More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0553 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0553  protein of unknown function DUF150  100 
 
 		 153 aa  314  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.169356 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0389  lipoprotein, putative  99.33 
 
 		 150 aa  306  5e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.281265  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  49.18 
 
 		 153 aa  119  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  42.21 
 
 		 153 aa  119  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  44.26 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  44.44 
 
 		 152 aa  110  9e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  39.87 
 
 		 151 aa  110  9e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  44.44 
 
 		 152 aa  110  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0995  hypothetical protein  41.67 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000184773  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  38.56 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  39.22 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  39.22 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  39.22 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  39.22 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  39.22 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  39.22 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  38.56 
 
 		 150 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  38.56 
 
 		 150 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  38.56 
 
 		 150 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  38.56 
 
 		 151 aa  103  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1690  hypothetical protein  44.14 
 
 		 144 aa  103  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332685  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  37.25 
 
 		 151 aa  103  7e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  39.74 
 
 		 154 aa  103  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  39.07 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  41.79 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  38.41 
 
 		 154 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2909  hypothetical protein  41.41 
 
 		 203 aa  103  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  40.4 
 
 		 176 aa  102  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  38.41 
 
 		 154 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  39.07 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  44.63 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2454  hypothetical protein  44.44 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00782404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3563  hypothetical protein  37.91 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.380474  hitchhiker  0.00000509959 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3856  protein of unknown function DUF150  42.11 
 
 		 209 aa  102  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.113765  normal  0.0726856 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  38.56 
 
 		 150 aa  101  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  38.56 
 
 		 150 aa  101  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  38.56 
 
 		 150 aa  101  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  35.95 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  36.6 
 
 		 151 aa  100  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  42.86 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0487  hypothetical protein  37.91 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249933  normal  0.270072 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  41.04 
 
 		 140 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3560  hypothetical protein  41.22 
 
 		 196 aa  99  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0021  hypothetical protein  40.85 
 
 		 260 aa  99  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0581916 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1552  hypothetical protein  43.17 
 
 		 162 aa  99  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175864  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  37.41 
 
 		 153 aa  97.8  5e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  36.57 
 
 		 151 aa  97.4  6e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3778  hypothetical protein  47.52 
 
 		 225 aa  97.1  7e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  35.95 
 
 		 161 aa  97.4  7e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  40.48 
 
 		 151 aa  97.1  8e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1205  protein of unknown function DUF150  38.17 
 
 		 156 aa  97.1  8e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000854014  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1731  hypothetical protein  48.18 
 
 		 152 aa  97.1  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1005  hypothetical protein  38.31 
 
 		 151 aa  97.1  9e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0545714  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  35.1 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  37.41 
 
 		 153 aa  96.3  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3391  hypothetical protein  35.95 
 
 		 172 aa  96.3  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000810372  hitchhiker  0.000625033 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3040  hypothetical protein  45.1 
 
 		 178 aa  96.3  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3192  hypothetical protein  37.8 
 
 		 153 aa  96.7  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000184124  normal  0.0994389 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  35.95 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  43.2 
 
 		 152 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0583  hypothetical protein  37.09 
 
 		 191 aa  95.9  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  37.01 
 
 		 150 aa  95.5  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  37.25 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0041  hypothetical protein  39.82 
 
 		 194 aa  95.5  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1630  hypothetical protein  46.1 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00641879 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1126  hypothetical protein  37.25 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017917  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  37.25 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3282  hypothetical protein  37.25 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000111408  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  38.56 
 
 		 161 aa  95.1  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  43.2 
 
 		 169 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0030  hypothetical protein  43.97 
 
 		 199 aa  94.4  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.906317  normal  0.667348 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  36.6 
 
 		 151 aa  94.4  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0296  hypothetical protein  41.67 
 
 		 286 aa  94  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299993  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  42.4 
 
 		 169 aa  94  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  42.4 
 
 		 169 aa  94  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  44.26 
 
 		 173 aa  94  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  41.35 
 
 		 158 aa  94  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  40.44 
 
 		 159 aa  94  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3625  hypothetical protein  42.06 
 
 		 207 aa  93.6  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443103 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  35.95 
 
 		 151 aa  93.6  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  35.95 
 
 		 151 aa  93.6  9e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4639  hypothetical protein  44.93 
 
 		 152 aa  92.8  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0564312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1757  hypothetical protein  45 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.47468  normal  0.0284791 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1299  hypothetical protein  39.61 
 
 		 160 aa  93.6  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000613288  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2984  hypothetical protein  39.61 
 
 		 160 aa  93.2  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.49788e-30 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0960  hypothetical protein  43.61 
 
 		 161 aa  93.6  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  41.8 
 
 		 153 aa  93.2  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0806  protein of unknown function DUF150  37.32 
 
 		 140 aa  92  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1420  hypothetical protein  44.93 
 
 		 152 aa  92.8  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.042517 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  33.99 
 
 		 165 aa  92  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1162  hypothetical protein  40 
 
 		 204 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2822  hypothetical protein  45.71 
 
 		 152 aa  92.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00822471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1380  hypothetical protein  44.93 
 
 		 152 aa  92.8  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.449131  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  35.95 
 
 		 151 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  44.44 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1474  hypothetical protein  45.31 
 
 		 152 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  42.65 
 
 		 159 aa  92  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0234  hypothetical protein  41.13 
 
 		 262 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1498  hypothetical protein  45.31 
 
 		 152 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>