More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3856 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3856  protein of unknown function DUF150  100 
 
 
209 aa  428  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.113765  normal  0.0726856 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  37.13 
 
 
151 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  39.05 
 
 
150 aa  112  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  40.85 
 
 
151 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  37.72 
 
 
151 aa  108  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3192  hypothetical protein  34.12 
 
 
153 aa  108  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000184124  normal  0.0994389 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  34.73 
 
 
151 aa  107  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  38.51 
 
 
161 aa  107  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  39.63 
 
 
153 aa  106  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  36.46 
 
 
176 aa  105  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  38.73 
 
 
153 aa  105  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  36.09 
 
 
165 aa  105  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01301  hypothetical protein  39.47 
 
 
176 aa  104  9e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2817  hypothetical protein  36.99 
 
 
196 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  36.69 
 
 
152 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0583  hypothetical protein  37.36 
 
 
191 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  36.69 
 
 
152 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1138  hypothetical protein  37.91 
 
 
171 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0279371 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  36.31 
 
 
153 aa  102  4e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  36.31 
 
 
153 aa  102  4e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0553  protein of unknown function DUF150  42.11 
 
 
153 aa  102  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.169356 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1205  protein of unknown function DUF150  32.74 
 
 
156 aa  102  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000854014  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0389  lipoprotein, putative  42.11 
 
 
150 aa  102  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.281265  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  37.2 
 
 
151 aa  102  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  34.13 
 
 
151 aa  102  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  40.91 
 
 
158 aa  100  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  41.25 
 
 
154 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  35.5 
 
 
153 aa  100  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  40.24 
 
 
151 aa  99.4  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1552  hypothetical protein  34.5 
 
 
162 aa  99.4  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175864  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  35.12 
 
 
150 aa  98.6  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  35.12 
 
 
150 aa  98.6  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  35.12 
 
 
150 aa  98.6  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  35.12 
 
 
154 aa  98.6  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  35.12 
 
 
150 aa  98.6  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  35.12 
 
 
154 aa  98.6  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  35.12 
 
 
150 aa  98.6  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  35.12 
 
 
150 aa  98.6  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  35.12 
 
 
150 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  37.5 
 
 
150 aa  98.6  7e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  35.12 
 
 
150 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1440  protein of unknown function DUF150  37.76 
 
 
154 aa  98.6  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.266374  normal  0.102283 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  35.12 
 
 
150 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  35.12 
 
 
154 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  37.5 
 
 
150 aa  98.6  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  35.12 
 
 
154 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  37.5 
 
 
150 aa  98.6  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  38.75 
 
 
140 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  37.5 
 
 
140 aa  97.4  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1227  protein of unknown function DUF150  36.87 
 
 
171 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  32.14 
 
 
151 aa  97.1  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  36.09 
 
 
153 aa  96.7  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  36.69 
 
 
152 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  35.12 
 
 
150 aa  96.3  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0806  protein of unknown function DUF150  38.75 
 
 
140 aa  96.3  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  38.61 
 
 
145 aa  95.5  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  34.43 
 
 
169 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  34.43 
 
 
169 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  32.73 
 
 
151 aa  94.7  9e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1099  hypothetical protein  37.43 
 
 
171 aa  94.7  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0487  hypothetical protein  33.33 
 
 
150 aa  94  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249933  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1159  protein of unknown function DUF150  36.87 
 
 
171 aa  93.2  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.710629  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0995  hypothetical protein  37.4 
 
 
154 aa  93.6  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000184773  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  35.76 
 
 
151 aa  93.2  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  35.5 
 
 
173 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  34.38 
 
 
154 aa  93.6  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1005  hypothetical protein  35.76 
 
 
151 aa  93.6  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0545714  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3040  hypothetical protein  34.78 
 
 
178 aa  93.6  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0960  hypothetical protein  40.71 
 
 
161 aa  94  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0498  protein of unknown function DUF150  33.53 
 
 
157 aa  92.8  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  34.43 
 
 
169 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0988  hypothetical protein  31.67 
 
 
165 aa  92.8  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  35.76 
 
 
151 aa  92.4  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3610  hypothetical protein  36.09 
 
 
152 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  43.18 
 
 
159 aa  92.4  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  35.1 
 
 
151 aa  92  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  35.1 
 
 
151 aa  92  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  35.1 
 
 
151 aa  92  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  35.06 
 
 
152 aa  91.7  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4182  hypothetical protein  35.09 
 
 
158 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0201  hypothetical protein  33.53 
 
 
215 aa  90.9  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0967046  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  33.53 
 
 
152 aa  90.9  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0030  hypothetical protein  32.62 
 
 
199 aa  90.1  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.906317  normal  0.667348 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  43.64 
 
 
151 aa  90.1  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1299  hypothetical protein  38.73 
 
 
160 aa  90.5  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000613288  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0177  hypothetical protein  33.53 
 
 
199 aa  90.1  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.020604  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  28.4 
 
 
152 aa  89.7  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0296  hypothetical protein  40.49 
 
 
286 aa  89.7  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299993  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  28.4 
 
 
152 aa  89  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  34.36 
 
 
153 aa  89.4  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4492  hypothetical protein  34.5 
 
 
158 aa  89  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126815  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1630  hypothetical protein  36.47 
 
 
152 aa  89  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00641879 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1420  hypothetical protein  38.6 
 
 
152 aa  89  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.042517 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1380  hypothetical protein  38.6 
 
 
152 aa  89  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.449131  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  33.7 
 
 
161 aa  88.6  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4615  protein of unknown function DUF150  41.48 
 
 
238 aa  88.6  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130835  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2591  hypothetical protein  35.62 
 
 
206 aa  88.6  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2984  hypothetical protein  38.03 
 
 
160 aa  88.2  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.49788e-30 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1866  hypothetical protein  41.36 
 
 
142 aa  87.4  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.182542  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0028  hypothetical protein  36.88 
 
 
263 aa  87.4  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>