270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2516 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2516  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  449  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2430  hypothetical protein  50.26 
 
 		 172 aa  189  4e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.838305 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3160  hypothetical protein  39.9 
 
 		 173 aa  146  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000242539  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0062  protein of unknown function DUF150  36.87 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0498  protein of unknown function DUF150  38.5 
 
 		 157 aa  116  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2411  protein of unknown function DUF150  34.38 
 
 		 162 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  33.69 
 
 		 153 aa  103  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  31.61 
 
 		 151 aa  92.8  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  33.33 
 
 		 161 aa  92.4  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  31.61 
 
 		 151 aa  92.4  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  31.61 
 
 		 151 aa  92.4  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  31.61 
 
 		 151 aa  92.4  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  32.77 
 
 		 151 aa  92  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  31.61 
 
 		 151 aa  92  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3563  hypothetical protein  32.57 
 
 		 151 aa  91.7  9e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.380474  hitchhiker  0.00000509959 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1005  hypothetical protein  32.18 
 
 		 151 aa  90.1  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0545714  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  32.2 
 
 		 153 aa  89.4  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  31.77 
 
 		 151 aa  88.2  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3282  hypothetical protein  31.77 
 
 		 151 aa  88.2  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000111408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  31.77 
 
 		 151 aa  88.2  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1126  hypothetical protein  31.77 
 
 		 151 aa  88.2  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017917  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3062  hypothetical protein  30.65 
 
 		 151 aa  88.2  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525096  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3391  hypothetical protein  30.86 
 
 		 172 aa  88.2  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000810372  hitchhiker  0.000625033 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0155  hypothetical protein  34.44 
 
 		 166 aa  87.8  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  32.97 
 
 		 152 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  32.05 
 
 		 153 aa  87  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  32.97 
 
 		 152 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0988  hypothetical protein  32 
 
 		 165 aa  84  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3610  hypothetical protein  34.51 
 
 		 152 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  32.95 
 
 		 154 aa  84  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0723  protein of unknown function DUF150  31.17 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  37.32 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  34.29 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  31.76 
 
 		 151 aa  81.3  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  31.67 
 
 		 153 aa  81.3  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0067  hypothetical protein  31.84 
 
 		 166 aa  80.9  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  32.45 
 
 		 150 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  32.45 
 
 		 150 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  32.45 
 
 		 150 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4182  hypothetical protein  36.5 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  32.22 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  27.27 
 
 		 152 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  32.64 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  32.39 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  32.39 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  31.15 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0583  hypothetical protein  34.83 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0072  hypothetical protein  31.28 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.301721 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  31.91 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4492  hypothetical protein  35.21 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126815  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  31.91 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  31.91 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  31.91 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  31.91 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  31.91 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  31.69 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  30.52 
 
 		 154 aa  78.2  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  30.77 
 
 		 152 aa  77.8  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0806  protein of unknown function DUF150  33.71 
 
 		 140 aa  78.2  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  29.53 
 
 		 151 aa  78.2  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  32.16 
 
 		 140 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  31.15 
 
 		 154 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  31.69 
 
 		 152 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  30.99 
 
 		 151 aa  77  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  31.15 
 
 		 154 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  31.82 
 
 		 140 aa  77.4  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  31.02 
 
 		 161 aa  77.4  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  30.99 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  30.94 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  28.93 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  28.95 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  31.38 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  31.38 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  31.38 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  29.28 
 
 		 150 aa  74.7  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  30.6 
 
 		 154 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  30.13 
 
 		 152 aa  74.3  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  30.99 
 
 		 150 aa  74.7  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2817  hypothetical protein  28.57 
 
 		 196 aa  74.7  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  30.6 
 
 		 154 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  29.19 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01301  hypothetical protein  31.25 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  28.82 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  30.73 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3730  hypothetical protein  35.04 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.233176  normal  0.972926 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1585  hypothetical protein  36.18 
 
 		 159 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0279837  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1469  protein of unknown function DUF150  26.79 
 
 		 166 aa  70.9  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000542376  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0487  hypothetical protein  30 
 
 		 150 aa  71.6  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249933  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  28.85 
 
 		 153 aa  70.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0960  hypothetical protein  33.56 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3927  hypothetical protein  30.94 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0443  hypothetical protein  35.48 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0234  hypothetical protein  32.19 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  32.85 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0573  protein of unknown function DUF150  26.37 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.300735  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0389  lipoprotein, putative  36.64 
 
 		 150 aa  68.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.281265  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0553  protein of unknown function DUF150  36.64 
 
 		 153 aa  68.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.169356 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2926  protein of unknown function DUF150  37.01 
 
 		 251 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2700  hypothetical protein  37.01 
 
 		 251 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.765292 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>