More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3927 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3927  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  429  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0750  hypothetical protein  61.95 
 
 
224 aa  238  6.999999999999999e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.251451  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2162  hypothetical protein  66.11 
 
 
219 aa  237  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.213663  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2074  hypothetical protein  66.11 
 
 
219 aa  237  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0717176  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4070  hypothetical protein  61.05 
 
 
201 aa  218  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4390  hypothetical protein  59.89 
 
 
201 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3438  hypothetical protein  63.86 
 
 
205 aa  212  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0234  hypothetical protein  49.77 
 
 
262 aa  208  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0164  hypothetical protein  59.17 
 
 
204 aa  208  6e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0296  hypothetical protein  62.79 
 
 
286 aa  205  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299993  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2298  protein of unknown function DUF150  62.21 
 
 
279 aa  202  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.022015 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0443  hypothetical protein  48.85 
 
 
259 aa  201  7e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4615  protein of unknown function DUF150  60.47 
 
 
238 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130835  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0597  hypothetical protein  54.05 
 
 
259 aa  197  7e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2614  hypothetical protein  61.18 
 
 
201 aa  196  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0054  hypothetical protein  55.43 
 
 
253 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.454767  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0028  hypothetical protein  51.63 
 
 
263 aa  192  5e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0477  hypothetical protein  51.63 
 
 
272 aa  191  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.981594  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3730  hypothetical protein  57.06 
 
 
257 aa  191  9e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401483  normal  0.0819057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2700  hypothetical protein  56.57 
 
 
251 aa  186  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.765292 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1251  hypothetical protein  53.11 
 
 
209 aa  186  3e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2926  protein of unknown function DUF150  56.57 
 
 
251 aa  186  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1050  hypothetical protein  48.03 
 
 
314 aa  186  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2822  protein of unknown function DUF150  57.8 
 
 
255 aa  185  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.189115  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0021  hypothetical protein  51.85 
 
 
260 aa  169  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0581916 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2909  hypothetical protein  52.05 
 
 
203 aa  166  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2754  hypothetical protein  48.54 
 
 
204 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.229577  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3560  hypothetical protein  50 
 
 
196 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1162  hypothetical protein  47.98 
 
 
204 aa  162  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2823  hypothetical protein  47.98 
 
 
204 aa  161  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2591  hypothetical protein  49.44 
 
 
206 aa  160  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0041  hypothetical protein  43.06 
 
 
194 aa  158  5e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3625  hypothetical protein  48.84 
 
 
207 aa  151  8.999999999999999e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.443103 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3778  hypothetical protein  48.02 
 
 
225 aa  145  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2067  hypothetical protein  47.5 
 
 
207 aa  134  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.677656 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2493  hypothetical protein  48.21 
 
 
186 aa  133  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0301958  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0030  hypothetical protein  43.09 
 
 
199 aa  129  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.906317  normal  0.667348 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0609  hypothetical protein  47.5 
 
 
181 aa  128  8.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142397  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0222  hypothetical protein  43.9 
 
 
201 aa  123  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3040  hypothetical protein  43.93 
 
 
178 aa  122  5e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3820  hypothetical protein  44.94 
 
 
186 aa  122  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.646345  normal  0.0215546 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  40.94 
 
 
176 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  39.58 
 
 
150 aa  102  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  40.67 
 
 
153 aa  102  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  44.34 
 
 
151 aa  100  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1552  hypothetical protein  40.65 
 
 
162 aa  101  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175864  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  39.47 
 
 
153 aa  99.4  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  40.85 
 
 
151 aa  99  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  38.93 
 
 
151 aa  97.4  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  42 
 
 
151 aa  97.1  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  40.83 
 
 
152 aa  96.3  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  38.69 
 
 
152 aa  96.7  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  37.5 
 
 
158 aa  95.9  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2817  hypothetical protein  45 
 
 
196 aa  95.5  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  39.04 
 
 
153 aa  95.1  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1440  protein of unknown function DUF150  36.42 
 
 
154 aa  95.1  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.266374  normal  0.102283 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0995  hypothetical protein  39.13 
 
 
154 aa  95.1  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000184773  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  39.33 
 
 
154 aa  94.7  9e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  37.68 
 
 
151 aa  94.7  9e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  37.3 
 
 
165 aa  94.7  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  40.25 
 
 
159 aa  94  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1626  protein of unknown function DUF150  36 
 
 
154 aa  92.8  4e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  40 
 
 
152 aa  92.8  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  39.44 
 
 
151 aa  92.4  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3610  hypothetical protein  41.74 
 
 
152 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  37.41 
 
 
151 aa  92  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  36.24 
 
 
161 aa  92  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  36.91 
 
 
152 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  36.91 
 
 
152 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0553  protein of unknown function DUF150  40.98 
 
 
153 aa  91.3  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.169356 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0389  lipoprotein, putative  40.98 
 
 
150 aa  91.3  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.281265  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01301  hypothetical protein  48.45 
 
 
176 aa  90.9  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07810  hypothetical protein  36.69 
 
 
159 aa  90.5  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  38.03 
 
 
151 aa  90.5  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0573  protein of unknown function DUF150  34.01 
 
 
147 aa  89.7  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.300735  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1299  hypothetical protein  36.6 
 
 
160 aa  89.4  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000613288  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  41.38 
 
 
154 aa  89.4  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1585  hypothetical protein  37.82 
 
 
159 aa  89  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0279837  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  34.93 
 
 
153 aa  89  5e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2984  hypothetical protein  36.6 
 
 
160 aa  88.6  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.49788e-30 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1138  hypothetical protein  38.04 
 
 
171 aa  88.2  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0279371 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  37.29 
 
 
152 aa  88.2  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  34.9 
 
 
154 aa  88.2  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  39.47 
 
 
169 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  39.47 
 
 
169 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  41.96 
 
 
145 aa  88.2  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  36.62 
 
 
153 aa  87.8  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  40.71 
 
 
140 aa  86.7  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  38.6 
 
 
169 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  38.6 
 
 
152 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  37.4 
 
 
153 aa  87.4  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1649  hypothetical protein  36.13 
 
 
151 aa  86.3  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296961  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0806  protein of unknown function DUF150  43.24 
 
 
140 aa  86.7  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3680  hypothetical protein  38 
 
 
152 aa  85.9  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000126023  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  39.82 
 
 
150 aa  85.9  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0583  hypothetical protein  43.24 
 
 
191 aa  85.9  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  39.83 
 
 
151 aa  85.5  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1469  protein of unknown function DUF150  33.73 
 
 
166 aa  85.1  7e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000542376  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3062  hypothetical protein  36.75 
 
 
151 aa  85.1  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525096  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0988  hypothetical protein  37.6 
 
 
165 aa  85.1  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>