291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR2162 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR2162  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  437  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.213663  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2074  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  437  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0717176  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0750  hypothetical protein  90.7 
 
 		 224 aa  391  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.251451  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3927  hypothetical protein  67.24 
 
 		 220 aa  236  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4390  hypothetical protein  63.37 
 
 		 201 aa  234  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4070  hypothetical protein  62.21 
 
 		 201 aa  230  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3438  hypothetical protein  60.67 
 
 		 205 aa  223  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0164  hypothetical protein  56.91 
 
 		 204 aa  221  6e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1251  hypothetical protein  53.3 
 
 		 209 aa  210  1e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4615  protein of unknown function DUF150  58.89 
 
 		 238 aa  205  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130835  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2614  hypothetical protein  59.43 
 
 		 201 aa  205  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0234  hypothetical protein  50.84 
 
 		 262 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0443  hypothetical protein  51.14 
 
 		 259 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0296  hypothetical protein  57.47 
 
 		 286 aa  196  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299993  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2822  protein of unknown function DUF150  53.33 
 
 		 255 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.189115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2700  hypothetical protein  54.8 
 
 		 251 aa  191  6e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.765292 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2926  protein of unknown function DUF150  54.8 
 
 		 251 aa  191  6e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3730  hypothetical protein  50.26 
 
 		 257 aa  190  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401483  normal  0.0819057 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0597  hypothetical protein  50 
 
 		 259 aa  185  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0054  hypothetical protein  49.27 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.454767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0028  hypothetical protein  50 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1050  hypothetical protein  51.31 
 
 		 314 aa  181  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0477  hypothetical protein  47.03 
 
 		 272 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.981594  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0021  hypothetical protein  51.45 
 
 		 260 aa  168  5e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0581916 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2754  hypothetical protein  50.57 
 
 		 204 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.229577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2298  protein of unknown function DUF150  49.16 
 
 		 279 aa  165  5e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.022015 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3560  hypothetical protein  49.12 
 
 		 196 aa  164  8e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2909  hypothetical protein  48.84 
 
 		 203 aa  161  6e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3625  hypothetical protein  47.75 
 
 		 207 aa  161  6e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443103 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1162  hypothetical protein  47.7 
 
 		 204 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2823  hypothetical protein  47.7 
 
 		 204 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2591  hypothetical protein  47.43 
 
 		 206 aa  157  8e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0041  hypothetical protein  47.73 
 
 		 194 aa  154  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3778  hypothetical protein  45.6 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2067  hypothetical protein  50 
 
 		 207 aa  142  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.677656 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0030  hypothetical protein  43.33 
 
 		 199 aa  142  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.906317  normal  0.667348 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2493  hypothetical protein  45.24 
 
 		 186 aa  128  7.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0301958  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3820  hypothetical protein  43.67 
 
 		 186 aa  125  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.646345  normal  0.0215546 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3040  hypothetical protein  43.21 
 
 		 178 aa  124  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0609  hypothetical protein  45.57 
 
 		 181 aa  119  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0222  hypothetical protein  38.41 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  42.86 
 
 		 176 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  43.71 
 
 		 153 aa  111  9e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1440  protein of unknown function DUF150  37.75 
 
 		 154 aa  100  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.266374  normal  0.102283 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  37.93 
 
 		 151 aa  100  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  36.81 
 
 		 150 aa  97.4  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  38.56 
 
 		 151 aa  96.3  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  37.42 
 
 		 151 aa  96.3  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  38.35 
 
 		 151 aa  95.5  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  35 
 
 		 158 aa  95.5  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  36.3 
 
 		 153 aa  95.5  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2817  hypothetical protein  42.74 
 
 		 196 aa  95.1  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  37.21 
 
 		 165 aa  94.7  9e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  36.3 
 
 		 153 aa  94.7  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01301  hypothetical protein  42.54 
 
 		 176 aa  92.8  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  34.69 
 
 		 154 aa  92.4  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  39.52 
 
 		 153 aa  92.8  4e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  36.24 
 
 		 152 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  36.24 
 
 		 152 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  35.57 
 
 		 161 aa  92  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0995  hypothetical protein  38.24 
 
 		 154 aa  90.9  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000184773  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1626  protein of unknown function DUF150  34.84 
 
 		 154 aa  90.1  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  37.24 
 
 		 153 aa  90.5  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  33.78 
 
 		 159 aa  88.6  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  38.16 
 
 		 151 aa  88.2  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  37.69 
 
 		 152 aa  87.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3610  hypothetical protein  39.82 
 
 		 152 aa  87  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  37.69 
 
 		 152 aa  87  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1138  hypothetical protein  36.72 
 
 		 171 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0279371 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  35.95 
 
 		 153 aa  87  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07810  hypothetical protein  33.96 
 
 		 159 aa  87  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  35.95 
 
 		 154 aa  86.3  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0723  protein of unknown function DUF150  33.79 
 
 		 151 aa  85.9  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4492  hypothetical protein  36.61 
 
 		 158 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126815  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  38.94 
 
 		 169 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0498  protein of unknown function DUF150  29.46 
 
 		 157 aa  84  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4182  hypothetical protein  37.96 
 
 		 158 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  38.94 
 
 		 169 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  35.11 
 
 		 152 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0357  hypothetical protein  34.75 
 
 		 138 aa  83.6  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.215322  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  35.94 
 
 		 154 aa  83.6  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1497  hypothetical protein  34.71 
 
 		 138 aa  84  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0657507  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3192  hypothetical protein  36.91 
 
 		 153 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000184124  normal  0.0994389 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1159  protein of unknown function DUF150  35.03 
 
 		 171 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.710629  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  32.03 
 
 		 153 aa  84  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2430  hypothetical protein  32.91 
 
 		 172 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.838305 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1585  hypothetical protein  35.85 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0279837  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1227  protein of unknown function DUF150  35.03 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  38.05 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  38.05 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3680  hypothetical protein  35.71 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000126023  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  35.71 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  35.56 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1099  hypothetical protein  35.03 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  40.91 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  37.5 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  37.5 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  37.5 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  37.5 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  37.5 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>