More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1307 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1307  protein of unknown function DUF150  100 
 
 		 160 aa  319  9.999999999999999e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.481915  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  39.69 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3856  protein of unknown function DUF150  32.58 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.113765  normal  0.0726856 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  30.14 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0034  protein of unknown function DUF150  33.33 
 
 		 160 aa  77  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.186641  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  32.87 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  31.29 
 
 		 151 aa  77  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  30.82 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  31.67 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  31.67 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0498  protein of unknown function DUF150  35.34 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  31.67 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0665  hypothetical protein  28.77 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658224 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1126  hypothetical protein  32.81 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017917  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  32.81 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  32.81 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3282  hypothetical protein  32.81 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000111408  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  30.83 
 
 		 151 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2492  protein of unknown function DUF150  34.87 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3563  hypothetical protein  29.05 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.380474  hitchhiker  0.00000509959 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0139  protein of unknown function DUF150  35.77 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1005  hypothetical protein  30.82 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0545714  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3062  hypothetical protein  28.77 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525096  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0723  protein of unknown function DUF150  32.64 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1213  protein of unknown function DUF150  38.24 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0988  hypothetical protein  30.14 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  28.79 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4615  protein of unknown function DUF150  35 
 
 		 238 aa  71.2  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130835  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3391  hypothetical protein  28.38 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000810372  hitchhiker  0.000625033 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3333  protein of unknown function DUF150  36.96 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.295567  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0736  hypothetical protein  34.46 
 
 		 152 aa  70.5  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000239746  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2614  hypothetical protein  34.38 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1099  hypothetical protein  30.82 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2778  hypothetical protein  28.78 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000007785  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1418  hypothetical protein  36.77 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  32.5 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2067  hypothetical protein  33.33 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.677656 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  27.52 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1159  protein of unknown function DUF150  30.82 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.710629  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1205  protein of unknown function DUF150  27.48 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000854014  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01301  hypothetical protein  37.38 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5837  hypothetical protein  35.66 
 
 		 174 aa  68.2  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1226  hypothetical protein  30.46 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00744714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  30.83 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  36.27 
 
 		 169 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  36.27 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  36.27 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1583  hypothetical protein  29.68 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324016  normal  0.240666 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  31.33 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1961  hypothetical protein  29.53 
 
 		 153 aa  67  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00677493  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0028  hypothetical protein  32.9 
 
 		 263 aa  67  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  30.83 
 
 		 151 aa  67  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  36.27 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  35.29 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  35.29 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0960  hypothetical protein  37 
 
 		 161 aa  67  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1367  hypothetical protein  33.55 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.54901  normal  0.305959 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14540  hypothetical protein  35.46 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110302  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3595  protein of unknown function DUF150  31.85 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1324  hypothetical protein  32.89 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.777494  normal  0.0380271 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2150  protein of unknown function DUF150  43.01 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1497  hypothetical protein  31.3 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0657507  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1046  hypothetical protein  38.54 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000583244  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  32.11 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1066  hypothetical protein  39.58 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000674656  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  32 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  31.97 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2430  hypothetical protein  34.29 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.838305 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  32.11 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1677  hypothetical protein  25.74 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00187557  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2114  hypothetical protein  33.09 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  32.65 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1649  hypothetical protein  36.11 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296961  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3420  hypothetical protein  28.14 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0832  hypothetical protein  27.41 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0955131  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1227  protein of unknown function DUF150  30.19 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  35.64 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1440  protein of unknown function DUF150  27.21 
 
 		 154 aa  63.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.266374  normal  0.102283 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1552  hypothetical protein  30.54 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175864  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3610  hypothetical protein  35.29 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  30 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1413  hypothetical protein  25.85 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000509228  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08070  hypothetical protein  31.78 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0408486  normal  0.217563 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0396  hypothetical protein  34.4 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0150175  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1464  hypothetical protein  30.77 
 
 		 179 aa  62  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.222123  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1151  hypothetical protein  27.27 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962197  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  30.83 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  30.67 
 
 		 154 aa  62  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  27.78 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0357  hypothetical protein  29.37 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.215322  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3193  hypothetical protein  29.33 
 
 		 175 aa  60.8  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0250324  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  30.67 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  30.67 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  30.67 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  30.67 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  30.67 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  30.67 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  30 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  30.67 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3730  hypothetical protein  28.78 
 
 		 185 aa  60.5  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.233176  normal  0.972926 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>