More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0815 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  314  3e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  62.25 
 
 		 154 aa  207  4e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  62.91 
 
 		 151 aa  207  4e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  62.91 
 
 		 150 aa  207  5e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  62.91 
 
 		 150 aa  207  5e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  62.91 
 
 		 150 aa  207  5e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  62.91 
 
 		 150 aa  207  5e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  62.91 
 
 		 150 aa  207  5e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  62.91 
 
 		 150 aa  207  5e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  62.25 
 
 		 154 aa  206  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  62.25 
 
 		 154 aa  206  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  61.59 
 
 		 151 aa  204  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  62.91 
 
 		 151 aa  204  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  60.93 
 
 		 150 aa  203  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  60.93 
 
 		 150 aa  203  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  60.93 
 
 		 150 aa  203  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  61.59 
 
 		 150 aa  203  6e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  60.26 
 
 		 154 aa  202  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  60.26 
 
 		 150 aa  202  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  60.26 
 
 		 154 aa  202  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  60.26 
 
 		 150 aa  202  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0487  hypothetical protein  61.59 
 
 		 150 aa  202  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249933  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  60.26 
 
 		 150 aa  202  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  60.93 
 
 		 151 aa  202  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0583  hypothetical protein  60.93 
 
 		 191 aa  200  7e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  64.54 
 
 		 140 aa  197  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  57.24 
 
 		 165 aa  196  9e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  63.12 
 
 		 140 aa  192  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  56.95 
 
 		 151 aa  190  7e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0806  protein of unknown function DUF150  62.41 
 
 		 140 aa  189  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1005  hypothetical protein  54.97 
 
 		 151 aa  187  4e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0545714  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  55.63 
 
 		 151 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  55.26 
 
 		 152 aa  186  8e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  55.63 
 
 		 151 aa  186  8e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  55.63 
 
 		 151 aa  186  8e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  55.63 
 
 		 151 aa  186  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3062  hypothetical protein  54.97 
 
 		 151 aa  185  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525096  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  54.97 
 
 		 151 aa  184  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3282  hypothetical protein  54.97 
 
 		 151 aa  183  6e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000111408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1126  hypothetical protein  54.97 
 
 		 151 aa  183  6e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017917  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  54.97 
 
 		 151 aa  183  6e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  54.97 
 
 		 151 aa  183  6e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  53.64 
 
 		 161 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3563  hypothetical protein  54.3 
 
 		 151 aa  181  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.380474  hitchhiker  0.00000509959 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0988  hypothetical protein  52.98 
 
 		 165 aa  181  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3391  hypothetical protein  54.97 
 
 		 172 aa  180  7e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000810372  hitchhiker  0.000625033 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  55.26 
 
 		 152 aa  176  8e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  55.26 
 
 		 152 aa  176  8e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  50.98 
 
 		 153 aa  174  3e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  50.99 
 
 		 151 aa  171  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  51.33 
 
 		 151 aa  170  5.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  54.42 
 
 		 169 aa  167  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  54.42 
 
 		 169 aa  167  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  53.29 
 
 		 152 aa  167  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  53.74 
 
 		 169 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  48.37 
 
 		 153 aa  165  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3610  hypothetical protein  49.34 
 
 		 152 aa  159  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4182  hypothetical protein  50 
 
 		 158 aa  157  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4492  hypothetical protein  49.34 
 
 		 158 aa  156  8e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126815  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  51.72 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  50.66 
 
 		 173 aa  154  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  49.67 
 
 		 151 aa  153  9e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  49.67 
 
 		 153 aa  152  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  50.68 
 
 		 153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  47.92 
 
 		 152 aa  150  5.9999999999999996e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  47.92 
 
 		 152 aa  149  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  46.98 
 
 		 176 aa  147  4e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  45.58 
 
 		 153 aa  146  8e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  45.58 
 
 		 153 aa  144  6e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  47.89 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  43.54 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  47.55 
 
 		 151 aa  132  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0498  protein of unknown function DUF150  39.31 
 
 		 157 aa  131  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  43.24 
 
 		 161 aa  130  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1469  protein of unknown function DUF150  41.18 
 
 		 166 aa  130  7.999999999999999e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000542376  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  41.61 
 
 		 150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2817  hypothetical protein  47.37 
 
 		 196 aa  127  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2909  hypothetical protein  45.71 
 
 		 203 aa  127  6e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  40.94 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0723  protein of unknown function DUF150  39.86 
 
 		 151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2591  hypothetical protein  45.59 
 
 		 206 aa  121  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0553  protein of unknown function DUF150  42.21 
 
 		 153 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.169356 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01301  hypothetical protein  47.1 
 
 		 176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0389  lipoprotein, putative  42.38 
 
 		 150 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.281265  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3192  hypothetical protein  40.15 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000184124  normal  0.0994389 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1630  hypothetical protein  42.67 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00641879 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3560  hypothetical protein  43.51 
 
 		 196 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1813  protein of unknown function DUF150  36.18 
 
 		 159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.549773  normal  0.686814 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  39.6 
 
 		 158 aa  114  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1731  hypothetical protein  42 
 
 		 152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1099  hypothetical protein  39.47 
 
 		 171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0041  hypothetical protein  38.57 
 
 		 194 aa  112  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0995  hypothetical protein  42.75 
 
 		 154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000184773  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2754  hypothetical protein  40.88 
 
 		 204 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.229577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1227  protein of unknown function DUF150  39.47 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2822  hypothetical protein  41.33 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00822471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1159  protein of unknown function DUF150  39.47 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.710629  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0699  hypothetical protein  42.25 
 
 		 161 aa  111  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.188397  normal  0.319675 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1866  hypothetical protein  40.97 
 
 		 142 aa  111  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.182542  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1138  hypothetical protein  38.16 
 
 		 171 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0279371 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>