298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2822 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2822  protein of unknown function DUF150  100 
 
 
255 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.189115  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2700  hypothetical protein  88.24 
 
 
251 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.765292 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2926  protein of unknown function DUF150  88.24 
 
 
251 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3730  hypothetical protein  66.54 
 
 
257 aa  310  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401483  normal  0.0819057 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2614  hypothetical protein  73.3 
 
 
201 aa  280  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4615  protein of unknown function DUF150  71.07 
 
 
238 aa  276  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130835  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0296  hypothetical protein  58.76 
 
 
286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299993  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0234  hypothetical protein  49.58 
 
 
262 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0443  hypothetical protein  48.26 
 
 
259 aa  198  6e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2162  hypothetical protein  53.33 
 
 
219 aa  196  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.213663  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0750  hypothetical protein  51.94 
 
 
224 aa  196  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.251451  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2074  hypothetical protein  53.33 
 
 
219 aa  196  3e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0717176  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1050  hypothetical protein  56.54 
 
 
314 aa  194  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0028  hypothetical protein  58.52 
 
 
263 aa  193  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0054  hypothetical protein  50.43 
 
 
253 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.454767  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0477  hypothetical protein  57.22 
 
 
272 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.981594  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0597  hypothetical protein  53.37 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2298  protein of unknown function DUF150  60.57 
 
 
279 aa  188  8e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.022015 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4070  hypothetical protein  53.18 
 
 
201 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4390  hypothetical protein  50.26 
 
 
201 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3927  hypothetical protein  57.8 
 
 
220 aa  186  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0164  hypothetical protein  53.98 
 
 
204 aa  182  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0021  hypothetical protein  55.68 
 
 
260 aa  177  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0581916 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3438  hypothetical protein  53.22 
 
 
205 aa  177  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3625  hypothetical protein  52.3 
 
 
207 aa  176  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.443103 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1251  hypothetical protein  44.95 
 
 
209 aa  166  4e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2754  hypothetical protein  47.29 
 
 
204 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.229577  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2591  hypothetical protein  45.88 
 
 
206 aa  161  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2909  hypothetical protein  45.3 
 
 
203 aa  152  5e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1162  hypothetical protein  47.13 
 
 
204 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2823  hypothetical protein  46.55 
 
 
204 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0041  hypothetical protein  45.61 
 
 
194 aa  148  7e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3560  hypothetical protein  42.7 
 
 
196 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2067  hypothetical protein  47.12 
 
 
207 aa  143  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.677656 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0030  hypothetical protein  41.24 
 
 
199 aa  126  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.906317  normal  0.667348 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0222  hypothetical protein  42.26 
 
 
201 aa  123  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3778  hypothetical protein  41.57 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3820  hypothetical protein  39.46 
 
 
186 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.646345  normal  0.0215546 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3040  hypothetical protein  41.71 
 
 
178 aa  114  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2493  hypothetical protein  42.69 
 
 
186 aa  108  7.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0301958  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0609  hypothetical protein  45.75 
 
 
181 aa  106  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142397  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  43.86 
 
 
176 aa  101  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  37.23 
 
 
153 aa  97.8  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  35.06 
 
 
153 aa  96.3  5e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01301  hypothetical protein  48.54 
 
 
176 aa  94.7  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  30.13 
 
 
151 aa  94.4  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0989  hypothetical protein  36 
 
 
153 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.233502  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1063  hypothetical protein  36 
 
 
153 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.295932  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  35.56 
 
 
152 aa  93.6  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1913  hypothetical protein  36 
 
 
153 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.454349  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2566  hypothetical protein  36 
 
 
153 aa  94.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000987168  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  30.77 
 
 
151 aa  94  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1018  hypothetical protein  36 
 
 
152 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.680488  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1738  hypothetical protein  36 
 
 
153 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00684436  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1474  hypothetical protein  36 
 
 
152 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150708  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0177  hypothetical protein  36 
 
 
153 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00695056  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1760  hypothetical protein  36 
 
 
153 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0659337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1498  hypothetical protein  36 
 
 
152 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310765  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1509  hypothetical protein  36 
 
 
153 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.985298  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  35.2 
 
 
150 aa  93.6  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  35.2 
 
 
150 aa  93.6  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  35.2 
 
 
150 aa  93.6  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4639  hypothetical protein  36 
 
 
152 aa  93.6  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0564312  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  43.24 
 
 
152 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  43.24 
 
 
152 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1757  hypothetical protein  36 
 
 
152 aa  93.6  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.47468  normal  0.0284791 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  37.93 
 
 
158 aa  92.4  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  33.6 
 
 
150 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  33.6 
 
 
150 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2817  hypothetical protein  39.1 
 
 
196 aa  91.7  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  33.6 
 
 
150 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  33.6 
 
 
150 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  33.6 
 
 
150 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  33.6 
 
 
150 aa  91.7  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  34.85 
 
 
152 aa  90.9  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  32.06 
 
 
151 aa  90.5  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  33.6 
 
 
154 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1731  hypothetical protein  36.67 
 
 
152 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  33.6 
 
 
154 aa  90.5  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  33.6 
 
 
154 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1380  hypothetical protein  35.33 
 
 
152 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.449131  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1420  hypothetical protein  35.33 
 
 
152 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.042517 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  40.35 
 
 
151 aa  90.1  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  34.68 
 
 
140 aa  90.1  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  33.77 
 
 
161 aa  90.1  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  32.8 
 
 
150 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  32.8 
 
 
150 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  32.8 
 
 
150 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  37.8 
 
 
153 aa  89.7  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  38.39 
 
 
151 aa  89.7  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  32.31 
 
 
151 aa  89.4  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  32.81 
 
 
154 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  32.81 
 
 
154 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2822  hypothetical protein  36 
 
 
152 aa  89.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00822471  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  34.71 
 
 
140 aa  89  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  31.2 
 
 
150 aa  89  8e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1630  hypothetical protein  36 
 
 
152 aa  89  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00641879 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  33.86 
 
 
153 aa  88.6  9e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  41.35 
 
 
169 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  41.35 
 
 
169 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>