More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_08070 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_08070  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  361  4e-99  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0408486  normal  0.217563 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1813  protein of unknown function DUF150  59.49 
 
 
159 aa  194  5.000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.549773  normal  0.686814 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09340  hypothetical protein  55.97 
 
 
158 aa  194  6e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000007629  normal  0.602574 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0832  protein of unknown function DUF150  43.31 
 
 
164 aa  123  1e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000130104  hitchhiker  0.000000375903 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  36.91 
 
 
150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  36.91 
 
 
150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  36.91 
 
 
150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  40.77 
 
 
140 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  40.28 
 
 
151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  36.91 
 
 
153 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0583  hypothetical protein  35.54 
 
 
191 aa  108  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  37.58 
 
 
154 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  37.58 
 
 
154 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  36.91 
 
 
150 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  36.91 
 
 
150 aa  107  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  36.91 
 
 
150 aa  107  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  36.91 
 
 
150 aa  107  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  39.42 
 
 
161 aa  107  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  36.91 
 
 
150 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  36.91 
 
 
150 aa  107  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  36.24 
 
 
154 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  36.24 
 
 
154 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  36.91 
 
 
176 aa  106  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  37.58 
 
 
154 aa  106  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  36.24 
 
 
151 aa  105  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  35.57 
 
 
150 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  35.57 
 
 
150 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  35.57 
 
 
150 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  36.24 
 
 
154 aa  105  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07810  hypothetical protein  38.22 
 
 
159 aa  104  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0487  hypothetical protein  35.57 
 
 
150 aa  104  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249933  normal  0.270072 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  40 
 
 
140 aa  103  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1099  hypothetical protein  40.67 
 
 
171 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  34.9 
 
 
150 aa  103  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  34.9 
 
 
152 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  34.9 
 
 
152 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1138  hypothetical protein  38.41 
 
 
171 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0279371 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4219  hypothetical protein  40.65 
 
 
169 aa  102  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000438537  normal  0.129114 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1159  protein of unknown function DUF150  40 
 
 
171 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.710629  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3040  hypothetical protein  39.86 
 
 
178 aa  102  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  39.26 
 
 
151 aa  101  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  36.3 
 
 
151 aa  101  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1961  hypothetical protein  38.1 
 
 
153 aa  101  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00677493  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1227  protein of unknown function DUF150  40 
 
 
171 aa  101  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0806  protein of unknown function DUF150  38.46 
 
 
140 aa  100  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3192  hypothetical protein  36.09 
 
 
153 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000184124  normal  0.0994389 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  35.56 
 
 
151 aa  99.8  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  34.93 
 
 
151 aa  97.8  7e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  34.07 
 
 
151 aa  97.8  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1440  protein of unknown function DUF150  35.51 
 
 
154 aa  97.4  9e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.266374  normal  0.102283 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0030  hypothetical protein  38.69 
 
 
199 aa  97.4  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.906317  normal  0.667348 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2591  hypothetical protein  38.06 
 
 
206 aa  97.4  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  39.39 
 
 
165 aa  97.1  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0995  hypothetical protein  33.09 
 
 
154 aa  96.7  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000184773  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  35.07 
 
 
153 aa  95.9  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0498  protein of unknown function DUF150  37.06 
 
 
157 aa  95.9  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2043  hypothetical protein  36.84 
 
 
157 aa  95.1  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1552  hypothetical protein  37.5 
 
 
162 aa  95.1  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175864  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  34.48 
 
 
151 aa  94.7  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  35.2 
 
 
152 aa  94.4  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3680  hypothetical protein  36.52 
 
 
152 aa  93.6  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000126023  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  35.77 
 
 
169 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2067  hypothetical protein  35.1 
 
 
207 aa  92.8  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.677656 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1649  hypothetical protein  36.13 
 
 
151 aa  93.2  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296961  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  37.86 
 
 
151 aa  92.8  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  35.77 
 
 
169 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  35.04 
 
 
153 aa  92.4  3e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0665  hypothetical protein  35.04 
 
 
152 aa  92.4  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00658224 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  37.69 
 
 
152 aa  92.4  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  35.21 
 
 
150 aa  92  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  35.62 
 
 
151 aa  92  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1126  hypothetical protein  35.62 
 
 
151 aa  92  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017917  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3282  hypothetical protein  35.62 
 
 
151 aa  92  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000111408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  35.62 
 
 
151 aa  92  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0041  hypothetical protein  37.09 
 
 
194 aa  91.7  6e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  37.1 
 
 
153 aa  91.3  7e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  34.25 
 
 
153 aa  91.3  7e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  33.79 
 
 
151 aa  90.9  8e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  32.39 
 
 
152 aa  90.9  8e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  36.17 
 
 
173 aa  90.9  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  35.04 
 
 
169 aa  90.9  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  36.75 
 
 
158 aa  90.5  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  40.37 
 
 
145 aa  89.7  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  32.39 
 
 
152 aa  89.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3625  hypothetical protein  37.69 
 
 
207 aa  89.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.443103 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1005  hypothetical protein  33.1 
 
 
151 aa  89.4  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0545714  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2909  hypothetical protein  37.67 
 
 
203 aa  89.7  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0988  hypothetical protein  31.03 
 
 
165 aa  89.7  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1048  hypothetical protein  35 
 
 
151 aa  89  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000120853  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3160  hypothetical protein  35.44 
 
 
173 aa  89.4  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000242539  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1944  hypothetical protein  32.65 
 
 
154 aa  89  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  32.39 
 
 
154 aa  88.6  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1662  hypothetical protein  32.65 
 
 
154 aa  88.6  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1151  hypothetical protein  34.21 
 
 
157 aa  87.8  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962197  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  36.5 
 
 
159 aa  86.3  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3062  hypothetical protein  32.88 
 
 
151 aa  86.3  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525096  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  31.82 
 
 
161 aa  86.3  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3037  hypothetical protein  34.93 
 
 
181 aa  85.9  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110897  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1431  protein of unknown function DUF150  37.93 
 
 
157 aa  85.5  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000199616  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  31.03 
 
 
151 aa  85.1  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>