More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2591 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2591  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  407  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2909  hypothetical protein  74.51 
 
 		 203 aa  287  7e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0041  hypothetical protein  72.68 
 
 		 194 aa  284  5.999999999999999e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2754  hypothetical protein  72.14 
 
 		 204 aa  279  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.229577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1162  hypothetical protein  71.35 
 
 		 204 aa  267  8e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2823  hypothetical protein  70.83 
 
 		 204 aa  266  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3560  hypothetical protein  67.18 
 
 		 196 aa  256  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0030  hypothetical protein  53.8 
 
 		 199 aa  174  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.906317  normal  0.667348 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4390  hypothetical protein  48.65 
 
 		 201 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3625  hypothetical protein  50.57 
 
 		 207 aa  170  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443103 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4070  hypothetical protein  46.49 
 
 		 201 aa  164  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3438  hypothetical protein  48.48 
 
 		 205 aa  160  9e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2822  protein of unknown function DUF150  45.88 
 
 		 255 aa  160  9e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.189115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3927  hypothetical protein  49.44 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0296  hypothetical protein  46.56 
 
 		 286 aa  160  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299993  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2067  hypothetical protein  51.11 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.677656 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2700  hypothetical protein  48.84 
 
 		 251 aa  159  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.765292 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2926  protein of unknown function DUF150  48.84 
 
 		 251 aa  159  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4615  protein of unknown function DUF150  45.09 
 
 		 238 aa  158  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130835  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2162  hypothetical protein  47.43 
 
 		 219 aa  157  7e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.213663  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2074  hypothetical protein  47.43 
 
 		 219 aa  157  7e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0717176  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0750  hypothetical protein  48.02 
 
 		 224 aa  157  8e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.251451  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0164  hypothetical protein  48.26 
 
 		 204 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2614  hypothetical protein  43.85 
 
 		 201 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3730  hypothetical protein  47.13 
 
 		 257 aa  153  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401483  normal  0.0819057 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0477  hypothetical protein  46.33 
 
 		 272 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.981594  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3040  hypothetical protein  48.82 
 
 		 178 aa  152  4e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0234  hypothetical protein  43.5 
 
 		 262 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1050  hypothetical protein  44.75 
 
 		 314 aa  150  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1251  hypothetical protein  41.08 
 
 		 209 aa  149  2e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2298  protein of unknown function DUF150  46.75 
 
 		 279 aa  149  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.022015 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0028  hypothetical protein  38.5 
 
 		 263 aa  148  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0443  hypothetical protein  44.38 
 
 		 259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0597  hypothetical protein  43.5 
 
 		 259 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0021  hypothetical protein  47.5 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0581916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0054  hypothetical protein  44.1 
 
 		 253 aa  140  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.454767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3778  hypothetical protein  44.31 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0222  hypothetical protein  43.9 
 
 		 201 aa  132  5e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0609  hypothetical protein  46.63 
 
 		 181 aa  128  7.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3820  hypothetical protein  40.43 
 
 		 186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.646345  normal  0.0215546 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2493  hypothetical protein  47.02 
 
 		 186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0301958  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  45.59 
 
 		 153 aa  121  9e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  45.6 
 
 		 151 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  45.52 
 
 		 150 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  44.9 
 
 		 154 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  45.52 
 
 		 150 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  45.52 
 
 		 150 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  44.9 
 
 		 154 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  45.52 
 
 		 150 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  45.52 
 
 		 150 aa  117  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  45.52 
 
 		 150 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  42.86 
 
 		 154 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  43.45 
 
 		 150 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  42.86 
 
 		 154 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  43.45 
 
 		 150 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  43.45 
 
 		 150 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  45.45 
 
 		 153 aa  115  6e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  46.15 
 
 		 153 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  45.16 
 
 		 154 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  44.26 
 
 		 151 aa  111  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  47.41 
 
 		 140 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  44.7 
 
 		 151 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  40.85 
 
 		 152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  42.48 
 
 		 165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0487  hypothetical protein  42.07 
 
 		 150 aa  110  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249933  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  45.93 
 
 		 140 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  38.16 
 
 		 158 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  42.37 
 
 		 153 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  37.68 
 
 		 152 aa  109  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  43.8 
 
 		 153 aa  109  3e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  41.38 
 
 		 150 aa  108  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  43.8 
 
 		 153 aa  108  5e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  41.25 
 
 		 176 aa  108  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  40 
 
 		 150 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  36.67 
 
 		 152 aa  107  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  42.98 
 
 		 151 aa  107  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  44.17 
 
 		 151 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1126  hypothetical protein  44.17 
 
 		 151 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017917  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  44.17 
 
 		 151 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3282  hypothetical protein  44.17 
 
 		 151 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000111408  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  40.28 
 
 		 151 aa  106  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  38.65 
 
 		 159 aa  106  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  48.72 
 
 		 153 aa  106  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1552  hypothetical protein  42.22 
 
 		 162 aa  105  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175864  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  40.69 
 
 		 150 aa  105  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  40.69 
 
 		 150 aa  105  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  40.69 
 
 		 150 aa  105  6e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  45.22 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  43.22 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  43.22 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0995  hypothetical protein  43.09 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000184773  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  45.22 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  42.15 
 
 		 151 aa  103  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  45.04 
 
 		 151 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0583  hypothetical protein  41.67 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  42.5 
 
 		 151 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  41.67 
 
 		 151 aa  102  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0988  hypothetical protein  40.83 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  41.67 
 
 		 151 aa  102  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  44.83 
 
 		 151 aa  102  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>