135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0396 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0396  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  347  3e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0150175  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0367  hypothetical protein  49.71 
 
 		 173 aa  181  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000973153  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1781  hypothetical protein  52.07 
 
 		 191 aa  180  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000171519  normal  0.0471019 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0298  hypothetical protein  47.4 
 
 		 176 aa  169  1e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000302311  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1464  hypothetical protein  42.13 
 
 		 179 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.222123  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0365  protein of unknown function DUF150  42.11 
 
 		 179 aa  128  4.0000000000000003e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00296353  normal  0.904382 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0400  protein of unknown function DUF150  40.27 
 
 		 180 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00158996  normal  0.629594 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0034  protein of unknown function DUF150  42.53 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.186641  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1213  protein of unknown function DUF150  43.96 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3420  hypothetical protein  36.3 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1307  protein of unknown function DUF150  34.4 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.481915  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0139  protein of unknown function DUF150  33.78 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1628  hypothetical protein  28.33 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0651  protein of unknown function DUF150  26.36 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00506938  normal  0.180527 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1151  hypothetical protein  25.98 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962197  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1418  hypothetical protein  30.51 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1226  hypothetical protein  29.77 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00744714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1583  hypothetical protein  34.09 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324016  normal  0.240666 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1585  hypothetical protein  31.36 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0279837  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1413  hypothetical protein  29.32 
 
 		 205 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149258  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1324  hypothetical protein  30.77 
 
 		 219 aa  53.9  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.777494  normal  0.0380271 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01345  hypothetical protein  26.61 
 
 		 153 aa  53.1  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1367  hypothetical protein  31.52 
 
 		 220 aa  53.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.54901  normal  0.305959 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2043  hypothetical protein  27.97 
 
 		 157 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1048  hypothetical protein  28.57 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000120853  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1649  hypothetical protein  27.59 
 
 		 151 aa  52  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296961  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3193  hypothetical protein  25.83 
 
 		 175 aa  51.6  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0250324  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14540  hypothetical protein  28.83 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  30.21 
 
 		 154 aa  50.8  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3333  protein of unknown function DUF150  31.58 
 
 		 205 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.295567  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1263  hypothetical protein  30.34 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4219  hypothetical protein  27.27 
 
 		 169 aa  48.9  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000438537  normal  0.129114 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1066  hypothetical protein  28.57 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000674656  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1046  hypothetical protein  32.26 
 
 		 150 aa  49.3  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000583244  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  27.93 
 
 		 159 aa  49.3  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  24.65 
 
 		 152 aa  49.3  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1205  protein of unknown function DUF150  30.59 
 
 		 156 aa  48.9  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000854014  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1518  hypothetical protein  27.96 
 
 		 170 aa  48.5  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  28.26 
 
 		 165 aa  48.1  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  27.59 
 
 		 159 aa  48.1  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  32.97 
 
 		 150 aa  47.4  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  32.97 
 
 		 150 aa  47.4  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  32.97 
 
 		 150 aa  47.4  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1552  hypothetical protein  29.91 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175864  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1424  protein of unknown function DUF150  28.57 
 
 		 222 aa  47  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000944308 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  31.94 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  30.12 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  30.12 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  30.12 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  30.12 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  31.94 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  31.94 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  31.94 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  31.94 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  31.94 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  31.94 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  31.94 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  31.94 
 
 		 140 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2114  hypothetical protein  29.47 
 
 		 166 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  29.89 
 
 		 151 aa  46.2  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  36.36 
 
 		 153 aa  45.8  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  25.45 
 
 		 152 aa  45.4  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  30.12 
 
 		 151 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  29.33 
 
 		 161 aa  45.4  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3282  hypothetical protein  30.12 
 
 		 151 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000111408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  30.12 
 
 		 151 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1126  hypothetical protein  30.12 
 
 		 151 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017917  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3680  hypothetical protein  25.6 
 
 		 152 aa  45.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000126023  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5837  hypothetical protein  27.72 
 
 		 174 aa  44.7  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1138  hypothetical protein  27.52 
 
 		 171 aa  44.7  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0279371 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1329  hypothetical protein  25.4 
 
 		 156 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000301231  hitchhiker  0.0000903983 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2203  protein of unknown function DUF150  33.57 
 
 		 173 aa  44.7  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000153569  decreased coverage  0.000471354 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3639  hypothetical protein  25.4 
 
 		 156 aa  44.7  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000125209  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3915  hypothetical protein  25.4 
 
 		 156 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3855  hypothetical protein  24.6 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000468139  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3668  hypothetical protein  24.6 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000060287  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3558  hypothetical protein  24.6 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000119608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3576  hypothetical protein  24.6 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128893  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0606  protein of unknown function DUF150  26.67 
 
 		 147 aa  44.3  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000662285  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  31.87 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3954  hypothetical protein  24.6 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000590574  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0028  hypothetical protein  29.09 
 
 		 263 aa  44.3  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  27.27 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  31.46 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3595  protein of unknown function DUF150  25.89 
 
 		 160 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  31.43 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2430  hypothetical protein  31.58 
 
 		 172 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.838305 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0529  hypothetical protein  25.4 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  26.85 
 
 		 161 aa  43.9  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3864  hypothetical protein  24.6 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000526442  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3829  hypothetical protein  24.6 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.0936e-62 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1961  hypothetical protein  28.23 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00677493  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  24.53 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2469  hypothetical protein  24.6 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000177785  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  28.05 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  30.56 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  30.56 
 
 		 150 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  30.56 
 
 		 150 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1299  hypothetical protein  28.43 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000613288  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  30.56 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>