286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1324 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1324  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  417  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.777494  normal  0.0380271 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1367  hypothetical protein  84.65 
 
 
220 aa  329  2e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.54901  normal  0.305959 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1418  hypothetical protein  55 
 
 
162 aa  157  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710908  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3968  protein of unknown function DUF150  51.89 
 
 
196 aa  142  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3333  protein of unknown function DUF150  53.85 
 
 
205 aa  137  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.295567  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3595  protein of unknown function DUF150  47.56 
 
 
160 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2114  hypothetical protein  50 
 
 
166 aa  125  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888786  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7750  protein of unknown function DUF150  51.15 
 
 
203 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3516  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14540  hypothetical protein  46.45 
 
 
179 aa  123  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110302  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2492  protein of unknown function DUF150  48.39 
 
 
162 aa  118  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3193  hypothetical protein  43.45 
 
 
175 aa  114  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0250324  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5837  hypothetical protein  46.91 
 
 
174 aa  111  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0775  hypothetical protein  46.1 
 
 
157 aa  103  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.360947  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1058  hypothetical protein  47.13 
 
 
171 aa  96.3  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0222222  normal  0.0438439 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3565  hypothetical protein  56.72 
 
 
268 aa  92  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00347083  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1413  hypothetical protein  36.41 
 
 
205 aa  91.7  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149258  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2150  protein of unknown function DUF150  43.67 
 
 
179 aa  90.9  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1017  protein of unknown function DUF150  36.67 
 
 
177 aa  90.5  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1179  hypothetical protein  49.66 
 
 
308 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00453705  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1518  hypothetical protein  40.85 
 
 
170 aa  90.5  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190218  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1507  protein of unknown function DUF150  56.31 
 
 
186 aa  89  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.417111  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  39.69 
 
 
153 aa  87  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1208  protein of unknown function DUF150  43.6 
 
 
192 aa  86.7  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0220811  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1424  protein of unknown function DUF150  37.43 
 
 
222 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000944308 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  38.93 
 
 
153 aa  87.4  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23480  hypothetical protein  39.31 
 
 
181 aa  86.7  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0456205 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  32.68 
 
 
165 aa  85.9  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2311  hypothetical protein  39.19 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0442926  normal  0.0676785 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2062  hypothetical protein  38.96 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2079  hypothetical protein  38.96 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.727896  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2125  hypothetical protein  38.96 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0426445  normal  0.0108816 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12857  hypothetical protein  38.99 
 
 
183 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000766125  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1712  protein of unknown function DUF150  40.18 
 
 
190 aa  82  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1497  hypothetical protein  31.51 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0657507  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0357  hypothetical protein  30.14 
 
 
138 aa  79.7  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.215322  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  35.66 
 
 
161 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  35.92 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1048  hypothetical protein  31.11 
 
 
151 aa  78.6  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000120853  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  41.58 
 
 
159 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  32.86 
 
 
151 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  37.69 
 
 
161 aa  77.4  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4042  hypothetical protein  37.16 
 
 
178 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0029117  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0960  hypothetical protein  38 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  33.81 
 
 
158 aa  74.3  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3680  hypothetical protein  31.29 
 
 
152 aa  73.6  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000126023  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  37.76 
 
 
159 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11450  hypothetical protein  36.84 
 
 
160 aa  73.9  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0199556  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10290  hypothetical protein  37.93 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  31.91 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  41 
 
 
150 aa  72.4  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  37.84 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  31.39 
 
 
151 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  29.8 
 
 
151 aa  72  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  28.66 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  32.85 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  32.85 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  32.85 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  30.66 
 
 
151 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1205  protein of unknown function DUF150  30.46 
 
 
156 aa  71.2  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000854014  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  28.1 
 
 
152 aa  70.5  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0988  hypothetical protein  30.71 
 
 
165 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1961  hypothetical protein  27.56 
 
 
153 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00677493  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2203  protein of unknown function DUF150  41.25 
 
 
173 aa  70.5  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000153569  decreased coverage  0.000471354 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  30.94 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1649  hypothetical protein  28.57 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296961  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  30.66 
 
 
151 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  30.66 
 
 
151 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  29.8 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3391  hypothetical protein  38.89 
 
 
172 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000810372  hitchhiker  0.000625033 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1585  hypothetical protein  40 
 
 
159 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0279837  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0665  hypothetical protein  29.92 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00658224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  34.21 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  28.48 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  28.03 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  29.2 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  32.87 
 
 
154 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  32.46 
 
 
169 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0034  protein of unknown function DUF150  28.83 
 
 
160 aa  68.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.186641  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4492  hypothetical protein  34.21 
 
 
158 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126815  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  32.87 
 
 
154 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4182  hypothetical protein  33.33 
 
 
158 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1162  hypothetical protein  33.77 
 
 
204 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  32.46 
 
 
169 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  32.87 
 
 
154 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  32.87 
 
 
154 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1213  protein of unknown function DUF150  32.11 
 
 
170 aa  67  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2823  hypothetical protein  33.77 
 
 
204 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  35.58 
 
 
151 aa  67  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  32.14 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3282  hypothetical protein  30 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000111408  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  28.03 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  32.14 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  32.14 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  30 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  31.53 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  31.86 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3563  hypothetical protein  33.58 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.380474  hitchhiker  0.00000509959 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1126  hypothetical protein  30 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017917  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  32.14 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  32.14 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>