92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01345 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_01345  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  307  2.9999999999999997e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1628  hypothetical protein  58.55 
 
 
166 aa  177  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1263  hypothetical protein  45.75 
 
 
155 aa  135  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0139  protein of unknown function DUF150  36.54 
 
 
154 aa  99.8  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0034  protein of unknown function DUF150  33.87 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.186641  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0651  protein of unknown function DUF150  40.78 
 
 
169 aa  65.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00506938  normal  0.180527 
 
 
-
 
NC_002950  PG0253  hypothetical protein  34.69 
 
 
152 aa  62  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1418  hypothetical protein  34.41 
 
 
162 aa  60.5  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710908  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3968  protein of unknown function DUF150  28.91 
 
 
196 aa  60.5  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1213  protein of unknown function DUF150  33.66 
 
 
170 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1151  hypothetical protein  33.07 
 
 
157 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962197  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1464  hypothetical protein  41.56 
 
 
179 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.222123  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2043  hypothetical protein  31.06 
 
 
157 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1497  hypothetical protein  35.29 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0657507  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0367  hypothetical protein  25.75 
 
 
173 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000973153  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1307  protein of unknown function DUF150  28.66 
 
 
160 aa  55.1  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.481915  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1781  hypothetical protein  29.41 
 
 
191 aa  53.5  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000171519  normal  0.0471019 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0396  hypothetical protein  26.61 
 
 
173 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0150175  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3333  protein of unknown function DUF150  33.03 
 
 
205 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.295567  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1367  hypothetical protein  30.93 
 
 
220 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.54901  normal  0.305959 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0357  hypothetical protein  34.31 
 
 
138 aa  51.6  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.215322  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0298  hypothetical protein  37.84 
 
 
176 aa  50.8  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000302311  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1324  hypothetical protein  30.58 
 
 
219 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.777494  normal  0.0380271 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3639  hypothetical protein  28.57 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000125209  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  26.55 
 
 
154 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  29.37 
 
 
153 aa  48.1  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0695  hypothetical protein  27.61 
 
 
157 aa  48.1  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000302569  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1329  hypothetical protein  27.82 
 
 
156 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000301231  hitchhiker  0.0000903983 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3420  hypothetical protein  30.37 
 
 
167 aa  47  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  26.95 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3864  hypothetical protein  27.07 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000526442  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1046  hypothetical protein  34.58 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000583244  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3829  hypothetical protein  27.07 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.0936e-62 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  37.33 
 
 
151 aa  47  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3855  hypothetical protein  27.07 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000468139  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  28.35 
 
 
161 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3576  hypothetical protein  27.07 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128893  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3668  hypothetical protein  27.07 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000060287  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  37.33 
 
 
151 aa  47  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  37.33 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  37.33 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3558  hypothetical protein  27.07 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000119608  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3954  hypothetical protein  27.07 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000590574  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3282  hypothetical protein  26 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000111408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1126  hypothetical protein  26 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017917  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1649  hypothetical protein  27.64 
 
 
151 aa  45.4  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296961  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  26 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  26 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5837  hypothetical protein  32.58 
 
 
174 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2469  hypothetical protein  27.5 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000177785  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  36 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  31 
 
 
161 aa  45.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2203  protein of unknown function DUF150  33.33 
 
 
173 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000153569  decreased coverage  0.000471354 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  28.35 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1066  hypothetical protein  33.64 
 
 
150 aa  44.7  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000674656  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0400  protein of unknown function DUF150  23.68 
 
 
180 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00158996  normal  0.629594 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  35.38 
 
 
165 aa  44.7  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  34 
 
 
151 aa  44.3  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0365  protein of unknown function DUF150  28.74 
 
 
179 aa  43.9  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00296353  normal  0.904382 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1518  hypothetical protein  27.52 
 
 
170 aa  44.3  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190218  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0151  hypothetical protein  32.18 
 
 
140 aa  43.9  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3193  hypothetical protein  35.38 
 
 
175 aa  44.3  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0250324  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0699  hypothetical protein  28.72 
 
 
161 aa  43.9  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.188397  normal  0.319675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7750  protein of unknown function DUF150  28.23 
 
 
203 aa  43.9  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3516  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3915  hypothetical protein  27.07 
 
 
156 aa  43.9  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1431  protein of unknown function DUF150  26.71 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000199616  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1017  protein of unknown function DUF150  33.33 
 
 
177 aa  43.5  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1677  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00187557  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0995  hypothetical protein  33.04 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000184773  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0224  hypothetical protein  32.56 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0370769  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1226  hypothetical protein  28.97 
 
 
168 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00744714  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1048  hypothetical protein  28.91 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000120853  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1099  hypothetical protein  30.69 
 
 
171 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0173  hypothetical protein  31.03 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.961573  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0133  hypothetical protein  31.03 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1205  protein of unknown function DUF150  28.35 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000854014  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3595  protein of unknown function DUF150  30 
 
 
160 aa  43.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1159  protein of unknown function DUF150  30.69 
 
 
171 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.710629  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3218  protein of unknown function DUF150  24.17 
 
 
139 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.363102  normal  0.0892214 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  37.14 
 
 
151 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  26.32 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  29.37 
 
 
159 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3778  hypothetical protein  30.17 
 
 
225 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1583  hypothetical protein  34.85 
 
 
159 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324016  normal  0.240666 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  32.22 
 
 
152 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1585  hypothetical protein  33.33 
 
 
159 aa  41.2  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0279837  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  32.69 
 
 
151 aa  40.8  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  23.62 
 
 
154 aa  40.8  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  28.43 
 
 
153 aa  40.8  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  32.1 
 
 
173 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  32.22 
 
 
152 aa  40.4  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0723  protein of unknown function DUF150  31.63 
 
 
151 aa  40.4  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.244111  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>