More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1944 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1944  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  308  1e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1662  hypothetical protein  99.35 
 
 		 154 aa  308  2e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  41.84 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  41.84 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3680  hypothetical protein  43.33 
 
 		 152 aa  118  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000126023  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3192  hypothetical protein  39.61 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000184124  normal  0.0994389 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  40.14 
 
 		 161 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2778  hypothetical protein  41.33 
 
 		 155 aa  113  8.999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000007785  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  39.01 
 
 		 151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  38.78 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  38.73 
 
 		 176 aa  110  6e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1440  protein of unknown function DUF150  40.4 
 
 		 154 aa  110  7.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.266374  normal  0.102283 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1961  hypothetical protein  40.26 
 
 		 153 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00677493  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  42.55 
 
 		 169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  43.26 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3610  hypothetical protein  41.84 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  43.26 
 
 		 169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  43.26 
 
 		 169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  38.3 
 
 		 151 aa  109  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  41.55 
 
 		 173 aa  108  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  39.16 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  35.17 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0995  hypothetical protein  39.86 
 
 		 154 aa  107  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000184773  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2319  protein of unknown function DUF150  40.14 
 
 		 157 aa  106  9.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0432974  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  36.88 
 
 		 151 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  38.13 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  38.57 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07810  hypothetical protein  39.86 
 
 		 159 aa  104  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  37.06 
 
 		 153 aa  103  7e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4492  hypothetical protein  40.43 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126815  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  37.32 
 
 		 152 aa  102  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  39.72 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  37.59 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4182  hypothetical protein  40.43 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  41.43 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1552  hypothetical protein  36.25 
 
 		 162 aa  101  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175864  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  36.88 
 
 		 153 aa  100  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  36.62 
 
 		 152 aa  100  7e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  38.03 
 
 		 153 aa  100  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3062  hypothetical protein  38.3 
 
 		 151 aa  100  7e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525096  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  39.29 
 
 		 151 aa  100  8e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1138  hypothetical protein  34.97 
 
 		 171 aa  100  9e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0279371 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  40 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1048  hypothetical protein  39.04 
 
 		 151 aa  99  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000120853  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  40 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  40 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  40 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  40 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  40 
 
 		 154 aa  99  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  40 
 
 		 154 aa  99  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  40 
 
 		 154 aa  99  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  40 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1431  protein of unknown function DUF150  38.96 
 
 		 157 aa  98.6  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000199616  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  39.29 
 
 		 151 aa  98.6  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  39.86 
 
 		 140 aa  98.2  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1226  hypothetical protein  34.9 
 
 		 168 aa  98.2  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00744714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  38.12 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  39.72 
 
 		 151 aa  98.2  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1325  hypothetical protein  33.78 
 
 		 155 aa  98.2  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0988  hypothetical protein  34.75 
 
 		 165 aa  98.2  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1351  hypothetical protein  33.78 
 
 		 155 aa  98.2  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  41.84 
 
 		 150 aa  97.8  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  35.81 
 
 		 151 aa  97.8  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1159  protein of unknown function DUF150  33.97 
 
 		 171 aa  97.8  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.710629  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  39.86 
 
 		 140 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  40 
 
 		 150 aa  97.4  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1099  hypothetical protein  33.97 
 
 		 171 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0487  hypothetical protein  40 
 
 		 150 aa  97.4  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249933  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1585  hypothetical protein  37.5 
 
 		 159 aa  97.4  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0279837  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1649  hypothetical protein  42.54 
 
 		 151 aa  97.1  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296961  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  35.46 
 
 		 151 aa  96.7  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  35.46 
 
 		 151 aa  96.7  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  40 
 
 		 154 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  35.14 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3625  hypothetical protein  38.4 
 
 		 207 aa  96.7  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443103 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  40 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  40 
 
 		 154 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  40 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  35.14 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  40 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0832  hypothetical protein  34.46 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0955131  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1227  protein of unknown function DUF150  33.97 
 
 		 171 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3563  hypothetical protein  34.04 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.380474  hitchhiker  0.00000509959 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3639  hypothetical protein  36.55 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000125209  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  35.92 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  37.86 
 
 		 150 aa  95.5  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  37.86 
 
 		 150 aa  95.5  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1329  hypothetical protein  36.55 
 
 		 156 aa  95.5  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000301231  hitchhiker  0.0000903983 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  37.86 
 
 		 150 aa  95.5  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3855  hypothetical protein  35.86 
 
 		 156 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000468139  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3668  hypothetical protein  35.86 
 
 		 156 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000060287  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3558  hypothetical protein  35.86 
 
 		 156 aa  94.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000119608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3576  hypothetical protein  35.86 
 
 		 156 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128893  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  36.99 
 
 		 151 aa  94.7  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3954  hypothetical protein  35.86 
 
 		 156 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000590574  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3864  hypothetical protein  35.86 
 
 		 156 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000526442  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3829  hypothetical protein  35.86 
 
 		 156 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.0936e-62 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0583  hypothetical protein  39.29 
 
 		 191 aa  94.4  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3282  hypothetical protein  36.43 
 
 		 151 aa  94.4  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000111408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  36.43 
 
 		 151 aa  94.4  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>