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000120853  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1585  hypothetical protein  45.03 
 
 		 159 aa  134  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0279837  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1205  protein of unknown function DUF150  47.59 
 
 		 156 aa  133  8e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000854014  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1440  protein of unknown function DUF150  42.47 
 
 		 154 aa  130  6e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.266374  normal  0.102283 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1138  hypothetical protein  43.97 
 
 		 171 aa  130  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0279371 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1583  hypothetical protein  42.38 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324016  normal  0.240666 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0960  hypothetical protein  41.06 
 
 		 161 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1552  hypothetical protein  45.45 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175864  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  43.18 
 
 		 176 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  42.95 
 
 		 159 aa  124  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0832  hypothetical protein  42 
 
 		 155 aa  123  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0955131  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1227  protein of unknown function DUF150  41.33 
 
 		 171 aa  121  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1351  hypothetical protein  42.67 
 
 		 155 aa  120  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1325  hypothetical protein  42.67 
 
 		 155 aa  120  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1099  hypothetical protein  41.33 
 
 		 171 aa  120  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1159  protein of unknown function DUF150  41.33 
 
 		 171 aa  120  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.710629  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07810  hypothetical protein  41.72 
 
 		 159 aa  120  9e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4219  hypothetical protein  50.78 
 
 		 169 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000438537  normal  0.129114 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  42.45 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0810  hypothetical protein  40 
 
 		 172 aa  115  3e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0615439  hitchhiker  0.00120973 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  42.42 
 
 		 165 aa  114  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  44.92 
 
 		 152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  42.75 
 
 		 153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  44.92 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  41.98 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  43.75 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  41.98 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  43.66 
 
 		 159 aa  111  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1299  hypothetical protein  43.42 
 
 		 160 aa  111  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000613288  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2984  hypothetical protein  44.74 
 
 		 160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.49788e-30 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0773  protein of unknown function DUF150  41.33 
 
 		 164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  40 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0573  protein of unknown function DUF150  48.44 
 
 		 147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.300735  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1944  hypothetical protein  39.86 
 
 		 154 aa  107  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  42.61 
 
 		 151 aa  107  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1662  hypothetical protein  39.13 
 
 		 154 aa  107  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  46.09 
 
 		 169 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  46.09 
 
 		 169 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  39.52 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  39.52 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  45.38 
 
 		 173 aa  106  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0389  lipoprotein, putative  41.67 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.281265  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0553  protein of unknown function DUF150  41.67 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.169356 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  39.1 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0379  hypothetical protein  37.82 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000399241  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3610  hypothetical protein  44.35 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4182  hypothetical protein  44.35 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  45.22 
 
 		 169 aa  104  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  45.22 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2909  hypothetical protein  39.39 
 
 		 203 aa  105  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  46.02 
 
 		 145 aa  105  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  38.36 
 
 		 151 aa  103  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  43.22 
 
 		 161 aa  103  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  37.58 
 
 		 151 aa  103  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2591  hypothetical protein  43.09 
 
 		 206 aa  103  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4492  hypothetical protein  44.35 
 
 		 158 aa  103  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126815  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  37.04 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  40.16 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1626  protein of unknown function DUF150  38.93 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0296  hypothetical protein  38.06 
 
 		 286 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299993  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  40.15 
 
 		 153 aa  100  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1226  hypothetical protein  38.74 
 
 		 168 aa  101  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00744714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1469  protein of unknown function DUF150  38.35 
 
 		 166 aa  99.4  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000542376  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  36.92 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2754  hypothetical protein  37.4 
 
 		 204 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.229577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  40.46 
 
 		 154 aa  99.4  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  40.46 
 
 		 150 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  40.46 
 
 		 150 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  40.46 
 
 		 154 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  40.46 
 
 		 150 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  40.46 
 
 		 154 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  40.46 
 
 		 150 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  40.46 
 
 		 150 aa  98.2  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  40.46 
 
 		 150 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1162  hypothetical protein  38.17 
 
 		 204 aa  98.2  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>