More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01301 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01301  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  356  9.999999999999999e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2817  hypothetical protein  74.43 
 
 		 196 aa  270  7e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0177  hypothetical protein  61.76 
 
 		 199 aa  219  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.020604  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0201  hypothetical protein  61.18 
 
 		 215 aa  218  3e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0967046  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  55.15 
 
 		 152 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  55.15 
 
 		 152 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  47.48 
 
 		 150 aa  123  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  46.04 
 
 		 151 aa  123  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3282  hypothetical protein  45.32 
 
 		 151 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000111408  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  47.48 
 
 		 154 aa  123  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  45.32 
 
 		 151 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  47.48 
 
 		 150 aa  123  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1126  hypothetical protein  45.32 
 
 		 151 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017917  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  47.48 
 
 		 150 aa  123  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  47.48 
 
 		 154 aa  123  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  47.48 
 
 		 150 aa  123  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  47.48 
 
 		 150 aa  123  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  45.32 
 
 		 151 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  47.48 
 
 		 150 aa  123  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  47.48 
 
 		 140 aa  122  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  45.32 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  45.32 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  45.32 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0487  hypothetical protein  46.04 
 
 		 150 aa  122  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249933  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  53.62 
 
 		 169 aa  121  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  53.62 
 
 		 169 aa  121  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  47.1 
 
 		 150 aa  120  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  47.1 
 
 		 154 aa  120  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  47.1 
 
 		 150 aa  120  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  47.1 
 
 		 154 aa  120  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  47.1 
 
 		 150 aa  120  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  45.26 
 
 		 151 aa  120  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  45.26 
 
 		 161 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  43.17 
 
 		 151 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0988  hypothetical protein  44.6 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  52.9 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  52.9 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  43.88 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  45.65 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  46.38 
 
 		 151 aa  119  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  44.93 
 
 		 150 aa  118  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  47.1 
 
 		 153 aa  119  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  46.38 
 
 		 140 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  45.19 
 
 		 151 aa  117  7e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  44.93 
 
 		 150 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  44.93 
 
 		 150 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  44.6 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  44.93 
 
 		 150 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  49.63 
 
 		 176 aa  116  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  45.65 
 
 		 151 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3062  hypothetical protein  42.75 
 
 		 151 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525096  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  45.65 
 
 		 154 aa  115  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  44.93 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  43.17 
 
 		 165 aa  114  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  44.6 
 
 		 151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1005  hypothetical protein  42.45 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0545714  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0806  protein of unknown function DUF150  44.2 
 
 		 140 aa  112  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3391  hypothetical protein  44.53 
 
 		 172 aa  111  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000810372  hitchhiker  0.000625033 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3563  hypothetical protein  41.61 
 
 		 151 aa  111  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.380474  hitchhiker  0.00000509959 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  44.78 
 
 		 154 aa  111  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  52.21 
 
 		 145 aa  111  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  40.58 
 
 		 151 aa  111  6e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0583  hypothetical protein  43.48 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  40.71 
 
 		 152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  44.2 
 
 		 151 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3610  hypothetical protein  52.63 
 
 		 152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  47.01 
 
 		 151 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  48.55 
 
 		 173 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  45.77 
 
 		 150 aa  106  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  38.85 
 
 		 153 aa  106  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  45.59 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  41.79 
 
 		 152 aa  104  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4182  hypothetical protein  47.1 
 
 		 158 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  42.65 
 
 		 153 aa  104  5e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  41.79 
 
 		 152 aa  104  6e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3856  protein of unknown function DUF150  39.47 
 
 		 209 aa  104  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.113765  normal  0.0726856 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  39.57 
 
 		 153 aa  104  6e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4492  hypothetical protein  46.38 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126815  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0155  hypothetical protein  40.43 
 
 		 166 aa  99.8  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0750  hypothetical protein  39.77 
 
 		 224 aa  99.8  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.251451  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0498  protein of unknown function DUF150  36.03 
 
 		 157 aa  99  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0723  protein of unknown function DUF150  38.06 
 
 		 151 aa  97.4  8e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0030  hypothetical protein  41.5 
 
 		 199 aa  94.4  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.906317  normal  0.667348 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2822  protein of unknown function DUF150  48.54 
 
 		 255 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.189115  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2162  hypothetical protein  42.54 
 
 		 219 aa  92.8  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.213663  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2074  hypothetical protein  42.54 
 
 		 219 aa  92.8  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0717176  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3560  hypothetical protein  45.54 
 
 		 196 aa  92.8  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3730  hypothetical protein  49.51 
 
 		 257 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401483  normal  0.0819057 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3927  hypothetical protein  48.45 
 
 		 220 aa  91.3  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0389  lipoprotein, putative  44.86 
 
 		 150 aa  91.3  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.281265  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0553  protein of unknown function DUF150  44.86 
 
 		 153 aa  90.9  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.169356 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2411  protein of unknown function DUF150  35.51 
 
 		 162 aa  90.9  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1205  protein of unknown function DUF150  36.43 
 
 		 156 aa  90.1  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000854014  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  42.55 
 
 		 159 aa  90.5  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  38.13 
 
 		 161 aa  89.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0443  hypothetical protein  35.03 
 
 		 259 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0296  hypothetical protein  47.66 
 
 		 286 aa  89.4  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299993  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0072  hypothetical protein  36.88 
 
 		 166 aa  89.7  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.301721 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2926  protein of unknown function DUF150  46.6 
 
 		 251 aa  89  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2909  hypothetical protein  44 
 
 		 203 aa  89.4  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>